New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5586657 | 33 (0.780) | 4 (0.100) | 4/248 | NT | 9.0% | coding (629/1026 nt) | PP_4914 | phytase‑like protein |
? | NC_002947 | = 5586716 | 49 (1.210) | coding (570/1026 nt) | PP_4914 | phytase‑like protein |
TTACGTTCGAGGGTAAACAGCTTGCCCTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGC > NC_002947/5586510‑5586797 | ttACGTTCGAGGGTAAACAGCTTGCCCTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGa < 7:168526/149‑1 (MQ=255) ttACGTTCGAGGGTAAACAGATTGCCCTCGAACCAGGCCATGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCACGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGa < 7:167195/149‑1 (MQ=255) gAGGGTAAACAGCTTGCCCTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTgg < 8:101402/148‑1 (MQ=255) gAGGGTAAACAGCTTGCCCTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACACTACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGgc < 6:219015/149‑1 (MQ=255) gggTAAACAGCTTGCCCTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGCCCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGgcgc < 5:117130/149‑1 (MQ=255) gTAAACAGCTTGCCCTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGGGCGGGTTGCATTTCTACCCCCGCCTCGCTCTGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTc < 5:158829/149‑1 (MQ=255) aCAGCTTGCCCTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATg > 6:135665/1‑149 (MQ=255) cTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGCCCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGc > 1:121864/1‑149 (MQ=255) cTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGActg > 8:248968/1‑126 (MQ=255) cTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGActg < 7:248968/126‑1 (MQ=255) tCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGcc > 7:204060/1‑149 (MQ=255) aaCCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCatc < 1:52998/149‑3 (MQ=255) caggccaggTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGgcg > 3:146684/1‑149 (MQ=255) gccgtccaGTCCCGCGCCAGTGCCCTGGCATTGGGCACCCGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTc < 4:137635/142‑1 (MQ=255) aGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCgg > 5:11232/1‑149 (MQ=255) gcgcgACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCagccagcc > 4:81271/1‑149 (MQ=255) cgcgACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCAc < 2:132216/124‑1 (MQ=255) cgcgACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCAc > 1:132216/1‑124 (MQ=255) ccTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCAc < 8:204060/149‑1 (MQ=255) cTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCAcc < 4:146684/149‑1 (MQ=255) tGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGcctgtggctggctgccgagcgtgagcgccgacgcctggtggccatcgagcgccagcagtcggtctgga > 3:82567‑M1/1‑81 (MQ=255) cagggggcatcTGCGCGGGTTGCAGTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGcctgtggctggctgccgagcgggagcgccgtggcctggtggccatcgagcgccagcagtcggtctggacct < 4:82567‑M1/145‑72 (MQ=255) aTTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACccgccg < 1:53465/149‑1 (MQ=255) ttGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCgg < 8:11226/149‑1 (MQ=255) gggCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCggg < 4:231832/148‑1 (MQ=255) cgcgGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGACGGTCACCCGCCGGGTTGATCGcc > 6:87677/1‑148 (MQ=255) gcgGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGACGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCaa < 5:87677/149‑1 (MQ=255) ttCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGcctgtggctggctgccgagcgtgagcgccgtggcctggtggccatcgagcgccagcagtcggtct > 3:152003‑M1/1‑53 (MQ=255) ttCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGcctgtggctggctgccgagcgtgagcgccgtggcctggtggccatcgagcgccagcagtcggtct < 4:152003‑M1/118‑66 (MQ=255) gACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAgg < 5:135665/148‑1 (MQ=255) ccGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCAtt > 8:64480/1‑148 (MQ=255) cGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGtt > 3:10800/1‑148 (MQ=255) cagcaCGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAgcagca > 2:82935/1‑149 (MQ=255) gCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGGCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGc > 1:220651/1‑149 (MQ=255) aaCCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCCCAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCtt > 7:113500/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGc > 5:174109/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCGAAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACAAGGCCACGGCGATAAAGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTAGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCAGATTGc > 2:71436/1‑149 (MQ=255) gCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAg < 5:15167/125‑1 (MQ=255) gCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAg > 6:15167/1‑125 (MQ=255) cAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTg < 7:64480/149‑1 (MQ=255) cAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTg < 3:99076/149‑1 (MQ=255) aGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCCCGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcggtctggacctgcgggcgtggttgcgtgctgctgagcgaggcgggggtcgaactgcaacccgcgcagatgccccctg < 4:82567‑M2/149‑79 (MQ=255) tCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCGTCGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcggtctggacctgcgggcgtggttgcgtgctgctgagcgaggcgggggtcgaaatgcaacccgcgcagatgcccaatgcca > 3:82567‑M2/1‑68 (MQ=255) cAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcg < 3:24685‑M2/68‑3 (MQ=255) cAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcg > 4:24685‑M2/1‑66 (MQ=255) aGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcggtctggacctgcgggcgtggttgcgtgctgctgagcgaggcgggggtcgaa > 3:152003‑M2/1‑65 (MQ=255) aGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcggtctggacctgcgggcgtggttgcgtgctgctgagcgaggcgggggtcgaa < 4:152003‑M2/118‑54 (MQ=255) gACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCgg > 8:118204/1‑136 (MQ=255) gACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCgg < 7:118204/136‑1 (MQ=255) cGcctgtggctggctgccgagcgtgagcgccgtggcctggtggccatcgagcgccagcagtcggtctg < 3:24685‑M1/68‑67 (MQ=255) cGcctgtggctggctgccgagcgtgagcgccgtggcctggtggccatcgagcgccagcagtcggtctg > 4:24685‑M1/1‑2 (MQ=255) cGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATc > 2:146716/1‑82 (MQ=255) cGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATc < 1:146716/82‑1 (MQ=255) cGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTc > 2:149490/1‑93 (MQ=255) cGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTc < 1:149490/93‑1 (MQ=255) | TTACGTTCGAGGGTAAACAGCTTGCCCTCGAACCAGGCCAGGTCAGCGAAGTCGCGCGACAGGGCCCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGC > NC_002947/5586510‑5586797 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |