| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5045679 | 34 (0.540) | 18 (0.290) | 18/262 | NT | 35.0% | intergenic (‑46/+47) | PP_4449/PP_5682 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 5222582 = | NA (NA) | coding (8/840 nt) | PP_4602 | AraC family transcriptional regulator | |||||
TCCTCCGCGCTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGCCATCAGCCCCAATCGCTCAAGTTCAAT > NC_002947/5045539‑5045827 | tcctccGCGCTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATg > 6:290886/1‑147 (MQ=255) gtccgCGGTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAAAGGGCTTCAGCGCCATTTCAATTACCAGCTCCTTGTCCAAGTGCTCCTCAACTAAAGCGATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaa < 8:355740‑M1/147‑10 (MQ=255) ctccGCGCTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAg < 1:392137/148‑1 (MQ=255) tccGCGCTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGAATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATTAAGCt > 8:254151/1‑149 (MQ=255) cgcgCTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTg > 6:400063/1‑148 (MQ=255) gcgcTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaa < 3:92681‑M1/149‑15 (MQ=255) gcgcTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaa > 2:31645‑M1/1‑135 (MQ=255) cgcTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGaa > 6:52168/1‑148 (MQ=255) tttGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCTAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataa < 3:81468‑M1/148‑20 (MQ=255) gtattcggcggctgacctacccggatcagtcggcgaatgcttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTg < 4:389968‑M1/22‑1 (MQ=255) cggcggctgacctacccggatcagtcggcgaatgcttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAg < 2:213495‑M1/27‑1 (MQ=255) aTGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttcttt > 2:329308‑M1/1‑117 (MQ=255) cTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtc < 8:50498‑M1/114‑3 (MQ=255) cTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtc > 7:50498‑M1/1‑112 (MQ=255) cctacccggatcagtcggcgaatgcttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGTAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCaa > 1:221390‑M1/113‑149 (MQ=255) cATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaac < 1:31645‑M1/149‑47 (MQ=255) aTCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGc < 5:400063/149‑1 (MQ=255) atcagtcggcgaatgcttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTcaca > 1:213495‑M1/104‑149 (MQ=255) gtcggcgaatgcttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGc < 3:183476‑M1/49‑1 (MQ=255) gtcggcgaatgcttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAACCCTTCACATGc < 3:359448‑M1/49‑1 (MQ=255) ccTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgc > 6:34112‑M1/1‑95 (MQ=255) gcgaatgcttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAAt < 7:74049‑M1/53‑1 (MQ=255) atgcttttctagatctcgatgtcagtgaagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAg > 7:168116‑M1/92‑147 (MQ=255) aaTTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGACCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTc > 4:283255/1‑149 (MQ=255) tgcttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTa > 4:183476‑M1/91‑149 (MQ=255) aTTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCg > 1:239880/1‑149 (MQ=255) ttttctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagccaggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCt < 8:206048‑M1/62‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCtt < 3:330165/124‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCtt > 4:330165/1‑124 (MQ=255) cccGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatgg < 7:188993‑M1/148‑66 (MQ=255) ccGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAggg > 6:228559/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCTTGACCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatggcg < 6:118219‑M1/149‑68 (MQ=255) gcgcCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGgc < 5:52168/149‑1 (MQ=255) ctagatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAACCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCg < 5:271166‑M1/64‑1 (MQ=255) gatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAggg > 8:74049‑M1/81‑149 (MQ=255) gatctcgatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAggg > 3:389968‑M1/81‑149 (MQ=255) cTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatggcggcgaag > 1:95500‑M1/1‑76 (MQ=255) gTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGa < 6:255196/137‑1 (MQ=255) gTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGa > 5:255196/1‑137 (MQ=255) tCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTACTTGTGAGTTGAATTCTG‑‑‑‑A‑GCCTTCACGTAGCCAGTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTATCAAGACTTCACATGCTAATGCTCTACCTAGGAGTGGCCGCCAAtt > 7:367384/1‑149 (MQ=255) gatgtcagtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAACCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGgccgc > 6:271166‑M1/75‑148 (MQ=255) cAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAggg > 7:206439/1‑137 (MQ=255) cAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAggg < 8:206439/137‑1 (MQ=255) cAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTg < 5:228559/148‑1 (MQ=255) aGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGccc < 5:290886/149‑1 (MQ=255) agtgcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTg > 2:334584‑M1/69‑148 (MQ=255) cTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatggcggcgaagtgttcactcttc > 4:161780‑M1/1‑64 (MQ=255) gcagatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGccc < 6:215338‑M1/83‑1 (MQ=255) cagatctcacctcatgctcatcctgttagctgtgcgacagcgcagcacggaagggctgggtgatAACTCAAGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATCAGCAACCTCGGAGGCGCCTCCCATTCCCCt < 5:46904‑M1/84‑1 (MQ=255) agatctgacgtcatgcgcatcctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCt < 3:160999‑M1/84‑1 (MQ=255) aaCTAAATCCATGACATTCGTCCATTTGCCTTGAATTGTGTTCTACCCCATCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatggcggcgaagtgttcactcttc < 1:329308‑M1/148‑86 (MQ=255) aaCTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatggcggcgaagtgttcactcttctatac > 7:138626‑M1/1‑58 (MQ=255) tAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTAAt > 4:304103/1‑148 (MQ=255) acgtcatgcgcaccctgtttgctgtgcgacagcgcagccctgaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGACACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGTGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTg > 6:71516‑M1/57‑146 (MQ=255) 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ttCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGt > 7:204884/1‑132 (MQ=255) ttCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGt < 8:204884/132‑1 (MQ=255) gTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatggcggcgaagtgttcactcttctatacgtggtcacagcaagctgtgc < 3:161780‑M1/149‑111 (MQ=255) ctgtttgctgtgcgacagcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACGTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGTTAATCAGTAACTGCt > 5:220120‑M1/43‑148 (MQ=255) ttGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTATTCAGTAAATGCTTTGAAGCGGt > 8:370189/1‑149 (MQ=255) 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7:273706/1‑82 (MQ=255) ttGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAg < 8:273706/82‑1 (MQ=255) ttGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatggcggcgaagtgttcactcttctatacgtggtcacagcaagctgtgccgacagggattaacgc > 1:371755‑M1/1‑23 (MQ=255) ttGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGCCAt > 6:342367/1‑147 (MQ=255) agcgcagcccggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAACCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGc > 4:359448‑M1/27‑149 (MQ=255) ggaagggctgggtgatCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCAAAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGCCATCAGccc < 3:162452‑M1/132‑1 (MQ=255) ttggtgatCTCTCATGTAGATGTAAACGTGCATAGCCTCTCTCAAGCCTTCACTTGCTAATTAGCTACCTCGGAGGGGGCGCCGTTTGCCCTAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGCCATCAGCCCCAATCGCTc > 6:46904‑M1/9‑149 (MQ=255) ggTAGCCCCTtctatcaaacaaaagataacccactgttctttctagcgaaaaaaacaggcgcgcggggtcaatggcggcgaagtgttcactcttctatacgtggtcacagcaagctgtgccgacagggattaacgccgatgccatttgg < 2:95500‑M1/149‑140 (MQ=255) gTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATACCCACTCTCAAGCCTTCACAAGCAAATCACCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAACCAGGTAATCAGTAACTCCTTGGAACCGCTGCACAGCCATCAGCCCCAAACGCTc > 3:150354/1‑148 (MQ=255) cccTCTCATTAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCATAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGCCATCAGCCCCAATCGCTCAAGtt < 7:254151/148‑1 (MQ=255) atCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGCCATCAGCCCCAATCGCTCAAGtt < 4:36832‑M1/146‑1 (MQ=255) TCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGCCATCAGCCCCAATCGCTCAAGTTCAAt < 3:44249‑M1/149‑1 (MQ=255) | TCCTCCGCGCTTTTTGCTGAGCTGATGTCCTTAATGCGCATCAGCGCCTTTTCAATTACCCGCGCCTTGTCCAAGTGCTCGTCAACTAAAGCCATGACATTCGTCCTTGTGCGTTGAATTGTG‑‑‑‑A‑GCCTTCAGGTAGCCCCTCTCATGAAGCTGAAAACGTGCATAGCCACTCTCAAGCCTTCACATGCTAATGAGCTACCTCGGAGGGGCCGCCCATTGCCCTAAGCTGGTAATCAGTAACTGCTTGGAAGCGGTGCTCAGCCATCAGCCCCAATCGCTCAAGTTCAAT > NC_002947/5045539‑5045827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |