New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1522319 = | 42 (0.990) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 7.2% | coding (227/1215 nt) | ftsW | lipid II flippase |
? | NC_002947 | 1522355 = | 37 (0.920) | coding (263/1215 nt) | ftsW | lipid II flippase |
CCGGTTGCCTGGCCTTGCTGGGCCTGGGCCTGGTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCTGGATCGGTTTCAGCTTCT > NC_002947/1522172‑1522459 | ccGGTTGCCTGGCCTTGCTGGGCCTGGGCCTGGTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAAcc < 2:64167/149‑1 (MQ=255) gcctggcctgGCTGGGCCTGGGCCTGGTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTg < 8:114134/149‑1 (MQ=255) ccTGGCCTTGCTGGGCCTGGGCCTGGTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTgg > 3:132323/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCTTGCTGGGCCTGGGCCTGGTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTgg > 2:175463/1‑149 (MQ=255) gCCTTGCTGGGCCTGGGCCTGGTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGc < 4:132323/148‑1 (MQ=255) cctgggcctggTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCt > 2:8879/1‑149 (MQ=255) gTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCAt > 4:184605/1‑149 (MQ=255) atCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCt < 1:175463/148‑1 (MQ=255) tCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTTCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTc < 5:235640/149‑1 (MQ=255) aagaagctgaaaccgatccagcgcatggagccgttgacctcacggccgatacccggcaccagcaccagtaccagcaagccgaaagcgccaagcagcatcatgaagcCCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCa > 3:106139‑M1/107‑148 (MQ=255) cGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCatga < 4:243289/147‑1 (MQ=255) gCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGt > 6:185554/1‑110 (MQ=255) gCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGt < 5:185554/110‑1 (MQ=255) ctcctcGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGAtgctgc > 8:112382/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCgg > 7:55369/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCg < 3:250419/148‑1 (MQ=255) ggTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGc > 1:174458/1‑149 (MQ=255) tACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTg < 3:184605/149‑1 (MQ=255) cAGTCCTGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATTGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTgg < 4:172969/148‑1 (MQ=255) tCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTg < 3:225291/144‑1 (MQ=255) tCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTg > 4:225291/1‑144 (MQ=255) cGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTTGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTActgg < 7:240772/149‑1 (MQ=255) cGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTActg < 1:8879/148‑1 (MQ=255) gCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTActggtg > 2:152920/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTActggtgctggt > 7:93037/1‑149 (MQ=255) acaTGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCgg > 6:83119/1‑144 (MQ=255) acaTGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCgg < 5:83119/144‑1 (MQ=255) acaTGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGt < 1:81188/146‑1 (MQ=255) caTGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCg > 2:116627/1‑149 (MQ=255) caTGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCg > 2:159055/1‑149 (MQ=255) gCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAg < 2:215452/149‑1 (MQ=255) tACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCt > 5:58570/1‑148 (MQ=255) ttCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATgc > 7:33951/1‑148 (MQ=255) ttCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATgc < 8:33951/148‑1 (MQ=255) gaaagcgccaagcagcatcatgaagcCCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATg > 7:88102‑M1/27‑61 (MQ=255) gaaagcgccaagcagcatcatgaagcCCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATg < 8:88102‑M1/35‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGGAACCATGCTGGTGCCGATCTCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCt < 6:58570/148‑1 (MQ=255) tGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTTCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTTCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCTGGa > 1:119421/1‑149 (MQ=255) gtggCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGCTCAACGGCTCCATGCGCTGGATCGGttt < 1:152920/149‑1 (MQ=255) tggCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCTGGATCGGTTTc < 7:112382/149‑1 (MQ=255) tggCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCTGGATCGGTTTc < 8:93037/149‑1 (MQ=255) gCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCTGGATCGGTTTCAg < 1:116627/149‑1 (MQ=255) tgtgGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCTGGATCGGTTTCAGctt > 7:26877/1‑149 (MQ=255) tggtgCAACCATGCTGGTGCCGATCGCGACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCTGGATCGGTTTCAGcttct < 1:159055/149‑1 (MQ=255) gtgCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGa > 2:237471/1‑109 (MQ=255) gtgCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGa < 1:237471/109‑1 (MQ=255) | CCGGTTGCCTGGCCTTGCTGGGCCTGGGCCTGGTGATGATCACTTCGGCCTCCTCGGAAGTGGCTGCGGTACAGTCCGGCAACCCGCTGTATCACATGTTTCGCCACCTGGTGTACGTGTTCCTTGGCCTGGTGGCCTGTGGTGCAACCATGCTGGTGCCGATCGCCACCTGGCAGCGCATGGGCTTCATGATGCTGCTTGGCGCTTTCGGCTTGCTGGTACTGGTGCTGGTGCCGGGTATCGGCCGTGAGGTCAACGGCTCCATGCGCTGGATCGGTTTCAGCTTCT > NC_002947/1522172‑1522459 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |