New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 982600 | 34 (0.810) | 4 (0.100) | 4/246 | NT | 11.2% | coding (1477/1863 nt) | hscA | DnaK‑like molecular chaperone |
? | NC_002947 | = 982652 | 31 (0.770) | coding (1529/1863 nt) | hscA | DnaK‑like molecular chaperone |
GAGCTGATCAGTGACTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGCCCGCCAGCTGCGAGAGCATCAGGTAGATGGCGAGCGGCTGCTCGA > NC_002947/982453‑982748 | gagcTGATCAGTGACTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGt < 7:138459/149‑1 (MQ=255) gATCAGTGACTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAg > 8:38826/1‑149 (MQ=255) aTCAGTGACTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGc < 2:244984/149‑1 (MQ=255) cAGTGACTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATGTGTTCCCGGTGGTGCAAAAATCCGCGTCACATTCCAGGTGGATGCCGATGGCATGAACAGCGACGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGaacc > 1:205744/1‑146 (MQ=255) cAGTGACTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATGCGTTGCCGGTGCTGCAAAAAACCGCGTCACGTTCCAGGTGGATGCCGATGGCATGATCAGCTACGATCCCCGCTAGATGGGTACGGGCGTGGAAGc > 1:202368/1‑148 (MQ=255) gTGACTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAg > 1:174890/1‑148 (MQ=255) aCTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGAGGCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGatttcgccgtcgg > 1:3334‑M1/1‑136 (MQ=255) aCTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCAtt > 3:72941/1‑149 (MQ=255) ccGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAgg > 4:82334/1‑149 (MQ=255) ccGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAgg > 6:77706/1‑149 (MQ=255) cGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGt < 5:77706/149‑1 (MQ=255) gTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTc < 5:248982/149‑1 (MQ=255) cTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGcc > 4:155376/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGt < 2:202368/148‑1 (MQ=255) gCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGt < 2:205744/148‑1 (MQ=255) gCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGa < 2:194348/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGAcc > 5:258143/1‑148 (MQ=255) gcgGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGCTGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGAc > 7:66188/1‑149 (MQ=255) cccGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTg < 1:44572/136‑1 (MQ=255) cccGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTg > 2:44572/1‑136 (MQ=255) cccGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGaaa > 8:64347/1‑149 (MQ=255) ccGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGatttcgccgtcggtcaggccgtaggacggcttgacctgaatgctggcttcca > 6:248971‑M1/1‑97 (MQ=255) ccGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAAt < 1:12197/149‑1 (MQ=255) cGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATc > 2:122354‑M2/1‑148 (MQ=255) gCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATcgc > 4:72941‑M2/1‑146 (MQ=255) ccATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGatttcgccgtcggtcaggccgtaggacggcttgacctgaatgctggcttccacgcc < 2:3334‑M1/149‑57 (MQ=255) cATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATcgccc > 6:258143‑M2/1‑144 (MQ=255) ttGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGatttcgccgtcggtcaggccgtaggacggcttgacctgaatgctggcttccacgcccgaacc < 5:248971‑M1/149‑63 (MQ=255) aaaTCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTc < 2:174890/149‑1 (MQ=255) aCCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCgg > 1:162126/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTc > 3:66957/1‑149 (MQ=255) ggTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATcg > 8:57415‑M2/1‑105 (MQ=255) ggTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATcg < 7:57415‑M2/107‑3 (MQ=255) gATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCa > 3:217249/1‑149 (MQ=255) cGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCCGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGccc > 4:212607/1‑149 (MQ=255) cTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGa < 8:204383/131‑1 (MQ=255) cTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGa > 7:204383/1‑131 (MQ=255) cTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGCCCGCCAGCTGc > 1:98425/1‑148 (MQ=255) cGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGCCCGCCAGCTGCGAGAGc < 8:66188/149‑1 (MQ=255) tCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGCCCGCCAGCTGCGAGAGCAt < 6:9747/149‑1 (MQ=255) cTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGCCCGCCAGCTGCGAGAGCATCAg < 2:162126/149‑1 (MQ=255) cccGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGCCCGCCAGCTGCGAGAGCATCAgg < 3:155376/147‑1 (MQ=255) cccGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGCCCGCCAGCTGCGAGAGCATCAgg > 8:15759/1‑147 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGc < 6:43032/119‑1 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGc > 5:43032/1‑119 (MQ=255) ggTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATcgcccgaacccagctcgcgggcagcgacgctgagcaggccatcggcatccacctggaaggtgacgcggatttttgcagcaccggcaa < 5:248971‑M2/149‑88 (MQ=255) gggCGatttcgccgtcggtcaggccgtaggacggcttgacctgaatgctggcttccacgcccgaacccagctcgcgggcagcgacgctgagcaggccatcggcatccacctggaaggtgacgcggatttttgcagcaccggcaaccatg > 6:258143‑M1/1‑5 (MQ=255) ggCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATcgcccgaacccagctcgcgggcagcgacgctgagcaggccatcggcatccacctggaaggtgacgcggatttttgcagcaccggcaaccatgg < 2:3334‑M2/149‑94 (MQ=255) gCGatttcgccgtcggtcaggccgtaggacggcttgacctgaatgctggcttccacgcccgaacccagctcgcgggcagcgacgctgagcaggccatcggcatccacctggaaggtgacgcggatttttgcagcaccggcaaccatggc > 4:72941‑M1/1‑3 (MQ=255) cGatttcgccgtcggtcaggccgtaggacggcttgacctgaatgctggcttccacgcccgaacccagctcgcgggcagcgacgctgagcaggccatcggcatccacc < 7:57415‑M1/107‑106 (MQ=255) cGatttcgccgtcggtcaggccgtaggacggcttgacctgaatgctggcttccacgcccgaacccagctcgcgggcagcgacgctgagcaggccatcggcatccacc > 8:57415‑M1/1‑2 (MQ=255) gatttcgccgtcggtcaggccgtaggacggcttgacctgaatgctggcttccacgcccgaacccagctcgcgggcagcgacgctgagcaggccatcggcatccacctggaaggtgacgcggatttttgcagcaccggcaaccatggccg > 2:122354‑M1/1‑1 (MQ=255) | GAGCTGATCAGTGACTGCCGTTCGCTGGCCCGCTTCGA‑GCTGCGCGGCATCCCGGCCATG‑GTTGCCGGTGCTGCAAAAATCCGCGTCACCTTCCAGGTGGATGCCGATGGCCTGCTCAGCGTCGCTGCCCGCGAGCTGGGTTCGGGCGTGGAAGCCAGCATTCAGGTCAAGCCGTCCTACGGCCTGACCGACGGCGAAATCGCCCGCATGCTCAAGGACTCCTTCGAACACGCCGGTTCCGACAAGCATGCCCGCCAGCTGCGAGAGCATCAGGTAGATGGCGAGCGGCTGCTCGA > NC_002947/982453‑982748 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |