New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4501809 = | 42 (0.990) | 4 (0.100) | 4/244 | NT | 9.4% | coding (273/672 nt) | yccA | FtsH‑mediated proteolysis substrate/modulator |
? | NC_002947 | 4501859 = | 37 (0.930) | coding (323/672 nt) | yccA | FtsH‑mediated proteolysis substrate/modulator |
TCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTCTTCGTTCTGCTGGGTGCTGTCGTTGCCAGCTTCTTC > NC_002947/4501712‑4502007 | aagccactcaggaagctaatgtacttgcgggtgatcagcacgtaggcctacagaccaccaaacaccagctcagtcatggaacacgcggagctcactaCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTa > 2:154007‑M1/98‑149 (MQ=255) agccactcaggaagctcatgtccttgcgggtgatcagcacgtaggccgacagaccaccaaacaccagcgcagtcatggcaaacgcggagctcactaCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAg > 6:71270‑M1/97‑149 (MQ=255) ggCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGt < 2:41983/149‑1 (MQ=255) ccactcaggaagctcatgtccttgcgggtgatcagcacgtaggccgacagaccaccaaacaccagcgcagtcatggcaaacgcggagctcactaCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTg > 4:23998‑M1/95‑149 (MQ=255) cTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAg < 7:243280/147‑1 (MQ=255) cgCTCTTCTTCCTTACCAACATACTGCGCGATTCGGCCTGTGGCCTTGAGTCCACCTTCGCTCTCACCGGTTTGATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCTTTCCCTGTGCATGGCCGGTGGGGCCGAGGTAGTGAGCTCcgcg < 6:81158/148‑1 (MQ=255) ttcttcCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGttt < 3:36432/147‑1 (MQ=255) ttcCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGttt < 1:11549/144‑1 (MQ=255) ttcCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGttt > 2:11549/1‑144 (MQ=255) ccAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTgcg > 8:57861/1‑149 (MQ=255) caaACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTgg > 8:138112/1‑149 (MQ=255) tGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCAt < 8:245287/133‑1 (MQ=255) tGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCAt > 7:245287/1‑133 (MQ=255) ggTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGc > 7:31010/1‑149 (MQ=255) gtgtCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCt > 8:37061/1‑149 (MQ=255) gtCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGa < 8:211039/149‑1 (MQ=255) cACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGACGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTAT‑GTCGGCCTACGTGCTGAtaa > 8:208343/1‑147 (MQ=255) aCCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCAt > 6:195985/1‑104 (MQ=255) aCCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCAt < 5:195985/104‑1 (MQ=255) gcgcTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCaa < 7:57861/149‑1 (MQ=255) gcgcTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCaa < 8:31010/149‑1 (MQ=255) gcTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAg > 7:73130/1‑148 (MQ=255) gcTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAg > 1:143260/1‑148 (MQ=255) aCCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGTCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACa > 4:237717/1‑148 (MQ=255) aCCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACg > 2:2410/1‑127 (MQ=255) cGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGtt > 4:104953/1‑105 (MQ=255) cGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGa < 7:138112/149‑1 (MQ=255) cactacctcggcgccaccggccatgcccaggtaacggttgaggatcgggccgaggTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTgg > 4:23998‑M2/56‑149 (MQ=255) ctacctcggcgccaccggccatgcccaggtaacggttgaggatcgggccgaggTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCt > 6:71270‑M2/54‑149 (MQ=255) tacctcggcgccaccggccatgcccaggtaacggttgaggatcgggccgaggTAGTGAGCTCCGCGTGTTCCATGACTGAGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTAGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGTACATTAGCTTCCTGAGTGGCtt > 2:154007‑M2/53‑149 (MQ=255) tCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGTCCGTTGGCGCCGAGGTATTTAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGTTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTtc < 7:208343/149‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAg < 3:38993/125‑1 (MQ=255) tCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAg > 4:38993/1‑125 (MQ=255) CTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTAGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTtcat < 5:97453‑M1/149‑1 (MQ=255) cGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTTTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCg < 2:143260/149‑1 (MQ=255) gATTCTGAACCGTTACCTGGGCATGGGCGGTGGGGGCGTGGTAGGTATGTCCGCGTTTGCCATGTCTGCGCTGGTGTTTTGGGGGCTCGTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGt < 1:59618/134‑1 (MQ=255) gATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGt > 2:59618/1‑133 (MQ=255) gATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCgg > 6:251548/1‑149 (MQ=255) caccggccatgcccaggtaacggttgaggatcgggccgaggTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCgg < 5:71270‑M2/108‑1 (MQ=255) tCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGcttc > 6:178449/1‑149 (MQ=255) tCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGcttc > 2:227847/1‑149 (MQ=255) aCCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCttcttc < 5:251548/149‑1 (MQ=255) cGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTCTTCGt > 5:38780/1‑149 (MQ=255) cTGGGCATGGCCGGTAGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTCTTCGTTctgct < 6:97453/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTCTTCGTTCTGCTGGGTGCTGTc < 3:237717/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTCTTCGTTCTGCTGGGTGCTGtat > 1:231291/1‑147 (MQ=255) atcgggccgaggTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTCTTCGTTCTGCTGGGCGCTGTCGtt < 3:23998‑M2/137‑1 (MQ=255) aggTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTAAGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGATCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTATACGTTATGATGGCTGCTCTCGTTGCCAGcttc > 5:206352‑M2/4‑149 (MQ=255) tAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTCTTCGTTCTGCTGGGTGCTGTCGTTGCCAGcttcttc < 1:227847/149‑1 (MQ=255) | TCGGCTTCTACGGGCTGTTCTTCCTTACCAACAAACTGCGTGATTCGGCCTGGGGCCTGGTGTCCACCTTCGCGCTCACCGGTTTCATGGGCTTCATCCTCGGCCCGATCCTCAACCGTTACCTGGGCATGGCCGGTGGCGCCGAGGTAGTGAGCTCCGCGTTTGCCATGACTGCGCTGGTGTTTGGTGGTCT‑GTCGGCCTACGTGCTGATCACCCGCAAGGACATGAGCTTCCTGAGTGGCTTCATCACTGCGGGCTTCTTCGTTCTGCTGGGTGCTGTCGTTGCCAGCTTCTTC > NC_002947/4501712‑4502007 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |