New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 604803 | 47 (1.110) | 3 (0.070) | 3/246 | NT | 6.6% | coding (116/969 nt) | thiL | thiamin monophosphate kinase |
? | NC_002947 | = 604838 | 40 (0.990) | coding (151/969 nt) | thiL | thiamin monophosphate kinase |
AGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCT > NC_002947/604695‑604978 | aggtCGAGCTGAGCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGAGGCGCTGGGTATCGGCGACGACGGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCggg < 5:7115/146‑1 (MQ=255) gTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGccgggg < 4:112961‑M2/149‑7 (MQ=255) ttCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGt < 1:173144/149‑1 (MQ=255) ttCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGt > 1:259646/1‑149 (MQ=255) ttCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGt < 2:29421/149‑1 (MQ=255) gAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGtac > 2:253426/1‑146 (MQ=255) aTCAACCATTACTTCGCCGCAGAGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCTACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTc < 4:49458/148‑1 (MQ=255) tgacacATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGATGGCGTGGCGCTGTGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCct < 7:223534/144‑1 (MQ=255) tCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCct > 3:146246/1‑149 (MQ=255) aaCCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCctg < 6:217260/148‑1 (MQ=255) ccATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCctgctg > 5:243456/1‑149 (MQ=255) cATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGccg < 7:62877‑M2/130‑4 (MQ=255) cATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGccg > 8:62877‑M2/1‑127 (MQ=255) ttACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGttt > 3:213727/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGccg < 5:189073‑M2/124‑4 (MQ=255) ttCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGccg > 6:189073‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTg < 1:162923/149‑1 (MQ=255) cgcAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCTCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGGCCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAg > 6:149456/1‑149 (MQ=255) aGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTc > 5:89676/1‑114 (MQ=255) aGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTc < 6:89676/114‑1 (MQ=255) cggcgAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGcgttcgt < 2:259646/149‑1 (MQ=255) cgAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTgg < 6:243456/149‑1 (MQ=255) cgAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTgg < 4:214348/149‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTggc < 4:213727/149‑1 (MQ=255) gcTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCa < 5:149456/149‑1 (MQ=255) cTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGc > 7:169657/1‑127 (MQ=255) cTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGc < 8:169657/127‑1 (MQ=255) tATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGAcc > 6:227055/1‑149 (MQ=255) tCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCt < 1:177472/148‑1 (MQ=255) tCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTg > 1:128008/1‑149 (MQ=255) gacTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGAAATTTCCTGATGTTTGAGATCCGTTGGTGATTGGCAAGCGTTGGTTGGGTGTGGCGGCAAGTGACAGGGCAGcaag > 8:165886/1‑146 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGCCCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATggg > 6:237775/1‑149 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGc > 4:33447/1‑140 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGc < 3:33447/140‑1 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATggg > 7:69453/1‑149 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGATGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATggg > 2:151462/1‑149 (MQ=255) cgcCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATggg < 8:69453/147‑1 (MQ=255) ccTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGa > 2:65523/1‑149 (MQ=255) gctgGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCctg < 7:31579/71‑1 (MQ=255) gctgGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCctg > 8:31579/1‑71 (MQ=255) aCCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATc < 1:151462/149‑1 (MQ=255) aCCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCATTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATc < 2:230784/149‑1 (MQ=255) ttCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGccggggggaaggtccagcagggcgcagtcgtcgccgatacccagcgccacgccctcgccgccctgcgcacagggcgctgcggcgaagtaatggttgatcagctc < 7:21170‑M2/149‑105 (MQ=255) gtCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTCGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGc < 1:42092/148‑1 (MQ=255) ccGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGccggggggaaggtccagcagggcgcagtcgtcgccgatacccagcgccacgccctcgccgccctgcgcacagggcgctgcggcgaagtaatggt < 7:46918‑M2/133‑95 (MQ=255) ccGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGccggggggaaggtccagcagggcgcagtcgtcgccgatacccagcgccacgccctcgccgccctgcgcacagggcgctgcggcgaagtaatggt > 8:46918‑M2/1‑39 (MQ=255) cTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGAc < 2:128008/149‑1 (MQ=255) tGGGGGTGTCGACCGTCACCCGTGTGGCCGGGGTTCACTTTTCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGAcc < 7:165886/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGTTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGAccc < 4:146246/148‑1 (MQ=255) gCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGAccc < 1:27769/148‑1 (MQ=255) agggTGTCGGTCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACcct > 8:179231/3‑149 (MQ=255) gaccgacACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACg > 1:88065/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCt > 1:95811/1‑148 (MQ=255) | AGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGCCTGACGTTGGCCCT > NC_002947/604695‑604978 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |