New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 426730 | 44 (1.040) | 4 (0.100) | 4/246 | NT | 8.8% | coding (1069/2433 nt) | PP_0350 | ferrichrome‑iron receptor |
? | NC_002947 | = 426754 | 41 (1.020) | coding (1045/2433 nt) | PP_0350 | ferrichrome‑iron receptor |
TCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTGGGTGCCACTGTCACGAATAACGCCACTGAC > NC_002947/426606‑426901 | tCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCtggt < 1:182501/149‑1 (MQ=255) aTGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcac > 2:70759‑M2/1‑143 (MQ=255) cGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGt < 6:214291/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCAc > 7:51080/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCAc > 5:55122/1‑149 (MQ=255) gCGTCACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCCCGGGt < 7:242870/149‑1 (MQ=255) gCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGt < 5:67796/149‑1 (MQ=255) gcgcGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAAGTCTTAATCCGGGTCACGCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCGGAACGGCATGTCGATCTTTGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTg < 6:55122/149‑1 (MQ=255) cgcgTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGa < 5:210477/149‑1 (MQ=255) taAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGt > 3:56277/1‑149 (MQ=255) tGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAAATGGGTGAGGAAGGTAAGc > 8:95708/1‑149 (MQ=255) gCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGa < 6:230218/137‑1 (MQ=255) ggTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGcgtc > 7:90174/1‑149 (MQ=255) tCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGcgtcgt < 8:51080/149‑1 (MQ=255) tCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGcgtcgt < 5:114201/149‑1 (MQ=255) tAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTc < 2:130493/149‑1 (MQ=255) aGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGt < 8:158140/106‑1 (MQ=255) aGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGt > 7:158140/1‑106 (MQ=255) tCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGt > 4:39332/1‑148 (MQ=255) gTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCACTGGATGGGCCTGAACTGTCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCa > 2:266923/1‑148 (MQ=255) tCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGt > 6:203446/1‑148 (MQ=255) cGGGTCACCCAGGTTCTTGTTGTGCGAGATCTTGCAGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGTTGAACTTGGTGAGGAAGGTCAGCGTCTTGTCTTCGTCAATGTTc < 1:266923/148‑1 (MQ=255) ggTCACCCAGGTTCTTGTTGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAg < 4:56277/149‑1 (MQ=255) ccAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAgg > 8:32417/1‑149 (MQ=255) cAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGc > 8:209296/1‑149 (MQ=255) ttCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTgg < 7:32417/149‑1 (MQ=255) tCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGcgtc > 1:16341/1‑116 (MQ=255) tCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGcgtc < 2:16341/116‑1 (MQ=255) cTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTggg < 3:39332/148‑1 (MQ=255) gtggtgCGAGATCTTGCCGAACGGCACGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTggg > 2:102974/1‑145 (MQ=255) gtggtgCGAGATCTTGCCGAACGGCACGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTggg < 1:102974/145‑1 (MQ=255) tggtgCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGTGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAAt < 7:95708/149‑1 (MQ=255) tggtgCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAAt < 5:95021/149‑1 (MQ=255) gtgCTAGATCTTGCCTAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGTAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAAtg < 8:90619/148‑1 (MQ=255) gagaTCTTGCCGAACGGCATGTCTATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTa < 4:163939/149‑1 (MQ=255) cGAACGGCATGTCGATCTTGTTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGTTATCGTCACGGGAGAACTGGGTGATTAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAAAGTTCCAGGTCAGTGTTGGGGCAATGTTGTATCGAttagtg > 8:195826/1‑145 (MQ=255) cGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCttgttg > 8:37157/1‑149 (MQ=255) aaCGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTc > 5:9759/1‑149 (MQ=255) aCGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCg < 6:9759/149‑1 (MQ=255) gATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATc > 4:197392/1‑48 (MQ=255) gATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGa > 1:166496/1‑149 (MQ=255) aTCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttac > 4:153836‑M2/1‑35 (MQ=255) aTCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttac < 3:153836‑M2/122‑88 (MQ=255) tCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTCGCTTGTggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacatactacgcgctgggatacgcattcgaacacc < 4:79364‑M2/149‑116 (MQ=255) ttGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTggcaccaagatcgacatgccgttcggcaagatctcgcaccacaagaacctgggtgacccggattacgagttctacgaccgcacttactacgcgctgggttacgccttcgaacaccg < 6:178052‑M2/148‑117 (MQ=255) ggCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTGGGTGCCACTGTCAc < 5:203446/148‑1 (MQ=255) ccGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTgg < 3:203235/133‑1 (MQ=255) ccGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGATTTCTATGTGGTCGATTTGGGTGCCACTGTCACGaa > 4:235837/1‑149 (MQ=255) ccGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTATTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTgg > 4:203235/1‑133 (MQ=255) aCTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTGGGTGCCACTGTCACGAATAAc < 8:90174/148‑1 (MQ=255) gtggCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTGGGTGCCACTGTCACGAATAACGCCACTGAc > 4:263980/1‑149 (MQ=255) gtggCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTGGGTGCCACTGTCACGAATAACGCCACTGAc > 4:14359/1‑149 (MQ=255) | TCATTGATGCGGTGTTCGAAGGCGTAACCCAGCGCGTAGTAAGTGCGGTCGTAGAACTCGTAATCCGGGTCACCCAGGTTCTTGTGGTGCGAGATCTTGCCGAACGGCATGTCGATCTTGGTGCCCTGGATGGGCCGGAACTGGCTGGTGGCACCGGTATCGTCACGGGTGAACTGGGTGAGGAAGGTCAGCGTCGTGTCTTCGTCAATGTTCCAGGTCAGGCTTGGGGCAATGTTGTAGCGCTTGTTGTCGATGTGGTCGATTTGGGTGCCACTGTCACGAATAACGCCACTGAC > NC_002947/426606‑426901 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |