New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3989295 | 40 (0.950) | 5 (0.120) | 5/246 | NT | 12.3% | coding (1813/2085 nt) | oplA | 5‑oxoprolinase A |
? | NC_002947 | = 3989343 | 33 (0.820) | coding (1861/2085 nt) | oplA | 5‑oxoprolinase A |
TGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCAC > NC_002947/3989206‑3989491 | tGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGcccccc < 8:15755/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTTCCAAATCCGGCACGATACCATGTACTAGTAAAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGATTGCTCGGTGTTCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGcccc < 2:232260/149‑1 (MQ=255) ccGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCa > 4:208880/1‑149 (MQ=255) cTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACcg > 6:100687/1‑149 (MQ=255) ccAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGcc < 2:33088/149‑1 (MQ=255) ccAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGcc < 2:37095/149‑1 (MQ=255) aCCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGggccgg < 7:229670/109‑1 (MQ=255) aCCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGggccgg > 8:229670/1‑109 (MQ=255) aCCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGAt < 3:68787/149‑1 (MQ=255) gagTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAAACCGTCCGCCCGATGCAGTTCAg > 8:237791/3‑149 (MQ=255) gTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTg > 4:141396/1‑149 (MQ=255) aGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTTCCGa > 2:78840/1‑149 (MQ=255) aGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGa < 3:208880/149‑1 (MQ=255) aaCCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGt < 7:237791/149‑1 (MQ=255) ccgCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACcg < 2:133382/102‑1 (MQ=255) gTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCcac < 3:231564/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCg < 5:56113/149‑1 (MQ=255) gAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTc < 5:53694/112‑1 (MQ=255) gAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATgg < 5:124949/130‑1 (MQ=255) gAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATgg > 6:124949/1‑130 (MQ=255) ccTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCCAGCACCCCCCCCCCCCCCCGCAATCCGTCCGCCCGCTGGTGTTGAATGGCGCCCGTGAAATGCAGCCCACCCCGGTGTTCAAcc > 4:113474/1‑148 (MQ=255) cTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCAAGCCGTCCGCCCGATGCGGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCCCACCGGTGttacaag > 4:152171/1‑143 (MQ=255) cTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACg < 3:152171/148‑1 (MQ=255) gCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggtgccggctgtggaagcggctgatcagc > 1:236781‑M2/1‑54 (MQ=255) gCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggtgccggctgtggaagcggctgatcagc < 2:236781‑M2/146‑93 (MQ=255) cTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggt > 7:242076‑M2/1‑53 (MQ=255) cTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggt < 8:242076‑M2/119‑67 (MQ=255) tCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGccgagcactccaggttcaccagctccaccgggctggcgggttcgctgtacgagtacagggtctggtgccggctgtggaagcggctgatcagcgcggc < 8:62797‑M2/149‑98 (MQ=255) tCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCCCCGCGCCATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGCCGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCt > 3:213703/1‑149 (MQ=255) aTCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCCCCCCCCCCGCGCAAAACGTCCGCCCCATGCGGTTGAGTTCCGGCCGTGAATGGCAGCCCACCCCCGGGGTAAAACGCAACCACCGGTTGcc > 4:130154/1‑149 (MQ=255) ggccagccccgccGCAACCC‑TCCTGGACGGGGCGGGCCTTGCCCCCGGCCCCCCCCGCGCAACCCGTCCG‑CCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCg < 5:100687/142‑1 (MQ=255) ccgctctcccgccGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCAGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGAc < 7:176753/141‑1 (MQ=255) gCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAACCTACACCCCAAACATGTAAGTGACGACGGTGAATGGCAGCCCACACCCGTTTTAAAAGGCAACCACCAGTTTGCGGGGCAGAccc > 8:40263/1‑148 (MQ=255) ccgccgCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTc < 2:248852/111‑1 (MQ=255) ccgccgCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTc > 1:248852/1‑111 (MQ=255) cgccgcAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGCGACCCCCCCCCCCACCGCCCAATACCGCCCCCCCATGCAGTTCAGAGCCGCCGGTGAATGGCAGCCCCCCCCGGTGTTCAACGGCAACCCCCATTTGCCTGGGGATACCCTGCAAGGc > 2:250761/1‑149 (MQ=255) gcAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCt > 7:224175/1‑149 (MQ=255) cccGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCtgtgt < 3:141396/149‑1 (MQ=255) cA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATTCTGTTCATTGCCGATGGTGTATTGCATCCCACATCGGTGTTTAAAGGCAAACACCTTTTTCCTGGGCATTCCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAg < 7:40263/147‑1 (MQ=255) cA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAg < 2:236883/147‑1 (MQ=255) a‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGaa < 3:112100/149‑1 (MQ=255) ccggccgAGCCCCCCGCACCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGacac < 1:250761/149‑1 (MQ=255) gccgAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGTCATACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGAcaccac < 3:113474/149‑1 (MQ=255) | TGATCAGCCGCTTCCACAGCCGGCACCAGACCCTGTACTCGTACAGCGAACCCGCCAGCCCGGTGGAGCTGGTGAACCTGGAGTGCTCGGTGATCGGCCACCTGCCACGCCCGCCGCAACCCGAGCTGCA‑GGGGCCGGCCGAGCCCCCCGCCCCCACCGCGCAATCCGTCCGCCCGATGCTGTTCAGTGCCGACGGTGAATGGCAGCCCACACCGGTGTTCAACGGCAACCACCTGTTGCCTGGGCAGACCGTGCATGGCCCCTGTGTGATCGAGGAAGACACCAC > NC_002947/3989206‑3989491 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |