New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1688514 = | 39 (0.920) | 3 (0.070) | 3/248 | NT | 7.2% | coding (1023/1032 nt) | ydcT | polyamine ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 1688577 = | 40 (0.990) | coding (960/1032 nt) | ydcT | polyamine ABC transporter ATP‑binding protein |
AAGCCCTGCCACAGCAGGTTCAGCAGCGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGC > NC_002947/1688367‑1688662 | aaGCCCTGCCACAGCAGGTTCAGCAGCGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCt > 1:102624/1‑149 (MQ=255) cccTGCCACAGCAGGTTCAGCAGCGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCgg < 5:239479/149‑1 (MQ=255) cccTGCCACAGCAGGTTCAGCAGCGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGATCATGTCAGCGGCCCTCgg > 6:259858/1‑149 (MQ=255) catgaggtacaggtcagcggcgtgctgcacgatgtccagtaccaaggcagcgccacccgctacgaactgcagctggacaacggtcaactgctggcagtaagccaggccaatgaccgctggcagaagcagatgcaggcctggcagCTCgg > 7:185830‑M1/145‑149 (MQ=255) catgaggtacaggtcagcggcgtgctgcacgatgtccagtaccaaggcagcgccacccgctacgaactgcagctggacaacggtcaactgctggcagtaagccaggccaatgaccgctggcagaagcagatgcaggcctggcagCTCgg > 1:100759‑M1/145‑149 (MQ=255) agcagGTTCAGCAGCGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGtt > 4:44351/1‑142 (MQ=255) agcagGTTCAGCAGCGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGtt < 3:44351/142‑1 (MQ=255) ttCAGCAGCGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCg > 6:98781/1‑149 (MQ=255) agcagcGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCa > 4:238824/1‑149 (MQ=255) gcagcGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCAt < 8:162908/149‑1 (MQ=255) gcagcGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTCTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCAt > 5:234447/1‑149 (MQ=255) cAGTTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTAGAGCAGGTTGGACAGGGTGAGCAGTGTGCTGATGTCAGCGGCCCGCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCgg > 7:54091/1‑149 (MQ=255) tCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGATGCAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCt > 1:153291/1‑119 (MQ=255) tCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCt < 2:153291/118‑1 (MQ=255) ccAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAgg > 4:148558/1‑149 (MQ=255) cAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGc < 8:134240/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGGCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGc < 5:70811/149‑1 (MQ=255) gAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGGTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGc < 5:98781/149‑1 (MQ=255) cgaactgcagctggacaacggtcaactgctggcagtaagccaggccaatgaccgctggcagaagcagatgcaggcctggcagCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGc > 6:130737‑M1/83‑149 (MQ=255) t‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGc > 4:117372/1‑147 (MQ=255) aaCAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCa > 6:197390/1‑128 (MQ=255) aaCAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCa < 5:197390/128‑1 (MQ=255) acctgTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCt < 5:237507/145‑1 (MQ=255) tGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCt > 6:237507/1‑144 (MQ=255) tGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATc > 8:72759/1‑149 (MQ=255) acaacggtcaactgctggcagtaagccaggccaatgaccgctggcagaagcagatgcaggcctggcagCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGcc < 1:95761‑M1/68‑1 (MQ=255) acaacggtcaactgctggcagtaagccaggccaatgaccgctggcagaagcagatgcaggcctggcagCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGcc > 2:95761‑M1/69‑136 (MQ=255) cAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGc > 5:108193/1‑149 (MQ=255) gTAGAGGTTGGGGCGCCGGTACTGCAGGTTGGTGATGGTGGGCAGTGTGCTCATGTCTGCGGCCCTCGGTTTCCAGCTGCAGCGTCATTGCCTCGCGGGG‑CCAGTTCGGGTGAAGGCGTTGCCCGTGCTGCCAGGCCTGCATCTGCtt < 8:54091/148‑1 (MQ=255) tACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCt < 5:63073/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGtt > 2:233912/1‑65 (MQ=255) gTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGtt < 1:233912/65‑1 (MQ=255) gTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGGCCCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAg < 1:32160/129‑1 (MQ=255) gTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAg > 2:32160/1‑128 (MQ=255) ttGGGGCGCCGGAACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGc < 3:207470/149‑1 (MQ=255) ccGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTg < 2:102624/149‑1 (MQ=255) gTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTg < 7:248626/137‑1 (MQ=255) gTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTg > 8:248626/1‑137 (MQ=255) ttGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGACCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCACGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTAACTg > 2:66924/1‑149 (MQ=255) gggTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCcagcag < 3:117372/149‑1 (MQ=255) gcgcAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGa > 5:246547/1‑149 (MQ=255) cgcAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGa < 6:108193/148‑1 (MQ=255) tgtgCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTg < 7:72759/149‑1 (MQ=255) tCATGTCTGCGTCCCTCGGTTTCCTGCTGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGGCTGGAGGCGTTGCACGTGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTATTCCATCGGTCATTTGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAg < 1:66924/149‑1 (MQ=255) tCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTc > 8:146030/1‑146 (MQ=255) tCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCa < 3:238824/149‑1 (MQ=255) gCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGtt < 6:246547/149‑1 (MQ=255) CTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGc < 8:83294‑M1/149‑1 (MQ=255) | AAGCCCTGCCACAGCAGGTTCAGCAGCGAGCCCAGGTAAATCGCGCCGAACCAGGTCAGCGGCGGGAT‑CAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGC > NC_002947/1688367‑1688662 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |