New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1588596 = | 35 (0.830) | 3 (0.080) | 3/242 | NT | 8.5% | coding (503/876 nt) | PP_1393 | transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 1588641 = | 32 (0.810) | coding (458/876 nt) | PP_1393 | transcriptional regulator |
CAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCATCAGACGCGGCAGCAGC > NC_002947/1588493‑1588787 | cAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCt < 5:182823/149‑1 (MQ=255) cAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCt > 2:191738/1‑149 (MQ=255) cggtggagctgaccacgaccgtgcagcacggggtggatttgcggcgcgagggcttcgatgcggcagtggtctacggcgatgcaccgaaccacgggctgcaGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCa > 8:204483‑M1/101‑149 (MQ=255) aaCCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGccc < 5:135426/149‑1 (MQ=255) aGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTc < 8:3245/149‑1 (MQ=255) gtgtTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGt < 8:238121/148‑1 (MQ=255) tCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGcc < 1:82134/149‑1 (MQ=255) gATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACt < 3:20285/149‑1 (MQ=255) cTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTc > 4:59047/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTcgcg > 2:197831/1‑149 (MQ=255) gCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTcgcg < 1:197831/149‑1 (MQ=255) ccAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCgcgc > 2:260687/1‑149 (MQ=255) ttCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAAt > 7:14881/1‑149 (MQ=255) ccACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCaaa < 1:260687/146‑1 (MQ=255) gctgcAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCg > 1:171194/1‑149 (MQ=255) ccGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTc < 3:59047/149‑1 (MQ=255) cGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTGCCCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTc < 1:191738/149‑1 (MQ=255) gCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTg > 1:252754/1‑149 (MQ=255) cccTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTgg < 8:14881/149‑1 (MQ=255) cccTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTgc > 6:73441/1‑148 (MQ=255) ttCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGt > 1:76175/1‑147 (MQ=255) ttCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGt > 7:60409/1‑147 (MQ=255) tgcaggtgcgcaagctgttcgatgagcagctgacccctgtgtgcgcaccTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCg > 8:204483‑M2/50‑149 (MQ=255) gtgcgcaagctgttcgatgagcagctgacccctgtgtgcgcaccTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACg > 7:87466‑M2/45‑149 (MQ=255) cgcaagctgttcgatgagcagctgacccctgtgtgcgcaccTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTcc < 8:87466‑M2/108‑1 (MQ=255) GCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCAGCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGGCAGCTCCACCGGTACGTCCg > 6:22877‑M1/1‑149 (MQ=255) CACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCgg > 3:239269‑M1/1‑149 (MQ=255) ACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCggg > 2:76175‑M1/1‑149 (MQ=255) gctgctCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGtgcctgc > 3:174150/1‑149 (MQ=255) ctgctCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTc < 7:158169/109‑1 (MQ=255) ctgctCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTc > 8:158169/1‑109 (MQ=255) gctCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGtgcctgcccc > 5:154433/1‑147 (MQ=255) gctCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCa > 1:229817/1‑148 (MQ=255) ctCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACt > 2:219802/1‑149 (MQ=255) aTCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCAc > 1:8240/1‑117 (MQ=255) aTCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCAc < 2:8240/117‑1 (MQ=255) aTCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCa > 6:92359/1‑149 (MQ=255) aTCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCa < 2:171194/149‑1 (MQ=255) aTCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGAGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTcc > 3:4586/1‑148 (MQ=255) tCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCAt < 2:252754/149‑1 (MQ=255) aaCAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCCCTCCAt > 1:134120/1‑146 (MQ=255) gCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCATCAGAcgc < 6:114871/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCACCTGCAGCCGGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCATCAGAcgcg < 3:136381/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCGGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCATCAGAcgcg > 7:93594/1‑149 (MQ=255) ccTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCATCAGACGCGGCagcagc < 4:174150‑M2/147‑1 (MQ=255) | CAACCACAACCGCCAGTCGTGTTCATCCCGCGAGGGATGCAGCAGCATGTGCCTGGCCAGGTCTTCCACCTGCTGCAACGGCACCGGCCCTTCACGCAGTGACGGTGCGCACACAGGGGTCAGCTGCTCATCGAACAGCTTGCGCACCTGCAGCCCGTGGTTCGGTGCATCGCCGTAGACCACTG‑CCGCATCGAAGCCCTCGCGCCGCAAATCCACCCCGTGCTGCACGGTCGTGGTCAGCTCCACCGGTACGTCCGGGCGCAGTGCCTGCCACTCCATCAGACGCGGCAGCAGC > NC_002947/1588493‑1588787 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |