| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1472511 = | 53 (1.260) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.7% | coding (316/1491 nt) | alg8 | glycosyltransferase Alg8 |
| ? | NC_002947 | 1472544 = | 33 (0.820) | coding (283/1491 nt) | alg8 | glycosyltransferase Alg8 | |||||
CCAGCTTCACGTGGGCCGGCGGGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAA > NC_002947/1472364‑1472643 | tggtcggcgcagtcggcatctggcgctactccatgggcgccacccatttcatccgcggcatgatcttcctctacggcgtgtacccgtacctgcgccgcaaggtgcagaaaatgggtaatgccaccgacccgtcgcatgtctacctgaTg < 6:60721‑M1/2‑1 (MQ=255)ccAGCTTCACGTGGGCCGGCGGGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCggtg > 2:39210/1‑149 (MQ=255)ccAGCTTCACGTGGGCCGGCGGGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCggtg > 8:154334/1‑149 (MQ=255) cAGCTTCACGTGGGCCGGCGGGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCggtg < 2:87778/148‑1 (MQ=255) gTGGGCCGGCGGGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCtt < 5:83429/149‑1 (MQ=255) gcatctggcgctactccatgggcgccacccatttcatccgcggcatgatcttcctctacggcgtgtacccgtacctgcgccgcaaggtgcagaaaatgggtaatgccaccgacccgtcgcatgtctacctgaTgg < 6:20444‑M1/3‑1 (MQ=255) cggcggGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCggt > 3:166966/1‑132 (MQ=255) cggcggGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCggt < 4:166966/132‑1 (MQ=255) gcggGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGATCAGAACACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACgg < 2:141742/149‑1 (MQ=255) gTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCAGCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTg < 7:154334/148‑1 (MQ=255) gTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTg < 6:196138/148‑1 (MQ=255) gccggCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGa < 3:169731/146‑1 (MQ=255) ggCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCa > 3:55542/1‑149 (MQ=255) gCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATAc < 4:242736/133‑1 (MQ=255) gCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATAc > 3:242736/1‑133 (MQ=255) gCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCa > 4:114291/1‑148 (MQ=255) gCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCAt < 3:224709/149‑1 (MQ=255) ccACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCAt > 3:58097/1‑147 (MQ=255) ggcgccacccatttcatccgcggcatgatcttcctctacggcgtgtacccgtacctgcgccgcaaggtgcagaaaatgggtaatgccaccgacccgtcgcatgtctacctgaTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCa > 7:25795‑M1/113‑148 (MQ=255) ggCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAg < 3:49226/149‑1 (MQ=255) ggCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAg < 3:52837/149‑1 (MQ=255) cacccatttcatccgcggcatgatcttcctctacggcgtgtacccgtacctgcgccgcaaggtgcagaaaatgggtaatgccaccgacccgtcacatgtctacctgaTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAg > 6:86015‑M1/108‑144 (MQ=255) cacacatttcatccgcggcatgatcttcctctacggcgtgtacccgtacctgcgccgcaaggtgcagaaaatgggtaatgccaccgacccgtcacatgtctacctgaTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAg < 5:86015‑M1/37‑1 (MQ=255) tCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAgg < 8:88869/140‑1 (MQ=255) tCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAgg > 7:88869/1‑140 (MQ=255) agcagTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGc < 3:264953/144‑1 (MQ=255) agcagTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGc > 4:264953/1‑144 (MQ=255) gTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGaa < 3:236648/115‑1 (MQ=255) gTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGaa > 4:236648/1‑115 (MQ=255) aTCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCAGGGTGGTGGGGACGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGCGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTgg > 6:251925/1‑149 (MQ=255) aTCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTgg > 8:233550/1‑149 (MQ=255) aTCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTg < 1:39210/148‑1 (MQ=255) ggACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTc < 6:158559/99‑1 (MQ=255) ggACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTc < 6:154828/99‑1 (MQ=255) ggACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTc > 5:154828/1‑99 (MQ=255) ggACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTc > 5:158559/1‑99 (MQ=255) gACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCtt < 2:240726/97‑1 (MQ=255) gACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCtt > 1:240726/1‑97 (MQ=255) gACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCAt > 5:60721/1‑148 (MQ=255) cATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTAc < 4:55542/149‑1 (MQ=255) aTTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCAtt > 3:205687/1‑146 (MQ=255) aTTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCAtt < 4:205687/146‑1 (MQ=255) accaGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCAttt > 8:33086/1‑148 (MQ=255) caGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGCGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCt > 5:6428/1‑149 (MQ=255) gAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGGAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCAc > 2:245890/1‑149 (MQ=255) gAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCAc < 3:114291/149‑1 (MQ=255) aGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCAcc > 3:46782/1‑149 (MQ=255) aGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCAcc > 2:5123/1‑149 (MQ=255) cAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCtt < 4:58097/149‑1 (MQ=255) aaGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACggg > 6:205220/1‑147 (MQ=255) aaGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACggg < 5:205220/147‑1 (MQ=255) gCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACgg < 4:99004/144‑1 (MQ=255) gCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACgg > 3:99004/1‑144 (MQ=255) cAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGGGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGcc < 5:251925/149‑1 (MQ=255) gATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGGGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTag < 6:259001/148‑1 (MQ=255) aTCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTagag > 4:239078/1‑149 (MQ=255) cgGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCAt < 7:33086/149‑1 (MQ=255) ggATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGGAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATg < 1:245890/149‑1 (MQ=255) ggATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATg < 1:5123/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAgg > 5:250092/1‑133 (MQ=255) cGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAgg < 6:250092/133‑1 (MQ=255) cTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGaa < 5:129923/141‑1 (MQ=255) cTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGAAATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGaa > 6:129923/1‑141 (MQ=255) | CCAGCTTCACGTGGGCCGGCGGGTTGTACTTGGCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAA > NC_002947/1472364‑1472643 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |