New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2510535 | 36 (0.850) | 4 (0.100) | 4/240 | NT | 10.5% | coding (1196/1725 nt) | copA‑I | copper resistance protein A |
? | NC_002947 | = 2510556 | 35 (0.890) | coding (1175/1725 nt) | copA‑I | copper resistance protein A |
GGCTGCGCAGGTCGGCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGGCGCGGGTCGGGGGCAGGCACCGGCGC > NC_002947/2510389‑2510683 | ggCTGCGCAGGTCGGCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGa > 3:73124/1‑148 (MQ=255) cAGGTCGGCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATggcgg > 4:244412/1‑149 (MQ=255) ggTCGGCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGgcggcg > 5:30494/1‑149 (MQ=255) gTCGGCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGt < 1:32429/149‑1 (MQ=255) gTCGGCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGt > 2:110513/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTg < 2:83872/149‑1 (MQ=255) ggCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGt < 5:267519/149‑1 (MQ=255) tCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGACTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGGTTGACGGATCGGGTGTTGGTGCATGGCCGACATGGCGGCGGGGTCCATCCcg < 4:2371‑M2/149‑3 (MQ=255) gCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGTTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACcggc < 6:81688‑M2/148‑5 (MQ=255) aCGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATg < 7:9621/148‑1 (MQ=255) cAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCt < 6:646/149‑1 (MQ=255) gCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTc > 5:94195/1‑149 (MQ=255) cAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATTGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATggcggc < 2:225245/100‑1 (MQ=255) cAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGgtatggaccacgccgccatgtcggccatgca > 4:259497‑M1/1‑90 (MQ=255) cAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGgtatggaccacgccgccatgtcggccatgca < 3:259497‑M1/121‑32 (MQ=255) cAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCtg > 2:216429/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATg > 1:115031/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATg > 4:239382/1‑149 (MQ=255) aGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGcc < 1:110513/149‑1 (MQ=255) gggCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCAt < 1:216429/149‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGgtatggaccacgccgccatgtcggccatgc > 1:113143‑M1/1‑72 (MQ=255) ggCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGgtatggaccacgccgccatgtcggccatgc < 2:113143‑M1/102‑31 (MQ=255) aTGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATgcc > 8:42955/1‑149 (MQ=255) gCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCAt < 1:173079/121‑1 (MQ=255) gCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCAt > 2:173079/1‑121 (MQ=255) cATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTgg < 7:42955/148‑1 (MQ=255) tGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTTGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGccc < 4:100456/149‑1 (MQ=255) tGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGt > 4:154156/1‑90 (MQ=255) tCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGTTGTTGCTGCTTGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCACCCATGCCGCCGTGGCCCAt < 4:60422/149‑1 (MQ=255) tCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCa < 3:239382/148‑1 (MQ=255) tCCACCAGCGGGTTGTCGGGTTCACTGAGCGGGTGTTGCTGCAGGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCa < 6:265293/148‑1 (MQ=255) ccaccaGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATg > 3:173456/1‑149 (MQ=255) ccaccaGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATg > 1:75258/1‑149 (MQ=255) accaGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTc < 6:202389/149‑1 (MQ=255) agagggTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGGAGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTc < 5:81688/146‑1 (MQ=255) gTTTTCGGTTTCTCTGATGGGGTTTTTCTGCATGGACGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCTCCATGGCATCCATGCCGCCGTTGCCCATGTCTTCCa < 5:114688/146‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCt < 4:73124/149‑1 (MQ=255) aCTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGgc > 3:217998/1‑149 (MQ=255) gggTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGGCGCGGGTc > 8:114093/1‑149 (MQ=255) gtgtTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCGATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGGCGCGGGTCgg < 6:181096/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGGCGCGGGTCgggg < 6:94195/148‑1 (MQ=255) cgtcATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTTCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGGCGCGGGTCGGGggcag < 7:168436/146‑1 (MQ=255) tgcATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACcggccatgcagcaacacccgatcagtgaaaccgacaacccgctggtggacatgcagaccatggcaccgcgccccaacctggccgatcctg > 4:259497‑M2/1‑31 (MQ=255) tgcATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACcggccatgcagcaacacccgatcagtgaaaccgacaacccgctggtggacatgcagaccatggcaccgcgccccaacctggccgatcctg < 3:259497‑M2/121‑91 (MQ=255) gcATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACcggccatgcagcaacacccgatcagtgaaaccgacaacccgctggtggacatgcagaccatggcaccgcgcc < 2:113143‑M2/102‑73 (MQ=255) gcATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACcggccatgcagcaacacccgatcagtgaaaccgacaacccgctggtggacatgcagaccatggcaccgcgcc > 1:113143‑M2/1‑30 (MQ=255) aTGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGGCGCGGGTCGGGGGCAGGCAc < 2:115031/149‑1 (MQ=255) gCCGgtatggaccacgccgccatgtcggccatgcagcaacaaccgatcagtgaaaccgacaacccgctggtggacatgcagaccatggcaccgcgccccaacctggccgatcctggcataggcctgcgtgacaatggtcgccgcgtgc < 6:81688‑M1/148‑145 (MQ=255) cGggatggaccccgccgccatgtcggccatgcaccaacacccgatccgtcaacccgacaacccgctggtggacatgcagaccatggcaccgcgccccaacctggccgatcctggcatagtcctgcgtgacaatggtcgccgcgtgctga < 4:2371‑M1/149‑148 (MQ=255) gACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGGCGCGGGTCGGGGGCAGGCACCGgcgc < 6:30494/149‑1 (MQ=255) | GGCTGCGCAGGTCGGCGTAGGTCAGCACGCGGCGACCATTGTCACGCAGGCCTATGCCAGGATCGGCCAGGTTGGGGCGCGGTGCCATGGTCTGCATGTCCACCAGCGGGTTGTCGGTTTCACTGATCGGGTGTTGCTGCATGGCCGACATGGCGGCGTGGTCCATACCGGCCATGCTGCCGTGGTTCATGCCCTGCGGATTTCTGTGGTCCATGCCCGCCATGGCATCCATGCCGCCGTGGCCCATGTCTTCCATGCTCAGCACCGGGCGCGGGTCGGGGGCAGGCACCGGCGC > NC_002947/2510389‑2510683 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |