New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5520860 | 38 (0.900) | 4 (0.100) | 4/248 | NT | 9.6% | coding (926/948 nt) | lip | lipase |
? | NC_002947 | = 5520889 | 39 (0.960) | coding (897/948 nt) | lip | lipase |
TGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCTTTTCCTTGATGAA > NC_002947/5520757‑5521032 | tGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGc > 3:209823/1‑149 (MQ=255) gTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCACGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGcc > 2:246210/1‑148 (MQ=255) tCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCa > 3:233025/1‑149 (MQ=255) gcTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCAc < 5:33120/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCAcc < 2:212703/149‑1 (MQ=255) gCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAg > 4:98246/1‑149 (MQ=255) ctcaCCTAGCCCGCCGAAGTCCTGCCCGAACGCTGCACCACGCATATCCTCGGACAAGGCACTTGAGCTAATGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATCTTCGGTGCACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGc < 4:59523/146‑1 (MQ=255) cTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTg > 5:41851/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGt > 5:230528/1‑149 (MQ=255) gCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCATGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGtt < 1:246210/148‑1 (MQ=255) ccGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGa < 6:41851/149‑1 (MQ=255) ccGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGAt < 4:209823/149‑1 (MQ=255) cGAACGCTGGACCACTCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTTCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATc < 3:149492/149‑1 (MQ=255) gAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCAGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATc > 6:54343/1‑148 (MQ=255) cACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAAtc < 6:94664/149‑1 (MQ=255) cACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAAtc > 5:94664/1‑149 (MQ=255) gCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCTGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAAtcgtc < 5:54343/149‑1 (MQ=255) ccgccgCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGAt > 4:214127/1‑149 (MQ=255) gccgccAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGCCTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCa > 6:247420/1‑149 (MQ=255) cgccAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCAcc > 1:3442/1‑149 (MQ=255) gCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCa < 3:11897/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGt < 6:230528/149‑1 (MQ=255) aGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGa < 2:140226/149‑1 (MQ=255) cTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAAc < 3:214127/149‑1 (MQ=255) ccccGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAAc < 2:3442/149‑1 (MQ=255) ccccGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAAc < 2:20903/149‑1 (MQ=255) ccgccgCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCggg < 3:190776/107‑1 (MQ=255) ccgccgCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCggg > 4:190776/1‑107 (MQ=255) gccgccTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAggctcaaggcggcggggctttagctcaagtgccttggcggcggatcggcgtggtccagcgttcggccagcactacgccggccaaggtcagcaagccgccgaccaggt < 5:124127‑M2/149‑108 (MQ=255) cgccTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGa < 4:233025/149‑1 (MQ=255) ccTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAggctcaaggcggcggggctttagctcaagtgccttggcggcggatcggcgtggtccagcgttcggccagcactacgccggccaaggtcagcaagccgccgaccaggtggt < 5:264555‑M2/148‑111 (MQ=255) ttGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAggctcaaggcggcggggctttagctcaagtgccttggcggcgg < 5:120427‑M2/79‑44 (MQ=255) ttGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAggctcaaggcggcggggctttagctcaagtgccttggcggcgg > 6:120427‑M2/1‑36 (MQ=255) gTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGccc > 4:160275/1‑149 (MQ=255) ggggAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCttt < 6:241535/145‑1 (MQ=255) ggTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCttt < 3:160275/148‑1 (MQ=255) aaCAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCTTTTCCtt < 4:134790/149‑1 (MQ=255) cAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCTTTTCCTtga < 1:228941/149‑1 (MQ=255) gCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGcccc < 6:187656/95‑1 (MQ=255) gCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGcccc > 5:187656/1‑95 (MQ=255) gCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCTTTTcc < 1:141472/143‑1 (MQ=255) gCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCTTTTcc > 2:141472/1‑143 (MQ=255) cGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCTTTTCCTTGATGaa < 3:98246/149‑1 (MQ=255) | TGGTCGGCGGCTTGCTGACCTTGGCCGGCGTAGTGCTGGCCGAACGCTGGACCACGCCGATCCGCCGCCAAGGCACTTGAGCTAAAGCCCCGCCGCCTTGAGCCGGGCTGCATGTTCGGTGAACAGCCGCACAGGCTCCGCGCCTTTGCCCACGGCACCGAGCGACTGGTTGACGATGTCCAGGTGATCGAGCGGGTAATCGTCGCCGATCACCTGCCCCAGGTGCGAACTGAAACGCCCGACCATGCCGTCGCAATGGCCCTTTTCCTTGATGAA > NC_002947/5520757‑5521032 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |