New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1090134 | 38 (0.900) | 6 (0.150) | 4/242 | NT | 15.1% | coding (995/1380 nt) | fumC‑I | class 2 fumarate hydratase |
? | NC_002947 | = 1090156 | 32 (0.810) | coding (1017/1380 nt) | fumC‑I | class 2 fumarate hydratase |
CGCTGGATGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTC > NC_002947/1090010‑1090303 | cgcTGGATGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACgc > 1:105803‑M2/1‑147 (MQ=255) ggATGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACgcgac < 5:222812‑M2/148‑6 (MQ=255) gATGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACgcgacca < 3:27636‑M2/149‑8 (MQ=255) tGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATc < 1:158006/149‑1 (MQ=255) tCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGt > 1:256691/1‑149 (MQ=255) gCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAg > 8:11781/1‑142 (MQ=255) gCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAg < 7:11781/142‑1 (MQ=255) gCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAACCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGc > 6:128181/1‑149 (MQ=255) gTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGt < 2:256691/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTc > 5:206005/1‑142 (MQ=255) cGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTc < 6:206005/142‑1 (MQ=255) aGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGACAGGCAAGGTCAACCCGGTGATACCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGAGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTAAACCCCGTAACTTCGAGCTCAAc > 6:164901/1‑149 (MQ=255) cAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGAt > 3:204771/1‑149 (MQ=255) aaGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATTCCAGGCAAGGTCAACCCGGGGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGAtg < 6:165732/149‑1 (MQ=255) aaGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGAtg < 4:27636/149‑1 (MQ=255) gCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGAtgct < 4:204771/149‑1 (MQ=255) tctGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCg < 8:154373/104‑1 (MQ=255) tctGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCg > 7:154373/1‑104 (MQ=255) tGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCTAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCTGTAACTTCGAGCTGAACGTGAtgctgc < 5:164901/147‑1 (MQ=255) ggCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGc < 6:186677/149‑1 (MQ=255) gCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGcc < 6:154631/149‑1 (MQ=255) gCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGcc > 7:243672/1‑149 (MQ=255) ttCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGc > 3:12702/1‑148 (MQ=255) cGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCaa < 5:128181/148‑1 (MQ=255) aTGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACctgc < 8:85687/148‑1 (MQ=255) gCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAg > 1:116429/1‑148 (MQ=255) ccGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGAt < 2:116429/149‑1 (MQ=255) aCTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCtt > 5:183770/1‑149 (MQ=255) cgatgGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACgcgaccatggcagtggcctccgggatcaccgggttgaccttgcctggcatgatcgaagagcccggctgcagagcttgcagctcgatttcgcccagaccg > 5:63246‑M2/3‑32 (MQ=255) ccATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACgcgaccatggcagtggcctccgggatcaccgggttgaccttgcctggcatgatcgaagagcccggctgcagagcttgcagctcgatttcgcccagaccggccagcgggccggagtt < 2:102479‑M2/148‑117 (MQ=255) ccATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACgcgaccatggcagtggcctccgggatcaccgggttgaccttgcctggcatgatcgaagagcccggctgcagagcttgcagctcgatttcgcccagaccggccagcgggccg < 5:95010‑M2/143‑112 (MQ=255) ccATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACgcgaccatggcagtggcctccgggatcaccgggttgaccttgcctggcatgatcgaagagcccggctgcagagcttgcagctcgatttcgcccagaccggccagcgggccg > 6:95010‑M2/1‑32 (MQ=255) ccATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACgcgaccatggcagtggcctccgggatcaccgggttgaccttgcctggcatgatcgaagagcccggctgcagagcttgcagctcgatttcgcccagaccg < 6:63246‑M2/131‑100 (MQ=255) ccATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTg > 3:217088/1‑149 (MQ=255) cATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTgg < 6:222812/149‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGc > 5:94097/1‑149 (MQ=255) tGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGcc < 6:183770/149‑1 (MQ=255) cgccgcCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACa < 8:243672/149‑1 (MQ=255) ccgccCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACaaa < 4:12702/149‑1 (MQ=255) aTTGGCAACGACgcgaccatggcagtggcctccgggatcaccgggttgaccttgcctggcatgatcgaagagcccggctgcagagcttgcagctcgatttcgcccagaccggccagcgggccggagttcatccagcgcagatcgttgg > 1:102479‑M2/1‑12 (MQ=255) ggCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCtt > 4:84527/1‑149 (MQ=255) cAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTc > 4:60321/1‑148 (MQ=255) aaCGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTc > 7:173614/1‑147 (MQ=255) aaCGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTc > 4:145603/1‑147 (MQ=255) cgcgACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTc > 2:77814/1‑148 (MQ=255) | CGCTGGATGAACTCCGGCCCGCTGGCCGGTCTGGGCGAAATCGAGCTGCAAGCTCTGCAGCCGGGCTCTTCGATCATGCCAGGCAAGGTCAACCCGGTGATCCCGGAGGCCACTGCCATGGTCGCCGCCCAAGTGATTGGCAACGACGCGACCATCGCCGTCGCAGGTCAAGCCGGTAACTTCGAGCTGAACGTGATGCTGCCGGTGATCGCCCGCAACCTGCTGGAAAGCATCGAGCTGATGGCCAATGTCAGCCGCTTGCTGGCCGACAAAGCCATCGCCAGCTTCAAGGTC > NC_002947/1090010‑1090303 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |