New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 674337 = | 41 (0.970) | 3 (0.080) | 3/240 | NT | 7.0% | intergenic (‑229/+77) | PP_0575/PP_0576 | membrane protein/lipoprotein |
? | NC_002947 | 674395 = | 42 (1.070) | intergenic (‑287/+19) | PP_0575/PP_0576 | membrane protein/lipoprotein |
GGGGAGTGCGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTG > NC_002947/674191‑674480 | gtggATTGCGGTTGTCATCGTAAATAACTCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGGCTGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTTATGGCCATCTTTGTAGGCGTGGGGTCACCCGGGAATATGCGCGTAGCCGGTGCCAt < 6:141167/147‑1 (MQ=255) gAGTGCGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCa > 8:50067/1‑149 (MQ=255) cGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCggg < 6:121873/149‑1 (MQ=255) gggtGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGATTCTGGCCAGGACGGTGACGCAGTCGGACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCATGGCACCggct < 1:89482/146‑3 (MQ=255) ggTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGc < 8:119537/149‑1 (MQ=255) aTCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGc > 7:103463/1‑149 (MQ=255) gAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTAGGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTcg > 6:247724/1‑149 (MQ=255) aaaaaGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTcgcg > 8:65195/1‑149 (MQ=255) cgtgGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:162641/1‑149 (MQ=255) ggAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc > 2:190086/1‑149 (MQ=255) aTGGATTTTGTAGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCAAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCccgc > 4:79774/1‑149 (MQ=255) gATTTTGGCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCgg < 7:151406/149‑1 (MQ=255) aagaacgcaacagcgcaatccgcaataccgtggccaaggtgctgggcaactacccaccgggcagcaaaaaatagcgttggaacgcggcttttgCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGtgca > 2:1532‑M1/94‑149 (MQ=255) acaGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCaaaa < 8:103463/149‑1 (MQ=255) aggccaggccGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCaaaa < 2:270353/147‑1 (MQ=255) aggccaggccGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCaaaa > 1:270353/1‑147 (MQ=255) ggTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCaa > 2:210907/1‑149 (MQ=255) ggTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCaa > 4:211859/1‑149 (MQ=255) gTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTcg < 3:181527/96‑1 (MQ=255) gTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTcg > 4:181527/1‑96 (MQ=255) gCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTAt > 3:62890/1‑149 (MQ=255) gTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTAtttttt < 4:62890/148‑1 (MQ=255) tACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTtgc > 2:141991/1‑149 (MQ=255) gTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGCCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTtgctgc < 1:190086/147‑1 (MQ=255) aTCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGt > 4:207880/1‑149 (MQ=255) cATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTa < 3:207880/149‑1 (MQ=255) cTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGtt > 5:163736/1‑149 (MQ=255) tGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGCAGCCGGTGCCATCCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGtt < 6:149542/146‑1 (MQ=255) tGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGt < 1:162641/145‑1 (MQ=255) tAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCa < 7:50067/149‑1 (MQ=255) aGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAg > 4:101942/1‑141 (MQ=255) aGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAg < 3:101942/141‑1 (MQ=255) gggTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTg < 3:79774/149‑1 (MQ=255) ggTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCTGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTgg < 2:247676/149‑1 (MQ=255) caaaaaatagcgttggaacgcggcttttgCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGtgcatgc > 2:189228‑M1/30‑88 (MQ=255) caaaaaatagcgttggaacgcggcttttgCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGtgcatgc < 1:189228‑M1/59‑1 (MQ=255) ccGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTg < 1:146536/122‑1 (MQ=255) ccGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTg > 2:146536/1‑122 (MQ=255) ccGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAg < 2:225528/135‑1 (MQ=255) ccGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAg > 1:225528/1‑135 (MQ=255) gcgAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTa > 3:251594/1‑149 (MQ=255) cgAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTgc > 7:250091/1‑149 (MQ=255) gAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTgcg > 1:220930/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTg > 5:219359/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGtt < 3:10135/149‑1 (MQ=255) ggTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTg > 1:126027/1‑149 (MQ=255) | GGGGAGTGCGGTTGGCATCGGAAAAAAGGCGTGCGTGGAATGGATTTTGTCGTAGCTGACACAGGCCAGGCCGGTGACGCAGTCGTACTCGTAATCGCCATCTATGTAGGCGTGGGGTCACCCGCGAACATCCGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGCCAATTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCGCCGGGCCACGGTGCATGCAAAAGCCGCGTTCCAACGCTATTTTTTGCTGCCCGGTGGGTAGTTGCCCAGCACCTTGGCCACGGTATTGCGGATTGCGCTGTTG > NC_002947/674191‑674480 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |