| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4979191 = | 51 (0.800) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 5.4% | coding (231/786 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG |
| ? | NC_002947 | 4979266 = | 58 (0.970) | coding (156/786 nt) | flgG | flagellar basal‑body rod protein FlgG | |||||
GGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAC > NC_002947/4979043‑4979337 | ggctctttgggtcgctaaaaccggcctgtccgctcaggacaccaacctgacggtcatttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctg > 5:140631‑M1/149‑149 (MQ=255)ggctctttgggtcgctaaaaccggcctgtccgctcaggacaccaacctgacggtcatttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctg > 7:342411‑M1/149‑149 (MQ=255) gCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGTCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTgg < 3:77232/148‑1 (MQ=255) ctctttgggtcgctaaaaccggcctgtccgctcaggacaccaacctgacggtcatttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGt > 2:97999‑M1/147‑149 (MQ=255) ccGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGt < 5:222314/149‑1 (MQ=255) tctttgggtcgctaaaaccggcctgtccgctcaggacaccaacctgacggtcatttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTg < 4:299193‑M1/4‑1 (MQ=255) cGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTg < 7:164114/149‑1 (MQ=255) tgggtcgctaaaaccggcctgtccgctcaggacaccaacctgacggtcatttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGcc > 4:220415‑M1/142‑147 (MQ=255) gggtcgctaaaaccggcctgtccgctcaggacaccaacctgacggtcatttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCa > 7:29805‑M1/141‑148 (MQ=255) gAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCCGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCTGCAACGAAGCTTTTCTGGCTGCCCAc > 4:245075/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGa > 6:358590/1‑148 (MQ=255) gAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCacac > 3:178445/1‑149 (MQ=255) gAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCacac < 5:358590/149‑1 (MQ=255) tCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGAc < 2:110603/149‑1 (MQ=255) gTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAg < 3:63192/149‑1 (MQ=255) tataCGACACGGTGCCGTCAGGCTGCAGGATCTGGATGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGGTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCAGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAgg > 3:108228/1‑149 (MQ=255) gatttggTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGa < 1:302361/144‑1 (MQ=255) cGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACAGCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCg < 4:131411/149‑1 (MQ=255) cGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCg > 2:341872/1‑149 (MQ=255) gTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGc > 2:283956/1‑149 (MQ=255) ttccaacaacctggccaacgtctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTcc < 5:324101‑M1/58‑1 (MQ=255) gCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTcc > 7:215886/1‑149 (MQ=255) gCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTgg < 8:183194/149‑1 (MQ=255) gCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTgg > 3:14856/1‑149 (MQ=255) cAGGATCTGGAAGTAACCGCGGCCGTTGAGTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGACAGCGAGCTGCCCTcgg < 4:153513/149‑1 (MQ=255) ggAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTgg > 2:129453/1‑149 (MQ=255) agaaACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCa > 8:19876/1‑149 (MQ=255) aCCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCGCACGATACGCACGCCGGTACCGACCTGCAGGCGCTAGGGCAGCTCGCTGGCCTGGGTCGACTGGGCGCCAg > 8:87995/1‑149 (MQ=255) aCCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCg > 4:161783/1‑124 (MQ=255) aCCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCg < 3:161783/124‑1 (MQ=255) tctcgaccaccggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAgg > 1:44903‑M1/72‑149 (MQ=255) cGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGgcgc < 5:171623/149‑1 (MQ=255) cGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGgcgc > 5:65625/1‑149 (MQ=255) cGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGGTGGCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCGGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGgcgc < 4:286063/149‑1 (MQ=255) ggcttcaagcgtgatcgcgccgaattcgcagacctgctctaccagatcaagcgccagcctGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGa > 6:324101‑M1/61‑149 (MQ=255) aCTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGAt < 4:262806/149‑1 (MQ=255) ccATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTgg < 8:215886/149‑1 (MQ=255) ccATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTgg > 5:32899/1‑149 (MQ=255) aTGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTa < 2:65059/149‑1 (MQ=255) tGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTgg > 7:224154/1‑146 (MQ=255) gTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTa > 1:388012/1‑147 (MQ=255) tCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGa > 1:139385/1‑92 (MQ=255) tCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGa < 2:139385/92‑1 (MQ=255) cAGCGGGTTGTCGGGGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑c < 3:245075/148‑1 (MQ=255) gCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAgg > 8:31978/1‑149 (MQ=255) gTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCg < 4:178445/148‑1 (MQ=255) tCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGaa > 8:244217/1‑149 (MQ=255) cGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAAt < 6:65625/149‑1 (MQ=255) tggtTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCtt > 2:350781/1‑121 (MQ=255) tggtTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCtt < 1:350781/121‑1 (MQ=255) gtTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGgc > 7:154300/1‑149 (MQ=255) gtTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATAAGCACACCGGTACCGAACTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACAAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCg > 7:115688/1‑147 (MQ=255) ttGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCGACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTGCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGGTGGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGgcgc > 8:108921/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGgcgc > 3:349236/1‑149 (MQ=255) tGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGgcgc < 2:388012/148‑1 (MQ=255) cGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCtt > 4:391756/1‑148 (MQ=255) ggCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAg < 6:366584/120‑1 (MQ=255) aaCGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGc > 3:299193/1‑149 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGc < 3:373541/120‑1 (MQ=255) gAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGc > 4:373541/1‑120 (MQ=255) aGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCggtg < 8:154300/149‑1 (MQ=255) cTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGCCCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCggtggt > 3:308746/1‑149 (MQ=255) cTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCggtggt < 6:32899/149‑1 (MQ=255) ttCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTc < 8:224154/147‑1 (MQ=255) tCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCga < 7:87995/148‑1 (MQ=255) tGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAc > 4:234175/1‑149 (MQ=255) GGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAGTCAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCgag > 1:283956‑M1/1‑146 (MQ=255) | GGCCGTCGGAGTTCAGGTGGAAGGTACCGTCACGGGTATACGACACGGTGCCGTCCGGCTGCAGGATCTGGAAGAAACCGCGGCCGTTGACTGCCATGTCCAGCGGGTTGTCGGTGGTTTGCAGGCTGCCGGCAACGAAGCTTTTCTGGGTGCCCACGATACGCACACCGGTACCGACCTGCAGGCCCGAGGGCAGCTCGCTGTCCTGGGTCGACTGGGCACCAGGCTGGCGCTTGATCTGGTAGAG‑CAGGTCTGCGAATTCGGCGCGATCACGCTTGAAGCCGGTGGTCGAGAC > NC_002947/4979043‑4979337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |