New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 62692 | 34 (0.810) | 3 (0.080) | 3/242 | NT | 7.6% | coding (937/1269 nt) | PP_0053 | sulfide:quinone oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 62746 | 41 (1.040) | coding (991/1269 nt) | PP_0053 | sulfide:quinone oxidoreductase |
ACGTGGTACCGCCACAGGTGGCGCCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTG > NC_002947/62546‑62838 | aCGTGGTACCGCCACAGGTGGCGCCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAAt < 3:201125/149‑1 (MQ=255) tGGTACCGCCACAGGTGGCGCCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGc > 1:8495/1‑148 (MQ=255) tGGTACCGCCACAGGTGGCGCCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGc > 3:30625/1‑148 (MQ=255) gTACCGCCACAGGTGGCGCCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCaa < 1:270240/149‑1 (MQ=255) gCCACAGGTGGCGCCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGAccg > 5:136438/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTgcggc > 6:215789/1‑149 (MQ=255) cgcCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTgcggcg > 5:239845/1‑149 (MQ=255) cATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAcattgttggcgaccaccggtgcctgcttgcgcg > 3:28338‑M1/1‑116 (MQ=255) tCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGc > 4:100857/1‑117 (MQ=255) tCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGc < 3:100857/117‑1 (MQ=255) cgcgAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCAcc > 2:189083/1‑149 (MQ=255) gcgAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCAcc < 2:8495/148‑1 (MQ=255) gAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTACGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCggt > 1:69884/1‑149 (MQ=255) gCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTc < 1:189083/149‑1 (MQ=255) gCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTc < 4:30625/149‑1 (MQ=255) ggCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCcaa < 2:69884/147‑1 (MQ=255) gCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCcaaca < 6:136438/148‑1 (MQ=255) cGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAAt > 7:22223/1‑149 (MQ=255) tCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCcaa < 5:143905/137‑1 (MQ=255) tCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCcaa > 6:143905/1‑137 (MQ=255) cGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctggt > 6:239845‑M2/1‑140 (MQ=255) gCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGGGACGTGGCTAACACCAGCAcattgttggcgaccaccggtgcctgcttgcgcgccgcagcggcggtcttggcattgctggtgtta < 5:42610‑M1/149‑66 (MQ=255) cTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGgcgc < 5:251531/149‑1 (MQ=255) gggTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTg > 5:53415/1‑149 (MQ=255) gTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAcattgttggcgaccaccggtgcctgcttgcgcgccgcagcggcggtcttggcattgctggtgttagccac < 4:28338‑M1/149‑71 (MQ=255) gATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctggtg > 8:150768‑M2/1‑124 (MQ=255) gATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctggtg < 7:150768‑M2/132‑9 (MQ=255) cGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGAc < 5:119268/148‑1 (MQ=255) gCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTgg > 7:42084/1‑134 (MQ=255) gCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTgg < 8:42084/134‑1 (MQ=255) ccTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGcc > 1:239642/1‑148 (MQ=255) ccTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGcc > 7:178274/1‑148 (MQ=255) tCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTacgacg > 2:154949/1‑149 (MQ=255) cacCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACCACGGCTATGGc > 6:51814/1‑148 (MQ=255) cAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTg < 2:37817/115‑1 (MQ=255) cTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGTCCGCCGCTGGGGCGCGCAAGGAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGGTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGt < 1:64134/149‑1 (MQ=255) ggTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTc > 2:271003/1‑147 (MQ=255) gTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATgg < 1:252775/127‑1 (MQ=255) gTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATgg > 2:252775/1‑127 (MQ=255) gTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAg > 8:98520/1‑149 (MQ=255) aCGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAgcgc > 4:230410/1‑149 (MQ=255) gTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctggtgttagccacgtcacctagggcatgaacgttggtgtatttgcgatggcgcagggtatgcggatcgacgtcaac < 4:28338‑M2/149‑80 (MQ=255) tAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGtgctggtgttagccacgtcccctagggcatgaacgttggtgtatttgcgatggcgcagggtatgcggatcgacgtcaacccagc < 5:42610‑M2/149‑85 (MQ=255) tAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGc > 2:122242/1‑145 (MQ=255) acacCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGa < 1:200330/147‑1 (MQ=255) cacCAGCAcattgttggcgaccaccggtgcctgcttgcgcgccgcagcggcggtcttggcattgctggtgttagccacgtcacctagggcatgaacgttggtgtatttgcgatggcgcagggtatgcggatc < 7:150768‑M1/132‑125 (MQ=255) cacCAGCAcattgttggcgaccaccggtgcctgcttgcgcgccgcagcggcggtcttggcattgctggtgttagccacgtcacctagggcatgaacgttggtgtatttgcgatggcgcagggtatgcggatc > 8:150768‑M1/1‑8 (MQ=255) acCAGCAcattgttggcgaccaccggtgcctgcttgcgcgccgcagcggcggtcttggcattgctggtgttagccacgtcacctagggcatgaacgttggtgtatttgcgatggcgcagggtatgcggatcgacgtcaacccagccg > 6:239845‑M1/1‑7 (MQ=255) acCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGt > 2:260545/1‑149 (MQ=255) ccAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTc < 6:53415/149‑1 (MQ=255) gCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTg < 8:178274/149‑1 (MQ=255) | ACGTGGTACCGCCACAGGTGGCGCCAGACTTCATTCGCGAAAGCCCCTTGGCGGATAGCTCCGGCTGGGTTGACGTCGATCCGCATACCCTGCGCCATCGCAAATACACCAACGTTCATGCCCTAGGTGACGTGGCTAACACCAGCAATGCCAAGACCGCCGCTGCGGCGCGCAAGCAGGCACCGGTGGTCGCCAACAATGTGCTGGTGGCGCTGGGCAGGCTGGCGACCTTGGCCCAGTACGACGGCTATGGCTCGTGCCCGCTTACCGTCGAGCGCGGCAAGATCGTCCTG > NC_002947/62546‑62838 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |