New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6172767 = | 45 (1.070) | 4 (0.100) | 4/236 | NT | 7.3% | coding (315/777 nt) | PP_5410 | DeoR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 6172834 = | 61 (1.580) | coding (248/777 nt) | PP_5410 | DeoR family transcriptional regulator |
GCCCTGGAACGATTCGGAATGCGGGTCCCAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCGGCACAGCACCAC > NC_002947/6172620‑6172912 | gCCCTGGAACGATTCGGAATGCGGGTCCCAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCAtt < 2:121265/148‑1 (MQ=255) ctcggaagtgaccattcgcaaagacctcgccgccttggaaaccaacggcttgttgttacgccgctacggtggtgcagttccggtaacgcaatatttgaaaggttaaacggcacaacccgtctcttactataaaaatgacaatgcgcgtt < 8:219672‑M1/2‑2 (MQ=255) ccTGGAACGATTCGGAATGCGGGTCCCAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGACCCAGTTCGGGGATCATTgcc > 6:118026/1‑149 (MQ=255) aagtgaccattcgcaaagacctcgccgccttggaaacaaacggcttgttgttacgccgctacggtggtgctgtgccggtaccgcaagagttgctcggtgaaccggcacaacccgtctcttcctataaaaaggccattgcgcgTgccgcc < 2:99726‑M1/7‑1 (MQ=255) gAACGATTCGGAATGCGGGTCCCAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGccgccg > 4:165349/1‑149 (MQ=255) tgaccattcgcaaagacctcgccgccttggaaaccaacggcttgttgttacgccgctacggtggtgctgtgccggtaccgcaagagttgctcggtgaaccggcacaacccgtctcttcctataaaaaggccattgcgcgTGCCGCCgtg > 6:130973‑M1/140‑149 (MQ=255) accattcgcaaagacctcgccgccttggaaaccaacggcttgttgttacgccgctacggtggtgctgtgccggtaccgcaagagttgctcggtgaaccggcacaacccgtctcttcctataaaaaggccattgcgcgTGCCGCCgtgg > 4:253692‑M1/138‑148 (MQ=255) gggTCCCAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTc > 7:13583/1‑149 (MQ=255) gTCCCAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCTCCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCga > 3:247930/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTgccgcc < 7:58645/126‑1 (MQ=255) cAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTgccgcc > 8:58645/1‑126 (MQ=255) aGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTGgaggat > 7:133031/1‑148 (MQ=255) gggcaaCCTGTCATCAGCAGCACAGGGTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGTCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCTCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAAt < 5:322/144‑1 (MQ=255) ttggaaaccaacggcttgttgttacgccgctacggtggtgctgtgccggtaccgcaagagttgctcggtgaaccggcacaacccgtctcttcctataaaaaggccattgcgcgTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATgcg < 6:114539‑M1/36‑1 (MQ=255) cGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCa > 4:140563/1‑149 (MQ=255) ggTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCAGTGGTGCTGCCGCTGTCGATCATAATGCGCGCAt > 1:211217/1‑149 (MQ=255) aacggcttgttgttatgccgctacggtggtgctgtgccggtaccgcaagagttgctcggtgaaccggcacaacccgtctcttcctataaaaaggccattgcgcgTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTc < 5:204211‑M1/45‑1 (MQ=255) cagcagCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTcgc > 2:7829/1‑149 (MQ=255) agcagcCCCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGCGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTcgc < 6:223878/148‑1 (MQ=255) ccgctacggtggtgctgtgccggtaccgcaagagttgctcggtgaaccggcacaacccgtctcttcctataaaaaggccattgcgcgTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCAcg > 6:204211‑M1/88‑148 (MQ=255) cgctacggtggtgctgtgccggtaccgcaagagttgctcggtgaaccggcacaacccgtctcttcctataaaaaggccattgcgcgTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCAcggc > 5:114539‑M1/87‑149 (MQ=255) cAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCa > 8:58921/1‑147 (MQ=255) cAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGGCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCa < 7:58921/147‑1 (MQ=255) ttGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGc < 8:13583/148‑1 (MQ=255) atGCACGGGCCACATTGAGCGAATAGGACATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGcc < 8:181298/148‑1 (MQ=255) tGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCt > 5:228550/1‑149 (MQ=255) aCGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCtttt > 6:133185/1‑149 (MQ=255) gCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTtata < 6:100777/149‑1 (MQ=255) gCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTta > 5:94753/1‑147 (MQ=255) gCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTta > 3:113435/1‑147 (MQ=255) gCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTCGCTGGCGCCCCAGTTCGGCGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCAACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTta > 6:10996/1‑147 (MQ=255) gacaTTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAg > 6:51962/2‑148 (MQ=255) tGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGaa > 8:20270/1‑146 (MQ=255) gAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAgaga > 8:136222/1‑149 (MQ=255) gTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGGCGCTGTCGATGATAATGAGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGc > 5:188099/1‑149 (MQ=255) tcatcaCCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGcc > 3:122982/1‑149 (MQ=255) atcaCCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCgg > 2:83453/1‑149 (MQ=255) atcaCCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCgg < 6:228550/149‑1 (MQ=255) caccaGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAAt > 2:125060/1‑111 (MQ=255) caccaGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAAt < 1:125060/111‑1 (MQ=255) caccaGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCAc > 1:99726/1‑149 (MQ=255) aGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAg < 8:133031/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGc > 4:222704/1‑148 (MQ=255) ctggctggCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCACAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAAc < 5:17268/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCAGTTCGGGGATAATTGCCGACGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGACGGTTCACCGAGCAACTCTTGc < 2:211217/148‑1 (MQ=255) cccAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGAAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGACGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTAc < 1:7829/149‑1 (MQ=255) ccAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGtt < 8:66397/117‑1 (MQ=255) ccAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGtt > 7:66397/1‑117 (MQ=255) ccAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTAcc < 5:10996/149‑1 (MQ=255) cAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCg > 7:219672/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCg > 7:141568/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCg > 2:263272/1‑149 (MQ=255) gTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCGGc < 3:165349/149‑1 (MQ=255) gTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCGGc < 1:263272/149‑1 (MQ=255) ggggATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCGGCACAg < 6:94753/149‑1 (MQ=255) tCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCGGCACAGcacca < 4:122982/149‑1 (MQ=255) aTTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCGGCACAGcaccac < 5:92961/148‑1 (MQ=255) | GCCCTGGAACGATTCGGAATGCGGGTCCCAGGTGCCACCGGTCATCAGCAGCACCGGCTCGTGTTCGAGGTCGCAGATTGCACGGGCCACATTGAGCGAATTGGTCATCACCACCAGGCCTGGCTGGCGCCCCAGTTCGGGGATCATTGCCGCCGTGGTGCTGCCGCTGTCGATGATAATGCGCGCATGTTCGCGGATACGCCCCACGGCGGCACGCGCAATGGCCTTTTTATAGGAAGAGACGGGTTGTGCCGGTTCACCGAGCAACTCTTGCGGTACCGGCACAGCACCAC > NC_002947/6172620‑6172912 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |