New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2875791 = | 34 (0.810) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | 9.0% | coding (92/1278 nt) | PP_2528 | O‑acetylhomoserine (thiol)‑lyase |
? | NC_002947 | 2875829 = | 28 (0.680) | coding (54/1278 nt) | PP_2528 | O‑acetylhomoserine (thiol)‑lyase |
TGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAAGGAGGATCATTCTGGCGGTCCC > NC_002947/2875684‑2875968 | cccactcgccgccgcatgctcgaacgcttccacccacgctcaaggaacgattgcatgaagctggaaacgcttgccatccatgcgggcttcagccccgacccgaccaccAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTtggt < 2:42329‑M1/41‑1 (MQ=255) cccactcgccgccgcatgctcgaacgcttccacccacgctcaaggaacgattgcatgaagctggaaacgcttgccatccatgcgggcttcagccccgacccgaccaccAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTtggt > 2:9160‑M1/109‑149 (MQ=255) gccgccgcatgctcgaacgcttccacccacgctcaaggaacgattgcatgaagctggaaacgcttgccatccatgcgggcttcagccccgacccgaccaccAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTggtcgg > 1:42329‑M1/102‑148 (MQ=255) ctCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTggtcgg < 6:166686/147‑1 (MQ=255) gAGCACGTCGTTAGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTggtcgggtc < 8:19739/147‑1 (MQ=255) ttGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAGAGACAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGTTACGGCCACCGCATTGGTGGTCGGTTCGGGGATGAAGc > 1:59287/1‑149 (MQ=255) cATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCatggatgg > 1:128311/1‑149 (MQ=255) atgCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAg < 2:128311/149‑1 (MQ=255) tGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGAGCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCtt > 7:173992/1‑148 (MQ=255) cGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTtg > 4:202280/1‑92 (MQ=255) cGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTtg < 3:202280/92‑1 (MQ=255) ccTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTc < 2:59287/149‑1 (MQ=255) cTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTcc < 4:62876/149‑1 (MQ=255) tCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCg > 4:200438/1‑149 (MQ=255) aaaCAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTcc < 2:230808/140‑1 (MQ=255) aaaCAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTAGatagtg > 1:230808/1‑144 (MQ=255) aCAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCgtggg > 3:160417/1‑149 (MQ=255) gcCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATACAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGtt > 6:210973/1‑149 (MQ=255) gTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGa < 2:223799/149‑1 (MQ=255) gTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACAGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGa < 3:200438/149‑1 (MQ=255) tcgAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGtt > 1:11891/1‑110 (MQ=255) tcgAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGtt < 2:11891/110‑1 (MQ=255) tcgAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATgcggcggc > 3:95518/1‑148 (MQ=255) ccgaccaccaaggcggtggccgtaccgatctaccagaccacctccttGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATgcggcggc > 1:42329‑M2/48‑148 (MQ=255) gaaggcgaaggAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCCCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCAGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAg > 1:184706/1‑149 (MQ=255) aaggcgaaggAGGTGGTCTGGTAGAGCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGt < 7:240973/149‑1 (MQ=255) gcgaaggAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGAAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTgg > 1:226250/1‑148 (MQ=255) accaaggcggtggccgtaccgatctaccagaccacctccttGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTggg < 2:42329‑M2/108‑1 (MQ=255) accaaggcggtggccgtaccgatctaccagaccacctccttGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTggg > 2:9160‑M2/42‑149 (MQ=255) AAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCAt > 8:173992‑M1/1‑149 (MQ=255) tCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATTCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAagga < 5:210973/149‑1 (MQ=255) gTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGTGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAAGGAGGAt > 1:130507/1‑149 (MQ=255) gTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGa < 8:197113/113‑1 (MQ=255) gTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAAggagga < 4:95518/148‑1 (MQ=255) gTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAAGGAGGAt > 8:119385/1‑149 (MQ=255) aGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAAGGAGGATCa > 1:225694/1‑149 (MQ=255) gTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAAGGAGGATCATTCTgg < 4:160417/149‑1 (MQ=255) cacctccttGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAAGGAGGATCATTCTGGCGGTccc < 1:9160‑M2/140‑1 (MQ=255) ggtggtCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATgg < 7:80394/113‑1 (MQ=255) ggtggtCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATgg > 8:80394/1‑113 (MQ=255) | TGCGCTGCTCGAGCACGTCGTTGGTGGGGTTCATGATGCGCGAATAGATGTTGCCGGCAACCTTCAG‑GTCAAACAGGTCGGCGCCGTGCTGGGTGTCGTCGAAGGCGAAGGAGGTGGTCTGGTAGATCGGTACGGCCACCGCCTTGGTGGTCGGGTCGGGGCTGAAGCCCGCATGGATGGCAAGCGTTTCCAGCTTCATGCAATCGTTCCTTGAGCGTGGGTGGAAGCGTTCGAGCATGCGGCGGCGAGTGGGCATGGGTCAAGGAGGATCATTCTGGCGGTCCC > NC_002947/2875684‑2875968 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |