New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4501809 = | 42 (0.990) | 4 (0.100) | 4/244 | NT | 9.4% | coding (273/672 nt) | yccA | FtsH‑mediated proteolysis substrate/modulator |
? | NC_002947 | 4501859 = | 37 (0.930) | coding (323/672 nt) | yccA | FtsH‑mediated proteolysis substrate/modulator |
GTTGCCCAGCAGATGCGCGTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTC > NC_002947/4501663‑4501956 | gaagctggcaacgagagcagccatcataacgtataagcccgcagtgatgaagccactcaggaagatcatgtccttgcgggtgatcagcacttaggccgacagaccaccaaacaccagcgcagtcatggcaaacgcggagctcactaCCt > 5:206352‑M1/147‑149 (MQ=255) gCCCAGCAGATGCGCGTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCg < 5:16225/148‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGATGCGCGTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCg < 6:123719/148‑1 (MQ=255) cccAGCAGATGCGCGTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCgg < 7:146675/148‑1 (MQ=255) cagcagATGCGCGTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGccc > 5:89358/1‑149 (MQ=255) aacgacagcgcccagcagaacgaagaagcccgcagtgatgaagccactcaggaagctcatgtccttgcgggtgatcagcacgtaggccgacagaccaccaaacaccagcgcagtcatggcaaacgcggagctcactaCCTCGGCCCGAt < 3:23998‑M1/12‑1 (MQ=255) gATGCGCGTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATcc < 4:217116/149‑1 (MQ=255) tGCGCGTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTc < 5:230666/149‑1 (MQ=255) gcgcGTCGGCTACGCGAACGTGTTCGTGGTGCTATTCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTAGGAACAAACTGCGTGATTCTGACTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTc < 5:246575/148‑1 (MQ=255) cgTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAAcc < 6:215003/149‑1 (MQ=255) gCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGGTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGttcc > 8:169224/1‑147 (MQ=255) gCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTAc < 2:234529/149‑1 (MQ=255) gCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTAc < 6:89358/149‑1 (MQ=255) gtgtTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGc > 8:243280/1‑149 (MQ=255) gtTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATg < 6:138253/145‑1 (MQ=255) gtTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATg > 5:138253/1‑145 (MQ=255) ccgcagtgatgaagccactcaggaagctcatgtccttgcgggtgatcagcacgtaggccgacagaccaccaaacaccagcgcagtcatggcaaacgcggagctcactaCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTg < 5:71270‑M1/41‑1 (MQ=255) gtggtgCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGc < 4:100980/138‑1 (MQ=255) gtggtgCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGc > 3:100980/1‑138 (MQ=255) tgCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGcc > 1:41983/1‑149 (MQ=255) cTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGa < 4:100747/149‑1 (MQ=255) aagccactcaggaagctaatgtacttgcgggtgatcagcacgtaggcctacagaccaccaaacaccagctcagtcatggaacacgcggagctcactaCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTa > 2:154007‑M1/98‑149 (MQ=255) agccactcaggaagctcatgtccttgcgggtgatcagcacgtaggccgacagaccaccaaacaccagcgcagtcatggcaaacgcggagctcactaCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAg > 6:71270‑M1/97‑149 (MQ=255) ggCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGt < 2:41983/149‑1 (MQ=255) ccactcaggaagctcatgtccttgcgggtgatcagcacgtaggccgacagaccaccaaacaccagcgcagtcatggcaaacgcggagctcactaCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTg > 4:23998‑M1/95‑149 (MQ=255) cTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAg < 7:243280/147‑1 (MQ=255) cgCTCTTCTTCCTTACCAACATACTGCGCGATTCGGCCTGTGGCCTTGAGTCCACCTTCGCTCTCACCGGTTTGATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCTTTCCCTGTGCATGGCCGGTGGGGCCGAGGTAGTGAGCTCcgcg < 6:81158/148‑1 (MQ=255) ttcttcCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGttt < 3:36432/147‑1 (MQ=255) ttcCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTTGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGa < 8:117797/125‑1 (MQ=255) ttcCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGttt > 2:11549/1‑144 (MQ=255) ttcCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGttt < 1:11549/144‑1 (MQ=255) ttcCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTAGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGa > 7:117797/1‑125 (MQ=255) ccAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTgcg > 8:57861/1‑149 (MQ=255) caaACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTgg > 8:138112/1‑149 (MQ=255) tGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCAt < 8:245287/133‑1 (MQ=255) tGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCAt > 7:245287/1‑133 (MQ=255) ggTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGc > 7:31010/1‑149 (MQ=255) gtgtCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCt > 8:37061/1‑149 (MQ=255) gtCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGa < 8:211039/149‑1 (MQ=255) cACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGACGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTATGTCGGCCTACGTGCTGAtaa > 8:208343/1‑147 (MQ=255) aCCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCAt < 5:195985/104‑1 (MQ=255) aCCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCAt > 6:195985/1‑104 (MQ=255) gcgcTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCaa < 8:31010/149‑1 (MQ=255) gcgcTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCaa < 7:57861/149‑1 (MQ=255) gcTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAg > 1:143260/1‑148 (MQ=255) gcTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAg > 7:73130/1‑148 (MQ=255) aCCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGTCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACa > 4:237717/1‑148 (MQ=255) aCCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACg > 2:2410/1‑127 (MQ=255) cGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGtt > 4:104953/1‑105 (MQ=255) cGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGa < 7:138112/149‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGTCCGTTGGCGCCGAGGTATTTAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGTTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTtc < 7:208343/149‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAg < 3:38993/125‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAg > 4:38993/1‑125 (MQ=255) | GTTGCCCAGCAGATGCGCGTCGGCTACCCGAACGTGTTCGTGGTGCTAATCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCTGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTC > NC_002947/4501663‑4501956 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |