New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2609580 = | 40 (0.950) | 3 (0.070) | 3/252 | NT | 7.6% | coding (721/2190 nt) | PP_2286 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2609637 = | 34 (0.820) | coding (778/2190 nt) | PP_2286 | hypothetical protein |
CCTCATGAACGTGGTCGGGGATGTCACTGGGAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTCCACGCGCAGAGCATGGATGAC > NC_002947/2609432‑2609723 | cggcatccgcttgggtcaggaacgggcgaatctcatcatccacacgcttacgctggttctggtcatccatgctctgcgcgtggaggctcacttcggcagcggtagtgccacccagcgtggacgccacagtggcaccggatgacagcttc > 7:59440‑M1/149‑149 (MQ=255) aaCGTGGTCGGGGATGTCACTGGGAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTcc < 2:52414/148‑1 (MQ=255) tCACTGGGAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGATGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCggg < 5:218393/149‑1 (MQ=255) tCACTGGGAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCgg > 1:181928/1‑148 (MQ=255) aCTGGGAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGaa > 5:168667/1‑149 (MQ=255) aCTGGGAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGaa < 5:131228/149‑1 (MQ=255) ggAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCgcgc > 4:109279/1‑135 (MQ=255) ggAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCgcgc < 3:109279/135‑1 (MQ=255) ggAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAg > 2:142637/1‑149 (MQ=255) cAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCt > 1:122066/1‑149 (MQ=255) tcatccacacgcttacgctggttctggtcatccatgctctgcgcgtggaggctcacttcggcagcggtagtgccacccagcgtggacgccacagtggcaccggatgacagcttCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCtg < 4:79517‑M1/36‑1 (MQ=255) aGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCtg < 7:185234/149‑1 (MQ=255) aGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCtg < 3:190639/149‑1 (MQ=255) tGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCgg < 2:249480/120‑1 (MQ=255) tGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCgg > 1:249480/1‑120 (MQ=255) gACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGc > 6:23154/1‑149 (MQ=255) cgccCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGc > 7:17374/1‑149 (MQ=255) gtcatccatgctctgcgcgtggaggctcacttcggcagcggtagtgccacccagcgtggacgccacagtggcaccggatgacagcttCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAg > 3:79517‑M1/88‑147 (MQ=255) gtcatccatgctctgcgcggggaggctcacttcggcagcggtagtgccacccagcgtggacgccacagtggcaccggatgacagcttCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGaa > 7:94663‑M1/88‑146 (MQ=255) cccAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTg > 6:247233/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGt > 4:151127/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGt < 8:229281/149‑1 (MQ=255) gCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATc > 8:67921/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCgg < 3:151127/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGt < 7:67921/149‑1 (MQ=255) gCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGc < 2:181928/149‑1 (MQ=255) gATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACtgtg < 5:23154/149‑1 (MQ=255) aTTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCACATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGaa > 3:252320/1‑126 (MQ=255) tCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGc < 2:122066/148‑1 (MQ=255) tcgtcCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTg < 6:168667/147‑1 (MQ=255) tcCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTgg < 5:247233/149‑1 (MQ=255) tACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCt > 1:216290/1‑149 (MQ=255) cTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTgg > 7:40511/1‑91 (MQ=255) tCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGcc > 7:115522/1‑149 (MQ=255) gACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGt > 5:108761/1‑149 (MQ=255) cGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGa < 1:142637/149‑1 (MQ=255) cccGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTc > 4:152114/1‑149 (MQ=255) cGCAAGACCACCTTGAACTACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTCCa < 8:17374/149‑1 (MQ=255) cGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGt > 4:5996/1‑140 (MQ=255) cGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGt < 3:5996/140‑1 (MQ=255) aGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTCCAcgcg < 1:243409/149‑1 (MQ=255) gAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTCCACGCGCAGAGCAt < 2:216290/147‑1 (MQ=255) aacaacACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTCCACGCGCAGAGCATgg < 8:115522/148‑1 (MQ=255) aacaCGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTCCACGCGCAGAGCATGGATGa > 2:68178/1‑149 (MQ=255) acacGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTCCACGCGCAGAGCATGGATGAc < 3:152114/149‑1 (MQ=255) | CCTCATGAACGTGGTCGGGGATGTCACTGGGAACCAGTTCAACGGCACCACTGACCAGGCCGCCCAGGCCATCGCCAGTCGATTCAACCTTCTGTCGTCCACCTCGCTACTCCGGGACGATGCCCGCAAGACCACCTTGAACAACACGCTGGTCCAGATCGCGCAGACCGGGAACAAGTCCCTGGTGGACGCGCTCCTGGCTCAGAAGCTGTCATCCGGTGCCACTGTGGCGTCCACGCTGGGTGGCACTACCGCTGCCGAAGTGAGCCTCCACGCGCAGAGCATGGATGAC > NC_002947/2609432‑2609723 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |