New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4520698 | 51 (1.210) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.1% | coding (1040/1257 nt) | icd | NADP(+)‑specific isocitrate dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 4520766 | 44 (1.090) | coding (972/1257 nt) | icd | NADP(+)‑specific isocitrate dehydrogenase |
GAAATCGTAGGTCACGGTCTTGGCCGCAATGGCGCCATTGGTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTA > NC_002947/4520553‑4520846 | gAAATCGTAGGTCACGGTCTTGGCCGCAATGGCGCCATTGGTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCAACCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACt > 1:118272/1‑149 (MQ=255) aaaTCGTCGGTCACGGTCTTTGCCGCACTGTCGCCATTGGTGCCCGTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCTGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGAGC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACtt < 6:230973/149‑1 (MQ=255) aaaTCGTAGGTCACGGTCTTGGCCGCAATGGCGCCATTGGTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACtt < 6:155621/149‑1 (MQ=255) gTCACGGTCTTGGCCGCAATGGCGCCATTGGTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGt > 5:153623/1‑149 (MQ=255) gTCTTGGCCGCAATGGCGCCATTGGTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATCTTCCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGt < 1:67182/149‑1 (MQ=255) tCTTGGCCGCACTGGTGCCATTGGTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCTCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGtta < 6:244023/149‑3 (MQ=255) ggTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACg < 3:116960/148‑1 (MQ=255) gTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCt > 5:238062/1‑133 (MQ=255) gTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCt < 6:238062/133‑1 (MQ=255) cTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACa > 5:157422/1‑134 (MQ=255) cTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACa < 6:157422/134‑1 (MQ=255) gatCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACGTGGCCACGGTGTCGGACAGGt > 3:14556/1‑149 (MQ=255) tgaGGTGGGCGGGGTCGGTCCACCGCTTGTGGCGCAGCATCATCTGTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTGCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGTACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTg < 5:213311/147‑1 (MQ=255) tCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTg < 1:237607/149‑1 (MQ=255) tCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTg < 6:153623/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCGGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTg < 5:244151/148‑1 (MQ=255) cAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCGGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTg > 6:244151/1‑148 (MQ=255) cAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTgg > 6:13451/1‑149 (MQ=255) ccTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGc > 2:159958/1‑148 (MQ=255) cTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATtgccccgggcgccaacctgtccgacaccgtggccatgttcgaggccactcacggcactgcgcccaagta > 6:39314‑M1/1‑80 (MQ=255) tCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCgggg < 2:62700/145‑1 (MQ=255) tCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCgggg > 1:62700/1‑145 (MQ=255) ccACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGa > 1:166652/1‑149 (MQ=255) cACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATtgccccgggcgccaacctgtccgacaccgtggccatgttcgaggccactcacggcactgcgcccaagtatgccggg < 5:39314‑M1/149‑77 (MQ=255) aCCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATa > 5:172759/1‑149 (MQ=255) ccccATGTGGCGCAGCAGCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATtgccccgggcgccaacctgtccgacaccgtggccatgttcgaggccactcacggcactgcgcccaagtatgccgggca < 4:68614‑M1/149‑79 (MQ=255) cccATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTc < 2:245520/98‑1 (MQ=255) cccATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTc > 1:245520/1‑98 (MQ=255) cccATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATAcc > 7:208323/1‑149 (MQ=255) cATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTg < 6:280/124‑1 (MQ=255) cATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTg > 5:280/1‑124 (MQ=255) aTGTGGCGCAGTATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGcc > 8:72859/1‑149 (MQ=255) tgtgGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAg < 4:168117/118‑1 (MQ=255) tgtgGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAg > 3:168117/1‑118 (MQ=255) gcgcAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACtt < 1:159958/149‑1 (MQ=255) agcaTCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGc < 2:166652/149‑1 (MQ=255) tcatcTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGa < 5:186568/74‑1 (MQ=255) tcatcTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGa > 6:186568/1‑74 (MQ=255) tcatcTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGc > 8:100302/1‑148 (MQ=255) tctGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGa > 4:162813/1‑98 (MQ=255) tctGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGa < 3:162813/98‑1 (MQ=255) ccGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGGCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCg > 5:247630/1‑149 (MQ=255) aTC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAg > 7:113274/1‑134 (MQ=255) aTC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAg < 8:113274/134‑1 (MQ=255) c‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCAt < 7:185677/137‑1 (MQ=255) c‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCAt > 8:185677/1‑137 (MQ=255) c‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGt > 4:114706/1‑149 (MQ=255) cGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCAc > 4:219894/1‑149 (MQ=255) gAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCTGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGCGGCCTCTAACATGGCCAGGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGGCAGGGCATCGGACAGGTAGTCAcc < 3:41199/149‑1 (MQ=255) ccGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgtt > 2:199320/1‑148 (MQ=255) cGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgttga < 1:15547/149‑1 (MQ=255) gggTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACGTGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgttgag < 4:14556/149‑1 (MQ=255) gggTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCgttgag < 6:172759/149‑1 (MQ=255) ccTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGttgaggttgagg < 7:100302/149‑1 (MQ=255) tGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGAACACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTg > 1:67396/1‑149 (MQ=255) tGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAatgccgggcaggacaaggtcaacccgggctcggtgatcctctcggcagagatgctgctgcgccacatgggg < 4:68614‑M2/149‑72 (MQ=255) cccGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAatgccgggcaggacaaggtcaacccgggctcggtgatcctctcggcagagatgatgctgcgccacatggggtg < 5:39314‑M2/149‑74 (MQ=255) cccGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAatgc > 2:65446‑M2/1‑76 (MQ=255) cccGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAatgc < 1:65446‑M2/80‑5 (MQ=255) cccGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATc < 2:200584/148‑1 (MQ=255) cccGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCa > 8:93128/1‑149 (MQ=255) gCATtgccccgggcgccaacctgtccgacaccgtggccatgttcgaggccactcacggcactgcgcccaagtatgccggg > 2:65446‑M1/1‑4 (MQ=255) gCATtgccccgggcgccaacctgtccgacaccgtggccatgttcgaggccactcacggcactgcgcccaagtatgccggg < 1:65446‑M1/80‑77 (MQ=255) tACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAatgccgggcaggacaaggtcaacccgggctcggtgatcctctcggcagagatgatgctgcgccacatggggtggaccgag > 6:39314‑M2/1‑69 (MQ=255) | GAAATCGTAGGTCACGGTCTTGGCCGCAATGGCGCCATTGGTGCCCTTGATGATCAGGTCGGCGGCCTCGGTCCACCCCATGTGGCGCAGCATCATCTCTGCCGAGAGGATC‑ACCGAGCCCGGGTTGACCTTGTCCTGCCCGGCATACTTGGGCGCAGTGCCGTGAGTGGCCTCGAACATGGCCACGGTGTCGGACAGGTTGGCGCCCGGGGCAATGCCGATACCGCCCACTTCTGCGGCCAGGGCATCGGACAGGTAGTCACCGTTGAGGTTGAGGGTGGCGATCACGTCGTA > NC_002947/4520553‑4520846 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |