| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2986914 | 33 (0.780) | 3 (0.080) | 3/242 | NT | 12.0% | coding (1485/2991 nt) | PP_2612 | membrane protein |
| ? | NC_002947 | = 2986958 | 13 (0.330) | coding (1441/2991 nt) | PP_2612 | membrane protein | |||||
TTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGA > NC_002947/2986813‑2987070 | ttGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcgg < 2:178678‑M2/149‑4 (MQ=255) caccacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgcc < 6:209008‑M2/148‑8 (MQ=255) cacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAgg > 5:18297/1‑149 (MQ=37) cacGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAgg > 5:202303/1‑149 (MQ=37) aCTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCggg < 5:209008/149‑1 (MQ=34) aCTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCggg > 7:209353/1‑149 (MQ=34) gCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTc < 5:92496/149‑1 (MQ=34) tGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgcc < 8:211559‑M2/122‑8 (MQ=255) tGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgcc > 7:211559‑M2/1‑115 (MQ=255) tatCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGTCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCAt > 2:216656/1‑149 (MQ=18) tatCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCAt < 7:214351/149‑1 (MQ=33) cGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGc < 1:178678/148‑1 (MQ=32) gCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTc < 1:115903/149‑1 (MQ=32) ccATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTc > 7:186040/1‑148 (MQ=32) cATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCa < 6:18297/149‑1 (MQ=32) gAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTg > 7:247698/1‑148 (MQ=32) cGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTAGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGTCTGTCGTgg > 8:104435/1‑116 (MQ=12) cGGCGAGCCCTTCGATCTCGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCgg < 4:77678/149‑1 (MQ=17) cGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCgg < 6:202303/149‑1 (MQ=32) tCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctcaccgcccagtcggtcaataccgt < 8:237648‑M2/149‑94 (MQ=255) gCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctcaccgcccagtcggtcaataccgtgg < 4:191248‑M2/149‑96 (MQ=255) tGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAAcggcgccagcgacaacgtgatcgaagggctcgccggtcgcttcccggccatggcggatatcaccgacctcaccgcccagtcggtcaataccgtggtgctcaagcgactgcgc > 3:191248‑M2/1‑37 (MQ=255) | TTGAGCACCACGGTATTGACCGACTGGGCGGTGAGGTCGGTGATATCCGCCATGGCCGGGAAGCGACCGGCGAGCCCTTCGATCACGTTGTCGCTGGCGCCGAACAAGGTGCCGATCGAATCGGCTTTGTCCTTGAACGGGTTGAACGGCGCCAAGGCGGTGTAAAGCGGGCTGTCGTGCTGGTCCAGCCATTGCTCCAGGCGTTTGAAACGCCGGTCATGATCTTCTGTGCCGGGTGTCGGCTGGCCCATTGGGTGA > NC_002947/2986813‑2987070 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |