New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2320096 | 41 (0.970) | 4 (0.100) | 4/250 | NT | 8.6% | coding (1109/1296 nt) | PP_2040 | MFS transporter |
? | NC_002947 | = 2320133 | 45 (1.100) | coding (1146/1296 nt) | PP_2040 | MFS transporter |
CTCCGTGGGGCCTGCCATGCTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTGGGCACGGCTGCGCCTG > NC_002947/2319995‑2320272 | cTCCGTGGGGCCTGCCATGCTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGcac‑a > 3:98849/1‑149 (MQ=255) cGTGGGGCCTGCCATGCTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCac‑ac < 8:83627/147‑1 (MQ=255) tGCCATGCTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTg > 7:130564/1‑149 (MQ=255) gCCATGCTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTgg > 4:221009/1‑149 (MQ=255) cATGCTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGc > 5:251996/1‑148 (MQ=255) cTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAgg < 1:50042/148‑1 (MQ=255) cTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAgg < 8:130564/148‑1 (MQ=255) ggCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGtt > 7:35325/1‑149 (MQ=255) ggAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTc < 4:148291/149‑1 (MQ=255) gTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTgg > 8:202833/1‑149 (MQ=255) aCGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGtgtg < 3:221009/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTg > 6:137550/1‑133 (MQ=255) aGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTg < 8:137450/149‑1 (MQ=255) aGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTg < 6:251996/149‑1 (MQ=255) gcgcGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTgg > 5:96705/1‑149 (MQ=255) gcggcgGCATTCTGGCGATCGACAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTgg < 5:133252/147‑1 (MQ=255) gcggcgGCATTCTGGCGATCGACAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTgg > 6:133252/1‑147 (MQ=255) cggcggCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGGCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTGACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGa < 4:150763/149‑1 (MQ=255) cggcATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTg > 2:34041/1‑149 (MQ=255) cggcATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTg < 8:35325/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCACGACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCgg < 1:208999/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCggg < 1:34041/149‑1 (MQ=255) aaCGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGGTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGc < 5:127706/149‑1 (MQ=255) ccTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGAc > 7:23721/1‑149 (MQ=255) ccTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGAc > 7:190151/1‑149 (MQ=255) ccTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGAGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGAc > 1:212926/1‑149 (MQ=255) ggCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTg < 5:252393/130‑1 (MQ=255) ggCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTg > 6:248429/1‑130 (MQ=255) ggCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTg > 6:252393/1‑130 (MQ=255) ggCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTg < 5:248429/130‑1 (MQ=255) ggCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAAcc > 7:72540/1‑149 (MQ=255) cTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCg < 8:23721/149‑1 (MQ=255) tCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGgccgacagcccggccaacgaggcgataccgttgccgatcgccagaatgccgccgcgctgcccgctgggcgtgaactccgccagcatggcaggcccaacggagtacat < 8:170815‑M2/149‑108 (MQ=255) tCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCg < 2:204296/135‑1 (MQ=255) tCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCg > 1:204296/1‑135 (MQ=255) gCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGgccgacagcccggccaacgaggcgataccgttgccgatcgccagaatgccgccgcgctgcccgctgggcgtgaactccgccagcatggcaggccccacggagtacatcac < 6:144752‑M2/149‑111 (MQ=255) cGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGgccgacagcccggccaacgaggcgataccgttgccgatcgccagaatgccgccgcgctgcccgctgggcgtgaactccgccagcatggcaggccccacggagtacatcaccagc > 5:144752‑M2/1‑35 (MQ=255) cGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTg < 6:96705/149‑1 (MQ=255) ggtggtCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTgg < 7:202833/149‑1 (MQ=255) cGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTgg < 4:98849/149‑1 (MQ=255) ggTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTggg < 2:212926/149‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTGGGCACGGc > 6:87258/1‑149 (MQ=255) tGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTGGGCACGGCt > 7:11312/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGCAAACCCGGAAACGTCTGGTGCAGGTGGGCACGGCTgcgc > 6:3019/1‑149 (MQ=255) gcgatctccggggccgggCTC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGTTTGCCGGGCTGATCTGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAAGCCGGCAACGTGTGGTGCAGGTGGGCACGGCTgcgc < 6:182887/141‑1 (MQ=255) ggCGCCGGGgccgacagcccggccaacgaggcgataccgttgccgatcgccagaatgccgccgcgatgactgctgggcgtgaactccgccagcatggcaggccccacggagtacatcaccagcgccagcccaccgctgaacgtgaggct > 7:170815‑M2/1‑9 (MQ=255) ggCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCg < 7:96458/113‑1 (MQ=255) ggCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCg > 8:96458/1‑113 (MQ=255) ggCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTGGGCACGGCTgc < 1:222316/143‑1 (MQ=255) ggCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTGGGCACGGCTgc > 2:222316/1‑143 (MQ=255) cggggccgggCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGCTTTTCTGGTCTGCGGCGCGGTGCTCGTGATTGCCGCGCTGATCGGGCAGCCCTGGATGGACACGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTGGGCACGGATgcgc > 5:182887/1‑140 (MQ=255) | CTCCGTGGGGCCTGCCATGCTGGCGGAGTTCACGCCCAGCGGGCAGCGCGGCGGCATTCTGGCGATCGGCAACGGTATCGCCTCGTTGGCCGGGCTGTCGGCACCGGTGGTCACCGGTTTGCTGGTGCAGGGCGCCGGGGCCGGGCAC‑ACGGCAGGGTTTGGCCAGGGTTTTCTGGTGTGCGGCGCGGTGCTGGTGATTGCCGGGCTGATCGGGCTGGCCTGGATGGACCCGCAGAAAACCCGGCAACGTCTGGTGCAGGTGGGCACGGCTGCGCCTG > NC_002947/2319995‑2320272 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |