New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1923366 = | 35 (0.830) | 4 (0.100) | 3/246 | NT | 9.8% | coding (674/795 nt) | PP_1723 | 2‑aminoethylphosphonate ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 1923403 = | 40 (0.990) | coding (637/795 nt) | PP_1723 | 2‑aminoethylphosphonate ABC transporter permease |
TACGCTGACGAAGCTCATGTCAGGTCTTGTCCTTGTTCAGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGC > NC_002947/1923226‑1923514 | tACGCTGACGAAGCTCATGTCGGGTCTTGTCCTTGTTCAGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGc < 2:156123/146‑1 (MQ=255) tACGCTGACGAAGCTCATGTCAGGTCTTGTCCTTGTTCAGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAgg < 3:153876/149‑1 (MQ=255) cTCATGTCAGGTCTTGTCCTTGTTCAGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCggg > 3:6810/1‑149 (MQ=255) gTCCTTGTTCAGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGt > 7:151720/1‑149 (MQ=255) cagcacctggcaggccgcactgctggtggtgctgccgaacctgcgccagggcctgatggtggcagtgctgctgtcgttctcgttcctgttcggcgaattcgtgtttgccaACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTg > 8:230701‑M1/111‑149 (MQ=255) cTTGTTCAGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTgg < 4:6810/149‑1 (MQ=255) agcacctggcaggccgcactgctggtggtgctgccgaacctgcgccagggcctgatggtggcagtgctgctgtcgttctcgttcctgttcggcgaattcgtgtttgccaACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTgg > 2:174898‑M1/110‑149 (MQ=255) aGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAacac < 2:233383/149‑1 (MQ=255) aGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAacac > 7:115804/1‑149 (MQ=255) aGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAaca < 8:151720/148‑1 (MQ=255) gCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAac < 8:95685/145‑1 (MQ=255) gCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAac > 7:95685/1‑145 (MQ=255) gCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGa < 6:195166/149‑1 (MQ=255) aGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAg > 4:91477/1‑148 (MQ=255) gTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACca > 1:1755/1‑115 (MQ=255) gTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACca < 2:1755/115‑1 (MQ=255) tgccgaacctgcgccagggcctgatggtggcagtgctgctgtcgttctcgttcctgttcggcgaattcgtgtttgccaACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTg < 4:84548‑M1/39‑1 (MQ=255) tgccgaacctgcgccagggcctgatggtggcagtgctgctgtcgttctcgttcctgttcggcgaattcgtgtttgccaACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTg > 3:84548‑M1/79‑117 (MQ=255) ccAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGgaacgagaa < 8:115804/148‑1 (MQ=255) aaGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGcc < 4:70710/119‑1 (MQ=255) aaGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGcc > 3:70710/1‑119 (MQ=255) gACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGc > 7:59358/1‑149 (MQ=255) aGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTg > 8:121674/1‑149 (MQ=255) tGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGTGTCTAGTAGCGGGTGCCGACcagc > 6:255767/1‑74 (MQ=255) tGTTGAACTGGCCGCTGCTGTTGAGCATTTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCTGGTGCCGACcagc < 5:255767/74‑1 (MQ=255) ttGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGtt > 3:89479/1‑149 (MQ=255) ttGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGtt > 6:150585/1‑149 (MQ=255) ttGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCAACAGGCCCTGGCGCAGGtt > 6:176746/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCgg > 4:199294/1‑147 (MQ=255) gCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGgcaggc > 6:145068/1‑147 (MQ=255) gCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGgcagca > 4:192421/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGc < 7:16498/127‑1 (MQ=255) ccGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGc > 8:16498/1‑127 (MQ=255) tgTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACcag > 8:16217/1‑148 (MQ=255) tgTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGACACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACcag > 7:172218/1‑148 (MQ=255) tgttCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTg < 4:89479/148‑1 (MQ=255) tgttCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCAAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGc > 3:86576/1‑149 (MQ=255) aGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCa < 6:136345/100‑1 (MQ=255) aGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCa > 5:136345/1‑100 (MQ=255) gTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTc < 2:11882/57‑1 (MQ=255) gTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTc > 1:11882/1‑57 (MQ=255) gTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGc > 6:142471/1‑149 (MQ=255) cacCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTgg > 3:125833/1‑149 (MQ=255) ACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGgc < 3:257215‑M1/149‑1 (MQ=255) | TACGCTGACGAAGCTCATGTCAGGTCTTGTCCTTGTTCAGGCGGTTGGCGACCCAGGTCAGTACCAGCACGAAGGCGAAGTAGGAGATGACCAGCGCGCTGTTGAAGTGGCCGCTGCTGTTGCGCATGTTGTTCAGGTACACCTGCAGGGTCTCGTAGCGGGTGCCGACCAGCAGGTTGGCAAACACGAATTCGCCGAACAGGAACGAGAACGACAGCAGCACTGCCACCATCAGGCCCTGGCGCAGGTTCGGCAGCACCACCAGCAGTGCGGCCTGCCAGGTGCTGGC > NC_002947/1923226‑1923514 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |