New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1472511 = | 53 (1.260) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.7% | coding (316/1491 nt) | alg8 | glycosyltransferase Alg8 |
? | NC_002947 | 1472544 = | 33 (0.820) | coding (283/1491 nt) | alg8 | glycosyltransferase Alg8 |
GCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTGGCGCCCATGGAGTAGCGCCAGATGCCGACTGCGCCGACCA > NC_002947/1472396‑1472690 | gCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCAt < 3:224709/149‑1 (MQ=255) ccACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCAt > 3:58097/1‑147 (MQ=255) ggcgccacccatttcatccgcggcatgatcttcctctacggcgtgtacccgtacctgcgccgcaaggtgcagaaaatgggtaatgccaccgacccgtcgcatgtctacctgaTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCa > 7:25795‑M1/113‑148 (MQ=255) ggCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAg < 3:52837/149‑1 (MQ=255) ggCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAg < 3:49226/149‑1 (MQ=255) cacccatttcatccgcggcatgatcttcctctacggcgtgtacccgtacctgcgccgcaaggtgcagaaaatgggtaatgccaccgacccgtcacatgtctacctgaTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAg > 6:86015‑M1/108‑144 (MQ=255) cacacatttcatccgcggcatgatcttcctctacggcgtgtacccgtacctgcgccgcaaggtgcagaaaatgggtaatgccaccgacccgtcacatgtctacctgaTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAg < 5:86015‑M1/37‑1 (MQ=255) tCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAgg > 7:88869/1‑140 (MQ=255) tCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAgg < 8:88869/140‑1 (MQ=255) agcagTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGc < 3:264953/144‑1 (MQ=255) agcagTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGc > 4:264953/1‑144 (MQ=255) aTCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCAGGGTGGTGGGGACGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGCGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTgg > 6:251925/1‑149 (MQ=255) aTCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTgg > 8:233550/1‑149 (MQ=255) aTCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTg < 1:39210/148‑1 (MQ=255) gACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCAt > 5:60721/1‑148 (MQ=255) cATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTAc < 4:55542/149‑1 (MQ=255) aTTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCAtt > 3:205687/1‑146 (MQ=255) aTTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCAtt < 4:205687/146‑1 (MQ=255) accaGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCAttt > 8:33086/1‑148 (MQ=255) caGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGCGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCt > 5:6428/1‑149 (MQ=255) gAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGGAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCAc > 2:245890/1‑149 (MQ=255) gAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCAc < 3:114291/149‑1 (MQ=255) aGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCAcc > 3:46782/1‑149 (MQ=255) aGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCAcc > 2:5123/1‑149 (MQ=255) cAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCtt < 4:58097/149‑1 (MQ=255) aaGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACggg > 6:205220/1‑147 (MQ=255) aaGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACggg < 5:205220/147‑1 (MQ=255) gCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACgg < 4:99004/144‑1 (MQ=255) gCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACgg > 3:99004/1‑144 (MQ=255) cAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGGGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGcc < 5:251925/149‑1 (MQ=255) gATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGGGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTag < 6:259001/148‑1 (MQ=255) aTCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTagag > 4:239078/1‑149 (MQ=255) cgGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCAt < 7:33086/149‑1 (MQ=255) ggATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGGAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATg < 1:245890/149‑1 (MQ=255) ggATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATg < 1:5123/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAgg < 6:250092/133‑1 (MQ=255) cGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAgg > 5:250092/1‑133 (MQ=255) cTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGaa < 5:129923/141‑1 (MQ=255) cTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGAAATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGaa > 6:129923/1‑141 (MQ=255) ctgatggtcaccagcttccgtatcgaagcgctgaccaTCAGGTAGACATGTGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAAtgtgtg < 5:86015‑M2/107‑1 (MQ=255) ctgatggtcaccagcttccgtatcgaagcgctgaccaTCAGGTAGACATGTGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTg > 6:86015‑M2/38‑144 (MQ=255) tgatggtcaccagcttccgtatcgaagcgctgaccaTCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTGGCGcc > 7:25795‑M2/37‑148 (MQ=255) GTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTGGCGCCCATgg > 4:46782‑M1/1‑148 (MQ=255) TCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTGGCGCCCATGGAg < 4:162029‑M1/149‑1 (MQ=255) CAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATc < 6:230132‑M1/115‑1 (MQ=255) aaGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTGGCGCCCATGGAGTAGCGCCAGATGCCGAc < 3:239078/149‑1 (MQ=255) tGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGaa > 2:184677/1‑109 (MQ=255) tGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGaa < 1:184677/109‑1 (MQ=255) ccaTCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTGGCGCCCATGGAGTAGCGCCAGATGc < 6:20444‑M2/132‑1 (MQ=255) caTCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTGGCGCCCATGGAGTAGCGCCAGATGCCGACTGCGCCGACCa < 6:60721‑M2/147‑1 (MQ=255) | GCCCACAGGCTCTTCACCAGCAGTTCATCGGACATTTCCACCAGCGAGCAGACCACGGTGGTGGGGAAGCCGCAGTTGATCGCCTCGCGGATCACCGAGCTGTACACCTGGGCGGTGGTCAGCGCTTCGATACGGAAGCTGGTGACCATCAGGTAGACATGCGACGGGTCGGTGGCATTACCCATTTTCTGCACCTTGCGGCGCAGGTACGGGTACACGCCGTAGAGGAAGATCATGCCGCGGATGAAATGGGTGGCGCCCATGGAGTAGCGCCAGATGCCGACTGCGCCGACCA > NC_002947/1472396‑1472690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |