New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3989295 | 40 (0.950) | 5 (0.120) | 5/246 | NT | 12.3% | coding (1813/2085 nt) | oplA | 5‑oxoprolinase A |
? | NC_002947 | = 3989343 | 33 (0.820) | coding (1861/2085 nt) | oplA | 5‑oxoprolinase A |
AGTGCAGTGTGGACCTGCAGCAGCACAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCT > NC_002947/3989152‑3989440 | aGTGCAGTGTGGACCTGCAGCAGCACAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATc < 4:264439/149‑1 (MQ=255) cAGTGTGGACCTGCAGCAGCACAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGc < 3:36825/148‑1 (MQ=255) cAGTGTGGACCTGCAGCAGCACAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGc > 4:36825/1‑148 (MQ=255) aGTGTGGACCTGCAGCAGCACAGCCTGGACGAGCCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCa > 1:33088/1‑149 (MQ=255) aGTGTGGACCTGCAGCAGCACAGCCTGGACGAGCCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCa > 1:37095/1‑149 (MQ=255) tgtgGACCTGCAGCAGCACAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCAcc < 6:50255/149‑1 (MQ=255) gcagcagcaCAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTAATCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCAcgcc > 8:34357/1‑149 (MQ=255) cagcaCAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCAcgcccgcc > 5:47067/1‑149 (MQ=255) agcaCAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCccgccg < 1:18357/149‑1 (MQ=255) acaGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCaa > 6:56113/1‑149 (MQ=255) acaGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCaa > 4:68787/1‑149 (MQ=255) ccTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAAccc > 4:112100/1‑148 (MQ=255) ccTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTCGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAAccct > 8:106778/1‑148 (MQ=255) cTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAAccc > 7:15755/1‑147 (MQ=255) aGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAg < 6:47067/149‑1 (MQ=255) gCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAggg > 4:231564/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGccggcccctgcagctcgggttgcggcgggcgtggcaggtggccgatcaccga < 8:62797‑M1/149‑53 (MQ=255) gcTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGccggcccctgcagctcgggttgcggcgggcgtggcaggtggccgatcaccgagc > 1:236781‑M1/1‑92 (MQ=255) gcTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGccggcccctgcagctcgggttgcggcgggcgtggcaggtggccgatcaccgagc < 2:236781‑M1/146‑55 (MQ=255) tGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGcccccc < 8:15755/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTTCCAAATCCGGCACGATACCATGTACTAGTAAAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGATTGCTCGGTGTTCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGcccc < 2:232260/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCa > 4:208880/1‑149 (MQ=255) cTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACcg > 6:100687/1‑149 (MQ=255) aCCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGccggcccctgcagctcgggttgcggcgggcgtggcaggtggccgatcaccgag < 8:242076‑M1/119‑54 (MQ=255) aCCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGccggcccctgcagctcgggttgcggcgggcgtggcaggtggccgatcaccgag > 7:242076‑M1/1‑66 (MQ=255) ccAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGcc < 2:37095/149‑1 (MQ=255) ccAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGcc < 2:33088/149‑1 (MQ=255) aCCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGggccgg < 7:229670/109‑1 (MQ=255) aCCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGggccgg > 8:229670/1‑109 (MQ=255) aCCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGAt < 3:68787/149‑1 (MQ=255) gagTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAAACCGTCCGCCCGATGCAGTTCAg > 8:237791/3‑149 (MQ=255) gTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAg < 8:136079/85‑1 (MQ=255) gTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAg > 7:136079/1‑85 (MQ=255) gTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTg > 4:141396/1‑149 (MQ=255) aGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTTCCGa > 2:78840/1‑149 (MQ=255) aGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGa < 3:208880/149‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGt < 7:237791/149‑1 (MQ=255) ccgCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACcg < 2:133382/102‑1 (MQ=255) gTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCcac < 3:231564/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCg < 5:56113/149‑1 (MQ=255) gAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTc < 5:53694/112‑1 (MQ=255) gAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATgg > 6:124949/1‑130 (MQ=255) gAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATgg < 5:124949/130‑1 (MQ=255) ccTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCCAGCACCCCCCCCCCCCCCCGCAATCCGTCCGCCCGCTGGTGTTGAATGGCGCCCGTGAAATGCAGCCCACCCCGGTGTTCAAcc > 4:113474/1‑148 (MQ=255) cTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAAGCCGTCCGCCCGATGCGGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCCCACCGGTGttacaag > 4:152171/1‑143 (MQ=255) cTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACg < 3:152171/148‑1 (MQ=255) gCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggtgccggctgtggaagcggctgatcagc > 1:236781‑M2/1‑54 (MQ=255) gCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggtgccggctgtggaagcggctgatcagc < 2:236781‑M2/146‑93 (MQ=255) cTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggt < 8:242076‑M2/119‑67 (MQ=255) cTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggt > 7:242076‑M2/1‑53 (MQ=255) tCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggtgccggctgtggaagcggctgatcagcgcggc < 8:62797‑M2/149‑98 (MQ=255) tCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCCATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGCCGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCt > 3:213703/1‑149 (MQ=255) | AGTGCAGTGTGGACCTGCAGCAGCACAGCCTGGACGAGGCAGGGCTGGCCGCGCTGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCAGGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCT > NC_002947/3989152‑3989440 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |