New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4297999 | 73 (1.150) | 4 (0.070) | 4/254 | NT | 5.7% | coding (55/822 nt) | PP_3768 | shikimate 5‑dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4298031 | 63 (1.040) | coding (23/822 nt) | PP_3768 | shikimate 5‑dehydrogenase |
GCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGG > NC_002947/4297886‑4298179 | gcgGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTccc < 6:216558‑M2/149‑4 (MQ=255) cgGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCTCGGTGTcccg < 7:298746‑M2/149‑5 (MQ=255) tCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTg < 5:216558/149‑1 (MQ=255) ccagCCACCGCCGCCGGCAGGTCCTCGGTGCGCATGGCCTTGTACTAGAAGTCCACGCCCAACTGCGGGTACAGGTGGGTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTgg < 4:115017/145‑1 (MQ=255) ccTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTGTCCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTg < 1:80374/148‑1 (MQ=255) ccTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTgg < 2:330239/148‑1 (MQ=255) cTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGa < 3:173329/149‑1 (MQ=255) cTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGa < 5:297460/149‑1 (MQ=255) gCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACAGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTgggta > 8:314644/1‑146 (MQ=255) aCCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGt > 1:196540/1‑149 (MQ=255) gccgccgGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTCGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCTAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCgg < 1:34909/149‑1 (MQ=255) gccgGCAGGTCATCGGTGCGCATGACCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCAt < 4:245107/149‑1 (MQ=255) gCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACa < 2:244164/149‑1 (MQ=255) gTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCt > 5:221183/1‑149 (MQ=255) agggtCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGc < 4:352163/144‑1 (MQ=255) aTCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCt > 3:195448/1‑149 (MQ=255) ggTGCGCATGGCCTTGTAGTAGTAGTCCAGGCCCATCTGCTGGTTAAGGTGGTTGTGAATGCGCAGGGCGAAGGTG‑GCGGGGCGACCGGCCAGAGATATGCAAAGCTCGGTGTGCCGGCTGGTAGTTGACTGCATAACAGGCTCCTTgg < 5:290103/149‑1 (MQ=255) tGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAACCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGCGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCTCGGTGTCCCTGCTGGGATTTGTCGGCATAACTGGCTCCTTGGTc < 4:246504/149‑1 (MQ=255) cATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCGGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGGCGGCATAACAGGCGCCGTGGTCATgc > 4:255398/1‑148 (MQ=255) aTGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGAc > 8:127599/1‑149 (MQ=255) cTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGCTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGaa > 1:155055/1‑148 (MQ=255) ttGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAAc > 3:18131/1‑149 (MQ=255) gtagtaGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAAc < 4:91627/147‑1 (MQ=255) gtagtaGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGt > 7:123141/1‑149 (MQ=255) tagtagAAGTCCAGGCCCATCTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGtt < 6:319086/149‑1 (MQ=255) tagtagAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCTCGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGtt < 8:298746/149‑1 (MQ=255) tagtagAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGtt < 2:344629/149‑1 (MQ=255) agAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTAt < 6:221183/148‑1 (MQ=255) gAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTAtt < 7:127599/148‑1 (MQ=255) aaGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGa > 8:130400/1‑133 (MQ=255) aaGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGa < 7:130400/133‑1 (MQ=255) gTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGc < 8:123141/149‑1 (MQ=255) gCCCAACTTCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACa < 8:100158/149‑1 (MQ=255) gCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGa < 7:213787/94‑1 (MQ=255) gCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGa > 8:213787/1‑94 (MQ=255) gCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAAGAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTaa > 5:332828/1‑147 (MQ=255) gCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGc > 8:245478/1‑143 (MQ=255) gCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGc < 7:245478/143‑1 (MQ=255) gCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACa < 1:66657/149‑1 (MQ=255) ccAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACaga < 8:352021/149‑1 (MQ=255) ccAACTACTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACa > 2:167616/1‑147 (MQ=255) aaCTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGACATGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGt > 5:126003/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAATGTG‑GCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCa < 7:115752/149‑1 (MQ=255) ctgGTACAGGTGGTTTTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGc > 1:369358/1‑148 (MQ=255) ctgGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGc < 3:12306/148‑1 (MQ=255) 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gAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTaca > 6:312103/1‑149 (MQ=255) aaaGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTaca > 1:237240/1‑148 (MQ=255) aaaGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTAGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTaca > 1:292219/1‑148 (MQ=255) aGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTGCGTTACCCaa > 2:372619/1‑149 (MQ=255) gcACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCt > 4:14094/1‑149 (MQ=255) gcACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCt > 2:325493/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTcccggcaccttcggcgtgcgctttcacaaccacctgtaccagcagttgggcctggacttctactacaaggccatgcgcaccgatgacctgccggcggcggtg < 5:309584‑M2/149‑103 (MQ=255) aGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTcccggcaccttcggcgtgcgctttcacaaccacctgtaccagcagttgggcctggacttctactacaaggccatgcgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagg < 1:340307‑M2/149‑108 (MQ=255) tG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTcccc > 5:12208/1‑149 (MQ=255) g‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTc > 7:144766/1‑145 (MQ=255) g‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTc < 8:144766/145‑1 (MQ=255) cGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTcccggcaccttcggcgtgcgctttcacaaccacctgtaccagcagttgggcctggacttctactacaaggccatgcgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccg < 6:77638‑M2/149‑114 (MQ=255) cGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCtgt < 6:12208/149‑1 (MQ=255) ccGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTcccggcaccttcggcgtgcgctttcacaaccacctgtaccagcagttgggcctggacttctactacaaggccatgcgcaccgatgacctgccggcggcggtggcagggatccgcgccctgg > 5:77638‑M2/1‑28 (MQ=255) ggCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGa < 3:13627/149‑1 (MQ=255) gCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGAc < 5:312103/149‑1 (MQ=255) agagaTGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTGCCGTTACCCTGTGCTCAGCTGACAGAgg > 3:270560/1‑149 (MQ=255) agagaTGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAgg > 3:317833/1‑149 (MQ=255) gaTGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCg < 6:332828/149‑1 (MQ=255) aTGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTGTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACAGGTCGTCCCTTACACACACTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGCCAGAGGCCg > 8:223396/1‑148 (MQ=255) tGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCg > 1:103245/1‑147 (MQ=255) tGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGa < 4:195448/149‑1 (MQ=255) gCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAg > 1:133309/1‑149 (MQ=255) gCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAg > 3:61306/1‑149 (MQ=255) aaaGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTAAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCTGCTGACTGTGGCCGGAGt > 7:257783/1‑148 (MQ=255) aaGCACCGTGTCCCGGCTTGGAGTTTGCGGCATAACAGGCTCCTTTGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCa < 8:257783/149‑1 (MQ=255) gCACGGTGTCCCGGCTGGTAGATGTAGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATa < 2:292219/149‑1 (MQ=255) gCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATa > 3:283354/1‑149 (MQ=255) tCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAgg < 4:18131/149‑1 (MQ=255) | GCGGATCCCTGCCACCGCCGCCGGCAGGTCATCGGTGCGCATGGCCTTGTAGTAGAAGTCCAGGCCCAACTGCTGGTACAGGTGGTTGTGAAAGCGCACGCCGAAGGTG‑CCGGGGCGACCGGCCAGAGAGATGCAAAGCACGGTGTCCCGGCTGGGAGTTGTCGGCATAACAGGCTCCTTGGTCATGACTGAAACGTTTATTCAGCGTAACAGAGTCAGCCACTGGTCGTCCCTTACACAACCTTTACCGTTCCCCTGTGCTCAGCTGACAGAGGCCGGAGTCATAGTAACAGG > NC_002947/4297886‑4298179 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |