New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1688514 = | 39 (0.920) | 3 (0.070) | 3/248 | NT | 7.2% | coding (1023/1032 nt) | ydcT | polyamine ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 1688577 = | 40 (0.990) | coding (960/1032 nt) | ydcT | polyamine ABC transporter ATP‑binding protein |
GATCAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCACGCCGCTGACCTGTACCTCATGG > NC_002947/1688432‑1688721 | gATCAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGGTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGc < 5:98781/149‑1 (MQ=255) cgaactgcagctggacaacggtcaactgctggcagtaagccaggccaatgaccgctggcagaagcagatgcaggcctggcagCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGc > 6:130737‑M1/83‑149 (MQ=255) tCAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGc > 4:117372/1‑147 (MQ=255) acctgTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCt < 5:237507/145‑1 (MQ=255) tGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCt > 6:237507/1‑144 (MQ=255) tGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATc > 8:72759/1‑149 (MQ=255) acaacggtcaactgctggcagtaagccaggccaatgaccgctggcagaagcagatgcaggcctggcagCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGcc < 1:95761‑M1/68‑1 (MQ=255) acaacggtcaactgctggcagtaagccaggccaatgaccgctggcagaagcagatgcaggcctggcagCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGcc > 2:95761‑M1/69‑136 (MQ=255) cAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGc > 5:108193/1‑149 (MQ=255) gTAGAGGTTGGGGCGCCGGTACTGCAGGTTGGTGATGGTGGGCAGTGTGCTCATGTCTGCGGCCCTCGGTTTCCAGCTGCAGCGTCATTGCCTCGCGGGG‑CCAGTTCGGGTGAAGGCGTTGCCCGTGCTGCCAGGCCTGCATCTGCtt < 8:54091/148‑1 (MQ=255) tACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCt < 5:63073/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGGCCCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAg < 1:32160/129‑1 (MQ=255) gTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAg > 2:32160/1‑128 (MQ=255) ttGGGGCGCCGGAACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGc < 3:207470/149‑1 (MQ=255) ccGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTg < 2:102624/149‑1 (MQ=255) gTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTg > 8:248626/1‑137 (MQ=255) gTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTg < 7:248626/137‑1 (MQ=255) ttGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGACCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCACGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTAACTg > 2:66924/1‑149 (MQ=255) gggTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCcagcag < 3:117372/149‑1 (MQ=255) gcgcAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGa > 5:246547/1‑149 (MQ=255) cgcAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGa < 6:108193/148‑1 (MQ=255) tgtgCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTg < 7:72759/149‑1 (MQ=255) tCATGTCTGCGTCCCTCGGTTTCCTGCTGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGGCTGGAGGCGTTGCACGTGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTATTCCATCGGTCATTTGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAg < 1:66924/149‑1 (MQ=255) tCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTc > 8:146030/1‑146 (MQ=255) tCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCa < 3:238824/149‑1 (MQ=255) gCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGtt < 6:246547/149‑1 (MQ=255) ggcagctcgggcaacgcctgcaggcgcactggccccgcgaggccatgacggtgctgcaggaaaccgagCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGt > 2:95761‑M2/69‑136 (MQ=255) ggcagctcgggcaacgcctgcaggcgcactggccccgcgaggccatgacggtgctgcaggaaaccgagCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGt < 1:95761‑M2/68‑1 (MQ=255) gcagctcgggcaacgcctgcaggcgcactggccccgcgaggccatgacggtgctgcaggaaaccgagCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCg > 6:130737‑M2/68‑149 (MQ=255) CTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGc < 8:83294‑M1/149‑1 (MQ=255) cagcaCCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGc > 5:229653/1‑149 (MQ=255) agcaCCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCcagcag > 4:203153/1‑107 (MQ=255) agcaCCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCcagcag < 3:203153/107‑1 (MQ=255) caCCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCt > 5:233120/1‑122 (MQ=255) caCCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCt < 6:233120/122‑1 (MQ=255) caCCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCtt < 6:234447/149‑1 (MQ=255) aCCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTg < 3:148558/149‑1 (MQ=255) tCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTa > 7:209223/1‑127 (MQ=255) tCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTa < 8:209223/127‑1 (MQ=255) aTGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTg > 8:52598/1‑149 (MQ=255) gCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGa > 8:81311/1‑148 (MQ=255) cTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTg < 4:167390/127‑1 (MQ=255) ccAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTgcagca > 2:141559/1‑149 (MQ=255) gTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCgg > 1:100303/1‑112 (MQ=255) gTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCgg < 2:100303/112‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTGGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCAcgc > 1:220523/1‑140 (MQ=255) cAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCAcgc < 2:220523/140‑1 (MQ=255) cAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCACGCCGCTGAc < 1:141559/147‑1 (MQ=255) cGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCACGCCGCTGACCTGTAc < 7:83294/149‑1 (MQ=255) cccGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAg < 4:77111/91‑1 (MQ=255) ccgagCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCACGCCGCTGACCTGTACCTCATg > 7:185830‑M2/6‑149 (MQ=255) ccgagCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCACGCCGCTGACCTGTACCTCATg > 1:100759‑M2/6‑149 (MQ=255) cgcccTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCGGCCAGCGGTCATTGGCCGGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGGGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCACGCCGCTGACCTGTACCTCATgg < 7:166287/145‑1 (MQ=255) | GATCAACAGCAGTGCCAGGTACAGGTTGGGGCGCCGGTACAGCAGGTTGGACAGGGTGCGCAGTGTGCTCATGTCAGCGGCCCTCGGTTTCCTGCAGCACCGTCATGGCCTCGCGGGG‑CCAGTGCGCCTGCAGGCGTTGCCCGAGCTGCCAGGCCTGCATCTGCTTCTGCCAGCGGTCATTGGCCTGGCTTACTGCCAGCAGTTGACCGTTGTCCAGCTGCAGTTCGTAGCGGGTGGCGCTGCCTTGGTACTGGACATCGTGCAGCACGCCGCTGACCTGTACCTCATGG > NC_002947/1688432‑1688721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |