New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 937436 | 51 (1.210) | 3 (0.070) | 3/248 | NT | 6.2% | coding (8186/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 937482 | 42 (1.040) | coding (8140/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
CCCCCACCACGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGG > NC_002947/937290‑937583 | cccccACCACGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGGTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTgcg < 5:174668/149‑1 (MQ=255) cccccACCACGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTgcg > 1:2428/1‑149 (MQ=255) cGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGc < 6:177766/149‑1 (MQ=255) cTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCgg < 2:2428/149‑1 (MQ=255) cccAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCTCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCGACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCaa < 4:70160/149‑1 (MQ=255) ccATTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACAGGGACGTTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCTCAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAac < 6:154712/149‑1 (MQ=255) aGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAacga > 1:134827/1‑149 (MQ=255) aCAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGc < 4:254585/135‑1 (MQ=255) aCAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGc > 3:254585/1‑135 (MQ=255) tggtgCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTg > 5:67757/1‑149 (MQ=255) gtgCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGcc > 8:191016/1‑149 (MQ=255) tgCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCg < 5:66385/149‑1 (MQ=255) ccATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCgtt > 8:59764/1‑149 (MQ=255) atgggcgtcCAGCACACGGACGGTGCTGCATGCTTGGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGGTTGGCGCCACAGGCGGGGTTATTTGTTGTGCGGCGACGTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCgttgt < 7:91685/146‑1 (MQ=255) ccAGCACACGGAGGGTGCTGCCTGGTCCGGCGCGGCCGCGGACGACGGTACGGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATc < 2:265006/149‑1 (MQ=255) ccAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATc < 2:134827/149‑1 (MQ=255) cAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCg > 1:206670/1‑149 (MQ=255) cAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAAGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCg > 3:71905/1‑149 (MQ=255) aGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGgcgatcgacaacaacggcacctcgtcgttgccggtgcaggtcgccg > 1:212984‑M1/1‑103 (MQ=255) aGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGc > 4:186717/1‑149 (MQ=255) gacggTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGgcgatcgacaacaacggcacctcgtcgttgccggtgcaggtcgccgcaccagac < 2:212984‑M1/149‑55 (MQ=255) acggTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTc < 7:59764/149‑1 (MQ=255) acggTGCGGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACACGCGCGGTGATGTCTGGTGgcgatcgacaacaacggcacctcgtcgttgccggtgcaggtcgccgcaccagaca < 7:179384‑M1/149‑56 (MQ=255) cTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTTCACCTGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCa < 1:21089/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCa < 7:191016/149‑1 (MQ=255) tggcgacgGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCgg > 4:240924/4‑148 (MQ=255) gacgacGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccac > 8:221675/1‑117 (MQ=255) gacgacGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccac < 7:221675/117‑1 (MQ=255) ggTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt < 6:93151/142‑1 (MQ=255) ggTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt > 5:93151/1‑142 (MQ=255) gTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGcac > 3:199087/1‑149 (MQ=255) gCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTg > 7:205390/1‑148 (MQ=255) cACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCTGCGACCTGCACCGGCAAGGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAg < 8:205390/149‑1 (MQ=255) cTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGt > 4:181890/1‑149 (MQ=255) aTTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTg < 4:199087/147‑1 (MQ=255) aTTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGcc > 7:13824/1‑149 (MQ=255) ccAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCTTTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCTCCGGCTACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCTACTCGCGATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTc < 8:69857/148‑1 (MQ=255) ccAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCg < 6:67757/149‑1 (MQ=255) aGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt > 7:157174/1‑120 (MQ=255) aGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGt < 8:157174/120‑1 (MQ=255) aGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGc < 3:181890/149‑1 (MQ=255) aTCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGc < 1:28710/81‑1 (MQ=255) aTCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGc > 2:28710/1‑81 (MQ=255) cGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGcacc > 8:21604/1‑148 (MQ=255) gCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGcaccca < 7:107731/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGcaccca < 7:21604/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCg > 2:120846/1‑96 (MQ=255) cTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGTTGCCCTCGGctcccac > 7:197404/1‑149 (MQ=255) ttGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCt > 7:216585/1‑138 (MQ=255) ttGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCt < 8:216585/138‑1 (MQ=255) gcgcCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGAAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACAACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCAGGTATAAGCACCACGGTGAAAGAGCCCTCGGCACCcaccac > 7:134132/1‑148 (MQ=255) cgcCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGa > 2:99076/1‑149 (MQ=255) gcCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGAt < 3:186717/149‑1 (MQ=255) ccACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATg > 4:142150/1‑149 (MQ=255) aGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccac > 5:258733/1‑72 (MQ=255) aGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccac < 6:258733/72‑1 (MQ=255) tGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcgtgtggcgccaagcgatctggcaatcagtggcgacggtaccgtcgtcagcggccgcgccgaagcaggccgcaccgt < 7:179384‑M2/149‑95 (MQ=255) gTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCcaccagacatcaccgcgcctgtggcgccaagcgatctggcaatcagtggcgacggtaccgtcgtcagcggccgcgccgaagcaggcagcaccgtc < 2:212984‑M2/149‑96 (MQ=255) gTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGt < 6:105980/147‑1 (MQ=255) gTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTg < 8:13824/149‑1 (MQ=255) tGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTgg < 4:71905/149‑1 (MQ=255) | CCCCCACCACGACACTGCCCAGTACAGTGGTGCCATCGGCGGCCAGCACACGGACGGTGCTGCCTGCTTCGGCGCGGCCGCTGACGACGGTACCGTCGCCACTGATTGCCAGATCGCTTGGCGCCACAGGCGCGGTGATGTCTGGTGCGGCGACCTGCACCGGCAACGACGAGGTGCCGTTGTTGTCGATCGCCACCACGTCCAGCAACTCGCCATTGGCCTGGGCCGGTATAAGCACCACGGTGAAGGTGCCCTCGGCACCCACCACGATGCTACCGACCAGCGTGCCGTTGG > NC_002947/937290‑937583 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |