New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5520860 | 38 (0.900) | 4 (0.100) | 4/248 | NT | 9.6% | coding (926/948 nt) | lip | lipase |
? | NC_002947 | = 5520889 | 39 (0.960) | coding (897/948 nt) | lip | lipase |
ATCGCCGCCGTGGTGCTCGACGAACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGAC > NC_002947/5520714‑5520999 | aTCGCCGCCGTGGTGCTCGACGAACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCgg < 2:47254/149‑1 (MQ=255) gccgccGTGGTGCTCGACGAACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCt < 8:148437/149‑1 (MQ=255) gtgCTCGACGAACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCg < 6:128340/149‑1 (MQ=255) cTCGACGAACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTg < 7:109615/149‑1 (MQ=255) tCGACGAACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTg > 6:13183/1‑148 (MQ=255) gacgaACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGaa > 1:212703/1‑149 (MQ=255) gacgaACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGa < 3:41890/147‑1 (MQ=255) aacaacTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGcc < 2:63630/149‑1 (MQ=255) acTGGCCAGTTACCAGCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGcac < 8:90120/149‑1 (MQ=255) accaccTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGGCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGc > 1:190774/1‑117 (MQ=255) accaccTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCtgtgcggctgttcaccgaacatgcagcccggctcaagg < 5:264555‑M1/148‑39 (MQ=255) accaccTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGc < 2:190774/117‑1 (MQ=255) accTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCtgtgcggctgttcaccgaacatgcagcccggctcaaggcggc < 5:124127‑M1/149‑43 (MQ=255) tGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGc > 3:209823/1‑149 (MQ=255) gTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCACGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGcc > 2:246210/1‑148 (MQ=255) tCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCa > 3:233025/1‑149 (MQ=255) gcTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCAc < 5:33120/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCAcc < 2:212703/149‑1 (MQ=255) gCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAg > 4:98246/1‑149 (MQ=255) ctcaCCTAGCCCGCCGAAGT‑CCTGCCCGAACGCTGCACCACGCATATCCTCGGACAAGGCACTTGAGCTAATGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATCTTCGGTGCACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGc < 4:59523/146‑1 (MQ=255) cTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTg > 5:41851/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGt > 5:230528/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCATGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGtt < 1:246210/148‑1 (MQ=255) ccGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGa < 6:41851/149‑1 (MQ=255) ccGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGAt < 4:209823/149‑1 (MQ=255) cGAACGCTGGACCACTCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTTCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATc < 3:149492/149‑1 (MQ=255) gAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCAGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATc > 6:54343/1‑148 (MQ=255) cACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAAtc < 6:94664/149‑1 (MQ=255) cACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAAtc > 5:94664/1‑149 (MQ=255) gCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCTGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAAtcgtc < 5:54343/149‑1 (MQ=255) ccgccgCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCtgtgcggctgttcaccgaacatgcagcccggctcaa < 5:120427‑M1/79‑37 (MQ=255) ccgccgCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCtgtgcggctgttcaccgaacatgcagcccggctcaa > 6:120427‑M1/1‑43 (MQ=255) ccgccgCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGAt > 4:214127/1‑149 (MQ=255) gccgccAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGCCTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCa > 6:247420/1‑149 (MQ=255) cgccAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCAcc > 1:3442/1‑149 (MQ=255) gCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCa < 3:11897/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGt < 6:230528/149‑1 (MQ=255) aGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGa < 2:140226/149‑1 (MQ=255) cTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAAc < 3:214127/149‑1 (MQ=255) ccccGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAAc < 2:3442/149‑1 (MQ=255) ccccGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAAc < 2:20903/149‑1 (MQ=255) ccgccgCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCggg > 4:190776/1‑107 (MQ=255) ccgccgCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCggg < 3:190776/107‑1 (MQ=255) gccgccTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAggctcaaggcggcggggctttagctcaagtgccttggcggcggatcggcgtggtccagcgttcggccagcactacgccggccaaggtcagcaagccgccgaccaggt < 5:124127‑M2/149‑108 (MQ=255) cgccTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGa < 4:233025/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAggctcaaggcggcggggctttagctcaagtgccttggcggcggatcggcgtggtccagcgttcggccagcactacgccggccaaggtcagcaagccgccgaccaggtggt < 5:264555‑M2/148‑111 (MQ=255) ttGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAggctcaaggcggcggggctttagctcaagtgccttggcggcgg > 6:120427‑M2/1‑36 (MQ=255) ttGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAggctcaaggcggcggggctttagctcaagtgccttggcggcgg < 5:120427‑M2/79‑44 (MQ=255) | ATCGCCGCCGTGGTGCTCGACGAACAACTGGCCAGTTACCACCTGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGT‑GCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGAC > NC_002947/5520714‑5520999 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |