New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2453996 = | 30 (0.710) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 10.4% | coding (1123/3450 nt) | mfd | transcription‑repair coupling factor |
? | NC_002947 | 2454041 = | 23 (0.570) | coding (1078/3450 nt) | mfd | transcription‑repair coupling factor |
AGGCGCTCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGC > NC_002947/2453848‑2454126 | aGGCGCTCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGtt > 6:76174/1‑149 (MQ=255) gCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTc < 4:139787/149‑1 (MQ=255) gTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAg < 5:76174/149‑1 (MQ=255) agtagtCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTgg > 6:102282/1‑149 (MQ=255) ttgtcCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGtt < 5:102282/147‑1 (MQ=255) ttCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTtggccttggcct > 1:8974/1‑149 (MQ=255) ttCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTtggccttggcct > 6:212824/1‑149 (MQ=255) gACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGttggccttggc > 1:1654/1‑144 (MQ=255) gACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGttggccttggc < 2:1654/144‑1 (MQ=255) tgcttcgcccggctcaagcagtggccccgggtggtggtcagcagcgaagagctggagcctggcgtgggccgcgagcgcttcccggcgcgcgccctgcccaaccTg < 3:104097‑M1/2‑1 (MQ=255) tgcttcgcccggctcaagcagtggccccgggtggtggtcagcagcgaagagctggagcctggcgtgggccgcgagcgcttcccggcgcgcgccctgcccaaccTg > 4:104097‑M1/104‑105 (MQ=255) gcttcgcccggctcaagcagtggccccgggtggtggtcagcagcgaagagctggagcctggcgtgggccgcgagcgcttcccggcgcgcgccctgcccaaccTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAg > 2:25561‑M1/103‑148 (MQ=255) cAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCa < 6:55471/149‑1 (MQ=255) cTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAggg < 5:129318/149‑1 (MQ=255) tcaagcagtggccccgggtggtggtcagcagcgaagagctggagcctggcgtgggccgcgagcgcttcccggcgcgcgccctgcccaaccTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTg > 2:157830‑M1/91‑140 (MQ=255) tcaagcagtggccccgggtggtggtcagcagcgaagagctggagcctggcgtgggccgcgagcgcttcccggcgcgcgccctgcccaaccTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTg < 1:157830‑M1/50‑1 (MQ=255) ttCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGGTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCg > 5:74694/1‑149 (MQ=255) gcagcTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGttggccttg > 6:217371/1‑110 (MQ=255) gcagcTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGttggccttg < 5:217371/110‑1 (MQ=255) cagcTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGttggcctt < 2:263778/108‑1 (MQ=255) cagcTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGttggcctt > 1:263778/1‑108 (MQ=255) gcTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCa > 2:68206/1‑129 (MQ=255) gcTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCa < 1:68206/129‑1 (MQ=255) cggcggCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCTGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCTATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAgg < 6:247923/149‑1 (MQ=255) cggcggCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAgg > 6:68476/1‑149 (MQ=255) cGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAAGCTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTc > 1:44618/1‑145 (MQ=255) cGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTc < 2:44618/144‑1 (MQ=255) gATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTc > 4:219318/1‑149 (MQ=255) cAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACg > 4:202567/1‑125 (MQ=255) cAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACg < 3:202567/125‑1 (MQ=255) cAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGctgctg < 5:212824/149‑1 (MQ=255) aaGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGaccac > 1:98890/1‑149 (MQ=255) aaGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGaccac > 1:95150/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGc < 3:219318/149‑1 (MQ=255) ccGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCa < 5:68476/149‑1 (MQ=255) ggAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGc > 6:179506/1‑149 (MQ=255) | AGGCGCTCGGCACCGGTAATGAAGTCGTCCCAGCCTTCGACGGTATGCGGGCGCAGCTTCAGCCGTTCGAGCAGCTCCAGCAGCACTTCCCGGCGGCCCGCTGATTCGGCAGTGAAGAGCACGCGGCCGGGGAA‑CTGGTCGAGGAAGTTGGCCAGCTCGGCCAGCGGCTGGTTGGCCTTGGCCTCGATGGCCAGGTTGGGCAGGGCGCGCGCCGGGAAGCGCTCGCGGCCCACGCCAGGCTCCAGCTCTTCGCTGCTGACCACCACCCGGGGCCACTGC > NC_002947/2453848‑2454126 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |