New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4793328 | 44 (1.040) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.0% | coding (512/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
? | NC_002947 | = 4793364 | 52 (1.290) | coding (476/6525 nt) | pvdI | non‑ribosomal peptide synthetase |
GCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTC > NC_002947/4793216‑4793506 | gccggccACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCcgg > 5:131664/1‑149 (MQ=255) cGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGcg > 1:47089‑M2/1‑147 (MQ=255) cGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGa < 2:232044/149‑1 (MQ=255) gAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGAc > 8:114825/1‑149 (MQ=255) gAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGAc > 7:83685/1‑149 (MQ=255) gAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGAc > 5:206467/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGActc > 5:180159/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTg < 3:184867/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTg < 6:180159/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTg < 4:122968/149‑1 (MQ=255) ttCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTgcag < 4:215212/149‑1 (MQ=255) gtcgATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGcac < 6:131664/149‑1 (MQ=255) gATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATg < 5:151037/149‑1 (MQ=255) gATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCt > 5:90000/1‑149 (MQ=255) ccAGCGAACAGCCGTCGGAGATGATATGGTGCAGAGTGAACAGCAACAGGTGATCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCTGCCCGGCGGCCAAGTAGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCCGCCTCGAcc > 8:133246/1‑149 (MQ=255) ggACCCGCCGTCGGCGTTGATATGGTGCAGCGTGATCAGCAACTGGTGCGGGGTGGCCGCGGGGCGCAGCAAGCGCACCCGCTTCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGACGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACctgct < 6:179779/148‑1 (MQ=255) cAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCgg > 6:162698/1‑133 (MQ=255) cAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCgg < 5:162698/133‑1 (MQ=255) gCCGTCGGAGATGATATGGTGCAGAGTCATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGAAGCAAGAGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAACTCGAAGGGTGC‑‑CGACTACTCTGCAGCACATGCGGACTCGACCTGCTGCGCCt > 5:111539/1‑149 (MQ=255) cGTGGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTgg < 6:90000/149‑1 (MQ=255) cGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTgg < 8:83685/149‑1 (MQ=255) cGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTgcagc > 5:74281/1‑118 (MQ=255) cGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTgcagc < 6:74281/118‑1 (MQ=255) ggCGAAGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGC‑GCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTc > 8:103061/1‑149 (MQ=255) tGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAg > 5:251916/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAg < 4:22059/148‑1 (MQ=255) gTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGt < 7:114825/149‑1 (MQ=255) cAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTgg < 6:206467/148‑1 (MQ=255) gagTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGa > 7:22499/1‑148 (MQ=255) aTCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGAGGGAAAGGTc > 6:163291/1‑149 (MQ=255) aaCAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAAc > 6:74342/1‑147 (MQ=255) aaCAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAAc < 5:74342/147‑1 (MQ=255) tCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCGCCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCt > 3:243731/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCCCCCGCATCAGCGGCCCGGcggccaccgagcacctgttgctgatcactctgcaccatatcatcgccgacggcgggtcgctgggtatcctgatcgacgaactggttcggctttacgatgccgc < 1:64271‑M2/149‑104 (MQ=255) ggTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGcggccaccgagcacctgttgctgatcactctgcaccatatcatcgccgacggctggtcgctgggtatcctgatcgacgaactggttcggctttacgatgccgccg < 3:237924‑M2/149‑106 (MQ=255) gCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAAc < 3:207661/132‑1 (MQ=255) gCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAAc > 4:207661/1‑132 (MQ=255) ccGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGcggccaccgagcacctgttgctgatcactctgcaccatatcatcgccgacggctggtcgctgggtatcctgatcgacgaactggttcggctttacgatgccgccgtggcc > 4:237924‑M2/1‑39 (MQ=255) cGAGGTGCGCAGCAAGCACACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGCCGCGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCATGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAAGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGa > 1:212514/1‑149 (MQ=255) gAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGAcgc > 8:221368/1‑149 (MQ=255) gTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCtgctgc > 2:45260/1‑90 (MQ=255) gTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCtgctgc < 1:45260/90‑1 (MQ=255) gcgcAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGAcgcctgcg > 2:66735/1‑149 (MQ=255) cgcAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGAcgcctgcgc < 5:163291/149‑1 (MQ=255) cagcaAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGAcgcctgcgcct > 1:68471/1‑149 (MQ=255) agcaAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCCAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACGTGCTGCGCCTGGGCCAAGCCCTGCACGTGGGAAAGGTCCAACCTCTAGCACCTGCTCGAcgcctgcgcctg > 1:84841/1‑149 (MQ=255) gcACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGt > 5:264817/1‑149 (MQ=255) aCCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTg < 7:103061/149‑1 (MQ=255) ccGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTc < 2:250920/105‑1 (MQ=255) ccGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTc > 1:250920/1‑105 (MQ=255) tCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAAGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGc < 2:212514/149‑1 (MQ=255) aGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTg < 6:251916/149‑1 (MQ=255) aGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTg < 8:22499/149‑1 (MQ=255) gCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCaa < 2:231575/100‑1 (MQ=255) gCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCaa > 1:231575/1‑100 (MQ=255) cGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGgt > 1:157862/1‑149 (MQ=255) ggCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGgtc > 8:3043/1‑149 (MQ=255) | GCCGGCCACGGCGGCATCGTAAAGCCGAACCAGTTCGTCGATCAGGATACCCAGCGACCAGCCGTCGGCGATGATATGGTGCAGAGTGATCAGCAACAGGTGCTCGGTGGCCGAGGTGCGCAGCAAGCGCACCCGCATCAGCGGCCCGGCGGCCAAGTCGAAGGGTGC‑‑CGCCGACTCTGCAGCACATGCGGCCTCGACCTGCTGCGCCTGGGCCTCGCCCTGCAGGTGGGAAAGGTCCAACATCTCGCCCCTGATCGACGCCTGCGCCTGCACGCGTTGGCGTGGCTGGTC > NC_002947/4793216‑4793506 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |