New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3475318 | 56 (0.880) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.4% | coding (1395/2517 nt) | PP_3087 | excinuclease ABC subunit A |
? | NC_002947 | = 3475352 | 52 (0.860) | coding (1361/2517 nt) | PP_3087 | excinuclease ABC subunit A |
GATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAA > NC_002947/3475204‑3475494 | gATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGtt > 6:297742/1‑149 (MQ=255) aTGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTc > 1:94568‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGGTGCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCCCCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTcg < 1:112101‑M2/149‑3 (MQ=255) cTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTcgccg < 2:77019‑M2/149‑6 (MQ=255) cTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACATCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTcgccg < 3:166559‑M2/149‑6 (MQ=255) ttCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTcgccgg < 7:240854‑M2/149‑7 (MQ=255) ttCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTcgcc < 5:94528‑M2/147‑5 (MQ=255) ttCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTcgcc > 6:94528‑M2/1‑143 (MQ=255) aGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGc < 8:90620/149‑1 (MQ=255) ccccgCCAGGCCCGCGACTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCggg > 6:216246/5‑149 (MQ=255) aGCCAGTCGCGGGCCTGGCGGGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGc < 4:218679/148‑1 (MQ=255) aGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGccc < 6:393693/149‑1 (MQ=255) gCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCAGTAGAGGATGGTGCCGCCGTCTTCGCCGGCAGCGGGccc > 7:137686/1‑148 (MQ=255) gCCAGGCCCGCGACTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACATGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGccc > 2:78138/1‑148 (MQ=255) ccAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTa > 6:268289/1‑149 (MQ=255) ccAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTa > 4:99873/1‑149 (MQ=255) cAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCGTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTa > 8:6197/1‑148 (MQ=255) cAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTAc < 5:210634/149‑1 (MQ=255) aGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACa > 4:337534/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATcc < 5:268289/149‑1 (MQ=255) gcgGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATcc < 8:240854/148‑1 (MQ=255) c‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTc < 3:301312/149‑1 (MQ=255) gggggCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTcgg > 6:327202/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACGGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTcggcgcg > 1:293981/1‑149 (MQ=255) gcgTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTcggcgcggc > 6:86731/1‑149 (MQ=255) cTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGgtgt > 3:4414/1‑149 (MQ=255) cTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGgtgt > 4:254352/1‑149 (MQ=255) cTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGgtgt > 6:109449/1‑149 (MQ=255) cTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGGAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGgtgt > 5:327369/1‑149 (MQ=255) tACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTc > 5:298547/1‑147 (MQ=255) ccGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTTCATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAg < 1:77019/148‑1 (MQ=255) ccGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAgg > 5:351746/1‑149 (MQ=255) ggg‑gCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTc < 5:216246/149‑1 (MQ=255) cATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGc < 6:351746/149‑1 (MQ=255) gAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTcc < 1:351000/148‑1 (MQ=255) accggtaggtGCGGGTGCATGACTGTGGCACAGGGGCCTGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACCTCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTccacc < 8:137686/146‑1 (MQ=255) aggtaggtGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCACCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCcaccac > 3:315123/1‑149 (MQ=255) taggtGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTa < 4:166559/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACAcc > 4:7137/1‑148 (MQ=255) aTGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGc > 5:156791/1‑147 (MQ=255) cTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTcca > 3:280103/1‑125 (MQ=255) cTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTcca < 4:280103/125‑1 (MQ=255) aCCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCACCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAg < 4:315123/149‑1 (MQ=255) ccTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCAGCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAgg < 4:4414/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGgc < 3:99873/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGCGCCGCCGTGTTcgccggcctggccgaggtgcaacagtcatgcacccgcacctacctgttcgatgccccggtacaggccacacgcgccccccgccaggcccgcgactggctgaag < 2:193230‑M2/149‑104 (MQ=255) ccAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGCGCCGCCGTGTTcgccggcctggccgaggtgcaacagtcatgcacccgcacctacctgttcgatgccccggtacaggccacacgcgccccccgccaggcccgcgactggctgaagc > 1:193230‑M2/1‑45 (MQ=255) gggcCGGCGGGGGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGGGTTcgccggcctggccgaggtgcaacagtcatgcacccgcacctacctgttcgatgccccggtacaggccacacgcgccccccgcc > 2:295860‑M2/2‑43 (MQ=255) ccGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGc < 5:297742/149‑1 (MQ=255) cggcggGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCt > 7:23540/1‑149 (MQ=255) ggcgggcgGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGgcgc > 3:366448/1‑139 (MQ=255) ggcgggcgGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGgcgc < 4:366448/139‑1 (MQ=255) ggcgggcgGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCtt > 8:191106/1‑149 (MQ=255) ggcggcCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGaa < 6:298547/149‑1 (MQ=255) gcCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAgc < 5:109449/149‑1 (MQ=255) cTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTc < 1:78138/149‑1 (MQ=255) tAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCa < 3:254352/147‑1 (MQ=255) tAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCa < 2:112101/147‑1 (MQ=255) gATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCgg < 7:6197/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGc < 7:336066/149‑1 (MQ=255) cgccgTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAg > 7:135750/1‑127 (MQ=255) cgccgTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAg < 8:135750/127‑1 (MQ=255) cgccgTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTg > 2:223886/1‑148 (MQ=255) ccgTGTTCGCCGGCCGCGGCCCCTCCCCCCACCCGCCCGCGGGCGCGCCCCATGGGGTCCCGGTCTGGCCCCACCACGTACACCTAGTCGCCTGCCTGTTTCCGGCGCTGCTGGGCTTCCAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTCCac < 8:282559/149‑2 (MQ=255) | GATGCCTTCAAGCTTCAGCCAGTCGCGGGCCTGGC‑GGGGGGCGCGTGTGGCCTGTACCGGG‑GCATCGAACAGGTAGGTGCGGGTGCATGACTGTTGCACCTCGGCCAGGCCGGCGGGCGGCCCGCTGTAGAGGATGGTGCCGCCGTGTTCGCCGGCAGCGGGCCCTACATCCACCAGCCAGTCGGCGCGGCGCATGGTGTCCAGGTCATGCTCCACCACGTACACCGAGTTGCCAGCCTGTTTCAGGCGCTGCAGGGCTTCGAACAGCGCTTCACTGTCGGCCGGGTGCAA > NC_002947/3475204‑3475494 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |