New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2986914 | 33 (0.780) | 3 (0.080) | 3/242 | NT | 12.0% | coding (1485/2991 nt) | PP_2612 | membrane protein |
? | NC_002947 | = 2986958 | 13 (0.330) | coding (1441/2991 nt) | PP_2612 | membrane protein |
GCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCC > NC_002947/2986773‑2987060 | gCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAgg > 8:231489/1‑149 (MQ=255) cATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTg > 3:77678/1‑149 (MQ=255) ttgctggcATCCCATCGGGTCTGCCCGGGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACGCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGc < 1:192196/147‑1 (MQ=255) gctggcATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGa > 6:92496/1‑149 (MQ=40) aTCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAAt < 5:153058/149‑1 (MQ=39) cATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGc > 5:138624/1‑149 (MQ=39) aTCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCt > 2:202256/1‑149 (MQ=39) gggTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCttt < 7:231489/148‑1 (MQ=39) gTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTCCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTc < 1:202256/149‑1 (MQ=255) cccGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTg < 5:80944/148‑1 (MQ=39) ccGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGaa > 2:115903/1‑149 (MQ=39) cgcgCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGATGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGGCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAAc < 8:9516/149‑1 (MQ=255) gcgcAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggca > 3:191248‑M1/1‑112 (MQ=255) gcAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACggg < 3:154807/149‑1 (MQ=39) aGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGtt < 4:201647/149‑1 (MQ=39) tCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTg > 2:178497/1‑148 (MQ=38) tCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGAGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTGGCTCGGGTTGa > 8:219738/1‑149 (MQ=255) ttGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcgg < 2:178678‑M2/149‑4 (MQ=255) caccacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgcc < 6:209008‑M2/148‑8 (MQ=255) ccacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgccagc < 4:191248‑M1/149‑55 (MQ=255) cacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAgg > 5:18297/1‑149 (MQ=37) cacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAgg > 5:202303/1‑149 (MQ=37) acGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgccagcga < 8:237648‑M1/149‑57 (MQ=255) aCCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCt > 6:246304/1‑108 (MQ=35) aCCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCt < 5:246304/108‑1 (MQ=35) aCTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCggg < 5:209008/149‑1 (MQ=34) aCTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCggg > 7:209353/1‑149 (MQ=34) gCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTc < 5:92496/149‑1 (MQ=34) tGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgcc < 8:211559‑M2/122‑8 (MQ=255) tGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgcc > 7:211559‑M2/1‑115 (MQ=255) tatCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGTCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCAt > 2:216656/1‑149 (MQ=18) tatCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCAt < 7:214351/149‑1 (MQ=33) cGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGc < 1:178678/148‑1 (MQ=32) gCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTc < 1:115903/149‑1 (MQ=32) ccATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTc > 7:186040/1‑148 (MQ=32) cATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCa < 6:18297/149‑1 (MQ=32) gAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTg > 7:247698/1‑148 (MQ=32) cGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTAGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGTCTGTCGTgg > 8:104435/1‑116 (MQ=12) cGGCGAGCCCTTCGATCTCGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCgg < 4:77678/149‑1 (MQ=17) cGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCgg < 6:202303/149‑1 (MQ=32) tCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctcaccgcccagtcggtcaataccgt < 8:237648‑M2/149‑94 (MQ=255) gCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctcaccgcccagtcggtcaataccgtgg < 4:191248‑M2/149‑96 (MQ=255) ggCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctcaccgcccagtcggtcaataccgtggtg < 6:209008‑M1/148‑142 (MQ=255) ggCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctca > 7:211559‑M1/1‑7 (MQ=255) ggCGCCGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctca < 8:211559‑M1/122‑116 (MQ=255) ccGttcaacccgttcaaggacaaagccgattcgatcggcaccttgttcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctcaccgcccagtcggtcaataccgtggtgctcaa < 2:178678‑M1/149‑147 (MQ=255) | GCCATGGCTGGCATCCCATCGGGTCTGCCCGCGCAGTCGCTTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGAC‑CGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCC > NC_002947/2986773‑2987060 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |