New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4793328 | 44 (1.040) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.0% | coding (512/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | = 4793364 | 52 (1.290) | coding (476/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
ATACTGGATGGCCAGCGGCGCAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGC > NC_002947/4793180‑4793476 | aTACTGGATGGCCAGCGGCGCAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCG < 1:139650‑M1/149‑1 (MQ=255) gATGGCCAGCGGCGCAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTgc > 2:47089/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGGCGCAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCgcag < 2:192969/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGGCGCAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCgca < 3:52309/148‑1 (MQ=255) cAGCGGCGCAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCgcagc > 3:22059/1‑148 (MQ=255) cggcgCAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAgc > 3:215212/1‑149 (MQ=255) cgcAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCa > 3:212470/1‑149 (MQ=255) cAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAgcg > 2:150534/1‑145 (MQ=255) cAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGAGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAgcg < 1:150534/145‑1 (MQ=255) cTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCAt > 5:179779/1‑148 (MQ=255) gACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAg > 6:151037/1‑149 (MQ=255) gccggccACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCcgg > 5:131664/1‑149 (MQ=255) cGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGcg > 1:47089‑M2/1‑147 (MQ=255) ggccACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGccgggccgctgatgcgggtgcgcttgctgcgcacctcgg > 4:237924‑M1/1‑110 (MQ=255) cggcggCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGccgggccgctgatgcgggtgcgcttgctgcgcacctcggccacc < 3:237924‑M1/149‑45 (MQ=255) gcggcATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCCGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGccgggccgctgatgcgggggcgcttgctgcgcacctcggccaccga < 1:64271‑M1/149‑47 (MQ=255) tAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAg < 2:173520/96‑1 (MQ=255) tAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAg > 1:173520/1‑96 (MQ=255) ccGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCcg < 4:264170/124‑1 (MQ=255) ccGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCcg > 3:264170/1‑124 (MQ=255) cGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGa < 2:232044/149‑1 (MQ=255) gAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGAc > 5:206467/1‑149 (MQ=255) gAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGAc > 8:114825/1‑149 (MQ=255) gAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGAc > 7:83685/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGActc > 5:180159/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTg < 4:122968/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTg < 6:180159/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTg < 3:184867/149‑1 (MQ=255) ttCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTgcag < 4:215212/149‑1 (MQ=255) gtcgATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGcac < 6:131664/149‑1 (MQ=255) gATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATg < 5:151037/149‑1 (MQ=255) gATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCt > 5:90000/1‑149 (MQ=255) ccAGCGAACAGCCGTCGGAGATGATATGGTGCAGAGTGAACAGCAACAGGTGATCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCTGCCCGGCGGCCAAGTAGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCCGCCTCGAcc > 8:133246/1‑149 (MQ=255) ggACCCGCCGTCGGCGTTGATATGGTGCAGCGTGATCAGCAACTGGTGCGGGGTGGCCGCGGGGCGCAGCAAGCGCACCCGCTTCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGACGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACctgct < 6:179779/148‑1 (MQ=255) cAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCgg < 5:162698/133‑1 (MQ=255) cAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCgg > 6:162698/1‑133 (MQ=255) gCCGTCGGAGATGATATGGTGCAGAGTCATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGAAGCAAGAGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAACTCGAAGGGTGC‑‑CGACTACTCTGCAGCACATGCGGACTCGACCTGCTGCGCCt > 5:111539/1‑149 (MQ=255) cGTGGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTgg < 6:90000/149‑1 (MQ=255) cGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTgg < 8:83685/149‑1 (MQ=255) cGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTgcagc < 6:74281/118‑1 (MQ=255) cGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTgcagc > 5:74281/1‑118 (MQ=255) ggCGAAGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGC‑GCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTc > 8:103061/1‑149 (MQ=255) tGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAg > 5:251916/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAg < 4:22059/148‑1 (MQ=255) gTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGt < 7:114825/149‑1 (MQ=255) cAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTgg < 6:206467/148‑1 (MQ=255) gagTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGa > 7:22499/1‑148 (MQ=255) aTCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGAGGGAAAGGTc > 6:163291/1‑149 (MQ=255) aaCAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAAc < 5:74342/147‑1 (MQ=255) aaCAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAAc > 6:74342/1‑147 (MQ=255) tCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCGCCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCt > 3:243731/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCCCCCGCATCAGCGGCCCGGcggccaccgagcacctgttgctgatcactctgcaccatatcatcgccgacggcgggtcgctgggtatcctgatcgacgaactggttcggctttacgatgccgc < 1:64271‑M2/149‑104 (MQ=255) ggTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGcggccaccgagcacctgttgctgatcactctgcaccatatcatcgccgacggctggtcgctgggtatcctgatcgacgaactggttcggctttacgatgccgccg < 3:237924‑M2/149‑106 (MQ=255) gCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAAc > 4:207661/1‑132 (MQ=255) gCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAAc < 3:207661/132‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGcggccaccgagcacctgttgctgatcactctgcaccatatcatcgccgacggctggtcgctgggtatcctgatcgacgaactggttcggctttacgatgccgccgtggcc > 4:237924‑M2/1‑39 (MQ=255) cgccgggccgctgatgcgggtgcgcttgctgcgcacctcggccaccgagcacctgttgctgatcactctgcaccatatcatcgccgacggctggtcgctgggtatcctgatcgacgaactggttcggctttacgatgccgccgtggccg > 1:47089‑M1/1‑2 (MQ=255) cGAGGTGCGCAGCAAGCACACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGCCGCGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCATGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAAGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGa > 1:212514/1‑149 (MQ=255) gAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGAcgc > 8:221368/1‑149 (MQ=255) | ATACTGGATGGCCAGCGGCGCAAGTGCTGACGCCTGGCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGC > NC_002947/4793180‑4793476 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |