New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2668377 = | 48 (0.760) | 3 (0.050) | 3/256 | NT | 5.4% | coding (229/1485 nt) | prpD | 2‑methylcitrate dehydratase |
? | NC_002947 | 2668425 = | 59 (0.970) | coding (277/1485 nt) | prpD | 2‑methylcitrate dehydratase |
GGACACCCTCGGTTGCGGCCTTCTCGCCTTGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGAT > NC_002947/2668277‑2668573 | ggACACCCTCGGTTGCGGCCTTCTCGCCTTGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACa > 5:344600/1‑149 (MQ=255) agccactgccaggatgacgccaaggttgtccgaggtatgagcccattcggcggccagccaggtgtcgttgtagtccagccagcgcaccgtgcagccaatGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑t > 6:395064‑M1/100‑149 (MQ=255) ccTCGGTTGCGGCCTTCTCGCCTTGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCt > 4:142096/1‑149 (MQ=255) tCGGTTGCGGCCTTCTCGCCTTGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCAGGGACA‑TTGGCTg > 5:52198/1‑148 (MQ=255) gCGGCCTTCTCGCCTTGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGt < 4:327558/148‑1 (MQ=255) ccTTCTCGCCTTGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCgct > 7:135548/1‑149 (MQ=255) ttCTCGCCTTGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCgctgg > 4:164843/1‑149 (MQ=255) ctcGCCTTCCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCgctgg < 8:135548/147‑1 (MQ=255) ttGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGTCCCGGTCAAGTCTGACTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGATTGACTa > 6:300539/1‑149 (MQ=255) ttGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTa > 4:389647/1‑149 (MQ=255) gcTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAAc < 4:91552/149‑1 (MQ=255) cTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAAc > 8:210513/1‑148 (MQ=255) cTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACg > 7:84530/1‑149 (MQ=255) cTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACg > 5:138669/1‑149 (MQ=255) aGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACct < 3:142096/147‑1 (MQ=255) aCCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACAcc > 2:264900/1‑141 (MQ=255) aCCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACAcc < 1:264900/141‑1 (MQ=255) cAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGgccg > 4:147219/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGa < 1:50510/119‑1 (MQ=255) cTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGa > 2:50510/1‑119 (MQ=255) cTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATg > 3:137712/1‑149 (MQ=255) ggCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATggg < 1:1985/148‑1 (MQ=255) gCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGc < 6:344600/148‑1 (MQ=255) cccAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGCCTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCAt > 5:221369/1‑149 (MQ=255) cccAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGAACCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGATGGCCGCCGATTGGGATCAt > 3:158648/1‑149 (MQ=255) aGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGTCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATc > 1:251330/1‑148 (MQ=255) ggTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTCCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCt > 1:220912/1‑149 (MQ=255) ggAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCg > 5:162859/1‑148 (MQ=255) gAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGa > 3:114586/1‑149 (MQ=255) gAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGa > 7:281439/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCt > 5:47341/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTg > 8:246694/1‑149 (MQ=255) gTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTggc < 8:84530/147‑1 (MQ=255) gTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTggc < 3:389647/147‑1 (MQ=255) tCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTggcgg > 3:54431/1‑148 (MQ=255) ccGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCa < 7:64182/148‑1 (MQ=255) gAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATcc > 3:207010/1‑149 (MQ=255) tGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTgg < 3:147219/149‑1 (MQ=255) cTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGt < 2:220912/148‑1 (MQ=255) g‑cgTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCt < 4:137712/149‑1 (MQ=255) g‑cgTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCt > 3:59185/1‑149 (MQ=255) atgtcccaggcagccttgaccgggtcgaggcgataggaggtgccggggacA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATACCTCGGACAACCTTGGCGTCATCCTGGCAGTGGCt > 6:395064‑M2/51‑149 (MQ=255) GTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGa < 1:339259‑M1/149‑1 (MQ=255) cccaggcagccttgaccgggtcgaggcgataggaggtgccggggacA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGac > 5:254992‑M2/47‑148 (MQ=255) CCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACAGTTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAgtggcttttca < 1:80314‑M1/149‑6 (MQ=255) cGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGaccacc < 3:164843/149‑1 (MQ=255) ggcagccttgaccgggtcgaggcgataggaggtgccggggacA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCt > 6:119465‑M2/43‑149 (MQ=255) ggCAACTCCTATAGCCTCCCCCCCGTCAACGCCTCCCGGGACC‑TTGGCCGCACGGTGCGCCGGCTGGACTACCACGACACCTTGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCATGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCt < 4:158648/149‑1 (MQ=255) aCCTCCTATAGCCTCGAGCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGAGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGATGCCCACCTGt > 2:237754/1‑148 (MQ=255) tcctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATggg < 1:74430/94‑1 (MQ=255) tcctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATggg > 2:74430/1‑94 (MQ=255) ctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTcaca < 6:162859/147‑1 (MQ=255) aTCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGc < 3:151411/91‑1 (MQ=255) aTCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGc > 4:151411/1‑91 (MQ=255) tCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGaaa < 2:339259/148‑1 (MQ=255) gCCTCGAGCCGGTCAAGGCTGCCTGTGACT‑TTGGCTGGACGGTGCGCTGGATGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCGGAATGGGCTGATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACgg < 4:114586/149‑1 (MQ=255) gCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACgg > 5:308965/1‑149 (MQ=255) gCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACgg < 6:138669/149‑1 (MQ=255) ccTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACggg < 6:308965/149‑1 (MQ=255) cTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATg > 4:150594/1‑83 (MQ=255) cTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATg < 3:150594/83‑1 (MQ=255) gACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGtt < 2:251330/147‑1 (MQ=255) ccGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCcgc > 3:122168/1‑149 (MQ=255) ggTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCgg < 4:59185/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGaa > 6:163292/1‑148 (MQ=255) gCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGGACGGTGCGCTGGGTGGACTTCAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTGATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGTCTGACCACCTGTCTCAGAAACGGTTTGCCGCGGGTGaata < 6:52198/149‑3 (MQ=255) tGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAAT‑GGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCAACTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActg > 8:228881/1‑149 (MQ=255) ggacA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgc < 4:207010‑M2/145‑1 (MQ=255) a‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGAt < 8:281439/149‑1 (MQ=255) | GGACACCCTCGGTTGCGGCCTTCTCGCCTTGCGCTTCCCTGAGTGCACCAAGCTCCTTGGCCCCCAGGTGGAAGGCACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCG‑CGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACA‑TTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGAT > NC_002947/2668277‑2668573 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |