New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5472435 = | 76 (1.200) | 4 (0.060) | 4/258 | NT | 5.9% | coding (5/519 nt) coding (384/420 nt) |
rlmH rsfS |
23S rRNA (pseudouridine(1915)‑N(3))‑methyltransferase RlmH ribosomal silencing factor RsfS |
? | NC_002947 | 5472494 = | 53 (0.860) | coding (325/420 nt) | rsfS | ribosomal silencing factor RsfS |
ACTTCGGCATGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCTTGGCCTTGACTGCTTCACG > NC_002947/5472346‑5472638 | cagcgactgggtgctgctggacctgaacgacgtcatcgtgcacatgatgaccgccgctgcccgccagttctacgaccttgagcgtctgtGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCca > 4:310598‑M1/90‑149 (MQ=255) aCTTCGGCATGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCca < 7:295377/149‑1 (MQ=255) aCTTCGGCATGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCca < 7:136789/149‑1 (MQ=255) aCTTCGGCAGGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCca < 8:333177/149‑1 (MQ=255) ttCGGCATGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCcaca > 8:240831/1‑149 (MQ=255) ttCGGCATGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCAGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCca > 6:368801/1‑147 (MQ=255) gCATGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACg > 6:318023/1‑149 (MQ=255) aTGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCt < 4:240065/149‑1 (MQ=255) tgctggacctgaacgacgtcatcgtgcacatgatgaccgccgctgcccgccagttctacgaccttgagcgtctgtGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAg < 3:36489‑M1/63‑1 (MQ=255) tgctggacctgaacgacgtcatcgtgcacatgatgaccgccgctgcccgccagttctacgaccttgagcgtctgtGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAg > 4:36489‑M1/76‑138 (MQ=255) aGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTc < 5:374715/149‑1 (MQ=255) cGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTa < 1:41133/149‑1 (MQ=255) cGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTa < 5:318023/149‑1 (MQ=255) cGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCATATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTa < 6:42507/149‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCa < 3:63340/134‑1 (MQ=255) aaTCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCa > 4:63340/1‑134 (MQ=255) tCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCg > 4:184146/1‑149 (MQ=255) ggCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTCGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCggg > 4:87384/1‑148 (MQ=255) gcgcAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCa < 3:33554/149‑1 (MQ=255) cgcAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAg < 7:176154/149‑1 (MQ=255) cgcAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTC‑TTGAGCTTGTCGGAGTACTAGTGGGCATGGTGCGGGGGGTGGTGGTTGGCATCGGCGGCACGGCGTTGGTAGGGACCCTGCCACAGCCGCTGAAGGTCGTAGCACTGGCGGGGAgc > 2:180996/1‑149 (MQ=255) aCGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAgcggcg > 3:110151/1‑149 (MQ=255) aCGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAgcggcg < 1:317901/149‑1 (MQ=255) aCGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCACAAGGACGTAGAAAAGGCGGGCAgcggcg > 8:57676/1‑149 (MQ=255) gCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGGCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGt > 5:332860/1‑149 (MQ=255) gCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGACTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGt > 3:182238/1‑149 (MQ=255) acaGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGtca < 7:240831/149‑1 (MQ=255) acaGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGtca > 2:248800/1‑149 (MQ=255) caGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTCGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGtcat < 3:87384/149‑1 (MQ=255) aTTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGa < 1:248800/147‑1 (MQ=255) aTTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGAt < 1:357590/148‑1 (MQ=255) aTTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCAGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGAt < 5:368801/148‑1 (MQ=255) ttCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATg < 6:326510/148‑1 (MQ=255) ttCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGa < 3:217610/149‑1 (MQ=255) tCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGtt < 6:185057/149‑1 (MQ=255) tttGAGCTTGTAGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGTAGGCACGGCTTTGATCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGtt > 7:359433/1‑147 (MQ=255) tGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGTCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTc < 1:258544/146‑1 (MQ=255) tGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCa < 7:57676/147‑1 (MQ=255) tGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGACTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTc < 4:182238/146‑1 (MQ=255) gAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGAt > 6:295967/1‑135 (MQ=255) cTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTc > 8:12294/1‑147 (MQ=255) gTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCcag > 4:33109/1‑147 (MQ=255) aGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCAcc < 2:274879/149‑1 (MQ=255) tCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGtcatc < 6:240712/108‑1 (MQ=255) ctgtggcagggtgccgagcaaagccgtgccgccgatggcaagcaccacagcccggaccatgccACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCcagca < 3:36489‑M2/75‑1 (MQ=255) ctgtggcagggtgccgagcaaagccgtgccgccgatggcaagcaccacagcccggaccatgccACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCcagca > 4:36489‑M2/64‑138 (MQ=255) tGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCt < 1:180996/149‑1 (MQ=255) tggcagggtgccgagcaaagccgtgccgccgatggcaagcaccacagcccggaccatgccACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTg > 4:310598‑M2/61‑149 (MQ=255) gTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCt > 7:350049/1‑149 (MQ=255) gTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCt < 2:380693/149‑1 (MQ=255) tCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCcag > 4:145689/1‑125 (MQ=255) tCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCcag < 3:145689/125‑1 (MQ=255) gtgCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAg > 6:397740/1‑124 (MQ=255) gtgCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAg < 5:397740/124‑1 (MQ=255) gCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCcttctt < 4:120377/144‑1 (MQ=255) gCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCcttctt > 3:120377/1‑144 (MQ=255) cTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGtt < 2:309116/102‑1 (MQ=255) cTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGtt > 1:309116/1‑102 (MQ=255) ggcggcACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTgg < 8:350049/148‑1 (MQ=255) tggcaagcaccacagcccggaccatgccACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGgc < 3:310598‑M2/121‑1 (MQ=255) aCGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCt > 5:329968/1‑149 (MQ=255) tttGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGCCATCATGTGCACGa > 8:230083/1‑72 (MQ=255) tttGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGCCATCATGTGCACGa < 7:230083/72‑1 (MQ=255) cTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCTTGGCCTTGa < 6:332860/149‑1 (MQ=255) cTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCTTGGCCTTGa > 5:217026/1‑149 (MQ=255) acggcaccatgccACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGCTCATCATGTGCACGATCACGTCCTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACACAGTGGCTGGGCGCCCTAGGCATTGAc > 4:85875‑M2/14‑149 (MQ=255) cACCCTGCCACAGTCTCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCGAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCTTGGCCTTGACTGCt < 3:85875/149‑1 (MQ=255) cccTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCTTGGCCTTGACTGCTTc < 7:12294/149‑1 (MQ=255) cTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTc < 6:175978/96‑1 (MQ=255) cTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTc > 5:175978/1‑96 (MQ=255) cTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCTTGGCCTTGACTGCTTCAc < 3:33109/149‑1 (MQ=255) tgccACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCTTGGCCTTGACTGCTTCACg > 3:216294‑M2/5‑149 (MQ=255) | ACTTCGGCATGCGCGAGCCGACCGCAATCAGGCGCAGACGCACAGCGCTTTCCTTATTCGCGGTCTTTGAGCTTGTCGGAGTACTCGTGGGCATGGTCCGGGCTGTGGTGCTTGCCATCGGCGGCACGGCTTTGCTCGGCACCCTGCCACAGACGCTCAAGGTCGTAGAACTGGCGGGCAGCGGCGGTCATCATGTGCACGATGACGTCGTTCAGGTCCAGCAGCACCCAGTCGCTGTCGCCCTTGCCTTCTTCACCCAGTGGCTGGGCGCCCTTGGCCTTGACTGCTTCACG > NC_002947/5472346‑5472638 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |