New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2875791 = | 34 (0.810) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | 9.0% | coding (92/1278 nt) | PP_2528 | O‑acetylhomoserine (thiol)‑lyase |
? | NC_002947 | 2875829 = | 28 (0.680) | coding (54/1278 nt) | PP_2528 | O‑acetylhomoserine (thiol)‑lyase |
CGGCCAGCGCGCCAACCCCGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCAT > NC_002947/2875648‑2875939 | cGGCCAGCGCGCCAACCCCGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCTAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACATGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAaggag < 1:48966/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCGCCAACCCCGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAggtg < 4:43195/149‑1 (MQ=255) gggaccgccagaatgatcctccttgacccatgcccactcgccgccgcatgctcgaacgcttccacccacgctcaaggaacgattgcatgaagctggaaacgcttgccatccatgcgggcttcagccccgacccgaccaccAAGGAggtg < 1:9160‑M1/9‑1 (MQ=255) gcgcCAACCCCGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTg < 5:26850/149‑1 (MQ=255) gcCAACCCCGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGt < 3:84645/149‑1 (MQ=255) aCCCCGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTgg > 1:223799/1‑144 (MQ=255) cccGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGt < 1:164632/143‑1 (MQ=255) cccGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGt > 2:164632/1‑143 (MQ=255) aGGGCGGCCATGGTCTGCGTGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCAc < 6:188974/149‑1 (MQ=255) aGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCAc < 3:184838/149‑1 (MQ=255) aGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCAc < 7:158415/149‑1 (MQ=255) gcggcCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTAGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGc > 7:19739/1‑149 (MQ=255) cccactcgccgccgcatgctcgaacgcttccacccacgctcaaggaacgattgcatgaagctggaaacgcttgccatccatgcgggcttcagccccgacccgaccaccAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTtggt > 2:9160‑M1/109‑149 (MQ=255) cccactcgccgccgcatgctcgaacgcttccacccacgctcaaggaacgattgcatgaagctggaaacgcttgccatccatgcgggcttcagccccgacccgaccaccAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTtggt < 2:42329‑M1/41‑1 (MQ=255) gccgccgcatgctcgaacgcttccacccacgctcaaggaacgattgcatgaagctggaaacgcttgccatccatgcgggcttcagccccgacccgaccaccAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTggtcgg > 1:42329‑M1/102‑148 (MQ=255) ctCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTggtcgg < 6:166686/147‑1 (MQ=255) gAGCACGTCGTTAGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTggtcgggtc < 8:19739/147‑1 (MQ=255) gtcgtTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTAAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTcgaaggcgaagg > 4:130976/1‑95 (MQ=255) gtcgtTGGTGGGGTTCATGATGAGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTcgaaggcgaagg < 3:130976/95‑1 (MQ=255) ttGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAGAGACAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGTTACGGCCACCGCATTGGTGGTCGGTTCGGGGATGAAGc > 1:59287/1‑149 (MQ=255) cATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCatggatgg > 1:128311/1‑149 (MQ=255) atgCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAg < 2:128311/149‑1 (MQ=255) gcgAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAAAAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTTTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTATTGTa > 5:74637/1‑85 (MQ=255) tGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGAGCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCtt > 7:173992/1‑148 (MQ=255) cGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTtg < 3:202280/92‑1 (MQ=255) cGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTtg > 4:202280/1‑92 (MQ=255) ccTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTc < 2:59287/149‑1 (MQ=255) cTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTcc < 4:62876/149‑1 (MQ=255) tCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCg > 4:200438/1‑149 (MQ=255) aaaCAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTcc < 2:230808/140‑1 (MQ=255) aaaCAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTAGatagtg > 1:230808/1‑144 (MQ=255) aCAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCgtggg > 3:160417/1‑149 (MQ=255) gcCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATACAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGtt > 6:210973/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGa < 2:223799/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACAGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGa < 3:200438/149‑1 (MQ=255) tcgAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGtt > 1:11891/1‑110 (MQ=255) tcgAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGtt < 2:11891/110‑1 (MQ=255) tcgAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATgcggcggc > 3:95518/1‑148 (MQ=255) gaaggcgaaggAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCCCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCAGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAg > 1:184706/1‑149 (MQ=255) aaggcgaaggAGGTGGTCTGGTAGAGCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGt < 7:240973/149‑1 (MQ=255) gcgaaggAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGAAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTgg > 1:226250/1‑148 (MQ=255) AAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCAt > 8:173992‑M1/1‑149 (MQ=255) | CGGCCAGCGCGCCAACCCCGCCTTCCAGGGCGGCCATGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCAT > NC_002947/2875648‑2875939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |