New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2972458 | 36 (0.850) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | 8.3% | coding (1416/1713 nt) | PP_2600 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2972519 | 31 (0.760) | coding (1355/1713 nt) | PP_2600 | hypothetical protein |
CTCATCCAGTACACGGGCATTGCCGTCGGTGCGCAACCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTGGGCGAGCTGCTCGAGCGTAGCGCCGC > NC_002947/2972317‑2972603 | cTCATCCAGTACACGGGCATTGCCGTCGGTGCGCAACCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCCCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGc < 7:88850/149‑1 (MQ=255) tCCAGTACACGGGCATTGCCGTCGGTGCGCAACCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGtt > 4:94616/1‑149 (MQ=255) cacGGGCATTGCCGTCGGTGCGCAACCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGc > 5:147854/1‑149 (MQ=255) acGGGCATTGCCGTCGGTGCGCAACCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCg > 4:222309/1‑149 (MQ=255) acGGGCATTGCCGTCGCTGCGCAACCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACACTGCTTGCGGTTGAACGGCg > 2:76730/1‑149 (MQ=255) gTGCGCAACCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCaaa > 1:159806/1‑149 (MQ=255) aaCCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTATACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCgg < 3:144643/149‑1 (MQ=255) ccGGTAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTc > 2:232870/1‑149 (MQ=255) cGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCGTGTGCTGTGGGTCCCCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAACCGCCGGGTcc > 7:115067/1‑149 (MQ=255) ggCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCatgcccgtaacggccaggacccggcgtttggccgcggttccacgcc > 4:28835‑M1/1‑103 (MQ=255) gCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTg < 3:222309/149‑1 (MQ=255) tGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTa < 1:232870/149‑1 (MQ=255) ccAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACg > 8:153908/1‑149 (MQ=255) cAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACgg > 2:57637/1‑149 (MQ=255) aaaaCAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACggg > 2:99957/1‑149 (MQ=255) aaaaCAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACggg > 5:266590/1‑149 (MQ=255) ccGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATgggt > 7:153908‑M2/1‑145 (MQ=255) ggCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTAtt < 3:94616/149‑1 (MQ=255) gCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCatgcccgtaacggccaggacccggcgtttggccgcggttccacgccgttcaaccgcaagcagggtgacc < 7:18820‑M1/149‑70 (MQ=255) tttACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGaa < 3:162319/149‑1 (MQ=255) tACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCatgcccgtaacggccaggacccggcgtttggccgcggttccacgccgttcaaccgcaagcagggtgaccca < 3:28835‑M1/147‑72 (MQ=255) tttCACCGCATAGAACGGCCCGCGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAg > 4:242269/1‑149 (MQ=255) cACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTg < 6:266590/148‑1 (MQ=255) ccGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGAcc > 3:249786/1‑149 (MQ=255) ccGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGAcc < 1:99957/149‑1 (MQ=255) cGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCg > 5:227557/1‑149 (MQ=255) cccGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGcc > 1:138150/1‑149 (MQ=255) cccGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGcc > 2:244755/1‑149 (MQ=255) ccGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGGCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGTACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGccc < 2:240170/149‑1 (MQ=255) tCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACgg > 5:42688/1‑149 (MQ=255) aTGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTc < 2:159806/149‑1 (MQ=255) ggCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAAt < 1:57637/149‑1 (MQ=255) gCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAgg < 6:40314/149‑1 (MQ=255) ggTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTgg < 3:242269/149‑1 (MQ=255) ggTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTGGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTgg < 8:115067/149‑1 (MQ=255) gggCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTGGGCGAg > 1:197289/1‑149 (MQ=255) tgCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTGGGCGAGCTGCTCGa < 1:244755/148‑1 (MQ=255) tgCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTGGGCGAGCTGCTCGAg > 4:134276/1‑149 (MQ=255) cTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTGGGCGAGCTGCTCGAGc < 6:42688/148‑1 (MQ=255) tgtgGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTGGGCGAGCTGCTCGAGCg > 1:163814/1‑148 (MQ=255) tgGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATgggtgacccacagcacaagggccctaacccttgcgtggcgcccatcgagcacgggccgttctatgcggtgaaagta < 3:28835‑M2/147‑77 (MQ=255) ggTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATgggtgacccacagcacaagggccctaacccttgcgtggcgcccatcgagcacgggccgttctatgcggtgaaagtaaagc < 7:18820‑M2/149‑81 (MQ=255) aCCCatgcccgtaacggccaggacccggcgtttggccgcggttccacgccgttcaaccgcaagcagggtgacccacagcacaagggccctaacccttgcgtggcgcccatcgagcacgggccgttctatgcggtgaaagtaaagcccgg > 7:153908‑M1/1‑4 (MQ=255) ccTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGAcc < 3:257183/83‑1 (MQ=255) ccTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGAcc > 4:257183/1‑83 (MQ=255) | CTCATCCAGTACACGGGCATTGCCGTCGGTGCGCAACCCGGCAAAGGTGCCAAAACAGCCGGGCTTTACTTTCACCGCATAGAACGGCCCGTGCTCGATGGGCGCCACGCAAGGGTTAGGGCCCTTGTGCTGTGGGTCACCCTGCTTGCGGTTGAACGGCGTGGAACCGCGGCCAAACGCCGGGTCCTGGCCGTTACGGGCATGGGTATTGAAGTCAGTGACCGTGGCGCGCAGCCCGGACGGGTCAATGCCGCAGGCCTGGGCGAGCTGCTCGAGCGTAGCGCCGC > NC_002947/2972317‑2972603 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |