New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5586657 | 33 (0.780) | 4 (0.100) | 4/248 | NT | 9.0% | coding (629/1026 nt) | PP_4914 | phytase‑like protein |
? | NC_002947 | = 5586716 | 49 (1.210) | coding (570/1026 nt) | PP_4914 | phytase‑like protein |
CCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCGGCAATTGCAGCACCGCG > NC_002947/5586575‑5586860 | ccTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCAc < 8:204060/149‑1 (MQ=255) cTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCAcc < 4:146684/149‑1 (MQ=255) aTTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACccgccg < 1:53465/149‑1 (MQ=255) ttGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCgg < 8:11226/149‑1 (MQ=255) gggCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCggg < 4:231832/148‑1 (MQ=255) cgcgGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGACGGTCACCCGCCGGGTTGATCGcc > 6:87677/1‑148 (MQ=255) gcgGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGACGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCaa < 5:87677/149‑1 (MQ=255) gACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAgg < 5:135665/148‑1 (MQ=255) ccGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCAtt > 8:64480/1‑148 (MQ=255) cGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGtt > 3:10800/1‑148 (MQ=255) cagcaCGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAgcagca > 2:82935/1‑149 (MQ=255) gCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGGCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGc > 1:220651/1‑149 (MQ=255) aaCCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCCCAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCtt > 7:113500/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGc > 5:174109/1‑149 (MQ=255) ccACGCCCGAAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACAAGGCCACGGCGATAAAGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTAGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCAGATTGc > 2:71436/1‑149 (MQ=255) gCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAg < 5:15167/125‑1 (MQ=255) gCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAg > 6:15167/1‑125 (MQ=255) cAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTg < 3:99076/149‑1 (MQ=255) cAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTg < 7:64480/149‑1 (MQ=255) aGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCCCGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcggtctggacctgcgggcgtggttgcgtgctgctgagcgaggcgggggtcgaactgcaacccgcgcagatgccccctg < 4:82567‑M2/149‑79 (MQ=255) tCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCGTCGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcggtctggacctgcgggcgtggttgcgtgctgctgagcgaggcgggggtcgaaatgcaacccgcgcagatgcccaatgcca > 3:82567‑M2/1‑68 (MQ=255) cAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcg < 3:24685‑M2/68‑3 (MQ=255) cAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcg > 4:24685‑M2/1‑66 (MQ=255) aGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcggtctggacctgcgggcgtggttgcgtgctgctgagcgaggcgggggtcgaa > 3:152003‑M2/1‑65 (MQ=255) aGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGcggtctggacctgcgggcgtggttgcgtgctgctgagcgaggcgggggtcgaa < 4:152003‑M2/118‑54 (MQ=255) gACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCgg < 7:118204/136‑1 (MQ=255) gACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCgg > 8:118204/1‑136 (MQ=255) cGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATc < 1:146716/82‑1 (MQ=255) cGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATc > 2:146716/1‑82 (MQ=255) cGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTc < 1:149490/93‑1 (MQ=255) cGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTc > 2:149490/1‑93 (MQ=255) ctgGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGc > 5:188689/1‑144 (MQ=255) ctgGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGc < 6:188689/144‑1 (MQ=255) ctgGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGt < 1:82935/149‑1 (MQ=255) gcgcTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGtt < 8:93251/102‑1 (MQ=255) gcTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATc > 7:125841/1‑149 (MQ=255) gATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGc > 6:37648/1‑148 (MQ=255) gATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGc > 8:34684/1‑148 (MQ=255) tGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAAc < 2:220651/149‑1 (MQ=255) caccaGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGt > 2:122748/1‑149 (MQ=255) ccaGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTcc < 1:71436/149‑1 (MQ=255) ccaGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTcc > 7:56416/1‑149 (MQ=255) ccaGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTcc < 1:122748/149‑1 (MQ=255) aGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCgg > 5:24833/1‑149 (MQ=255) aCGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCTACCAGTCCGGCTCGc > 2:37236/1‑149 (MQ=255) ggCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCTACCAGTCCGGCTCGCCt < 1:37236/149‑1 (MQ=255) aCGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGTCTTCCAGCg < 6:24833/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACTCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCgg > 6:172252/1‑148 (MQ=255) gCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCgg > 7:175239/1‑148 (MQ=255) gCTAGGCAGCCAGCCACAGGCGCTAACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCACGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCgc > 6:213807/1‑147 (MQ=255) ggCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGTGGCAAt < 8:125841/148‑1 (MQ=255) agccagccACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGTGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGc < 5:25655/131‑1 (MQ=255) agccagccACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCGGCAATTgca < 3:81271/149‑1 (MQ=255) agccagccACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGCGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGc > 6:25655/1‑131 (MQ=255) ccagccaCAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCAGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCGGCAATTgcag > 2:86825/1‑148 (MQ=255) cagcctCAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCGGCAATTgcagca > 1:255648/1‑149 (MQ=255) cagccaCAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCGGCAATTgcagca > 7:69385/1‑149 (MQ=255) acaGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCGGCAATTGCAGCACcgcg < 5:172252/149‑1 (MQ=255) | CCTGGCATTGGGCATCTGCGCGGGTTGCATTTCGACCCCCGCCTCGCTCAGCAGCACGCAACCACGCCCGCAGGTCCAGACCGACTGCTGGCGCTCGATGGCCACCAGGCCACGGCGCTCACGCTCGGCAGCCAGCCACAGGCGGTCACCCGCCGGGTTGATCGCCAAACCTTCGAACAGGGCATTGAAGTTCAGCAGCATGCCGCTTGCCCGGGCCTGGCGCACCATGGCCGAGTCGATCCGCAACCAGTCCGGCTCGCCTTCCAGCGGCAATTGCAGCACCGCG > NC_002947/5586575‑5586860 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |