New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3018179 | 38 (0.900) | 4 (0.100) | 4/242 | NT | 10.9% | coding (2102/2283 nt) | bcsB | cellulose synthase and translocator subunit |
? | NC_002947 | = 3018219 | 30 (0.760) | coding (2142/2283 nt) | bcsB | cellulose synthase and translocator subunit |
CGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTGCGCTGGGCAGGCAAGCGCCGCTTGGGTGAGGCGGGGTGATGATG > NC_002947/3018075‑3018365 | cgacagcgaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggc < 2:29193‑M2/149‑5 (MQ=255) gacagcgaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggct > 4:173841‑M2/1‑144 (MQ=255) gcgaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGgctgctg < 3:185249/149‑1 (MQ=255) gcgaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGgctgctg > 7:239163/1‑149 (MQ=255) gaTTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGgctgctgct > 3:79224/1‑149 (MQ=255) aaTTGCTGAGCGACATGCTTGTCGATGTAGGCAAGCTCTATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCTTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTc < 2:207369/148‑1 (MQ=255) tgcGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGTGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTg > 7:250505/1‑149 (MQ=255) cgcgACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGt < 6:41091/148‑1 (MQ=255) gACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGa < 1:29193/149‑1 (MQ=255) aTGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGa < 8:191158/146‑1 (MQ=255) aTGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGa > 7:191158/1‑146 (MQ=255) cTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGTCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATTGTGgctgctgct < 6:70693/125‑1 (MQ=255) cTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATTGTGgctgctgct > 5:70693/1‑125 (MQ=255) ttGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGTGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCt < 8:250505/149‑1 (MQ=255) ggCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTgg < 4:87277/148‑1 (MQ=255) ggCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTgg > 3:87277/1‑148 (MQ=255) ggCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGc > 4:227918/1‑149 (MQ=255) cAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCgg > 6:22963/1‑149 (MQ=255) aaGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGt < 5:22963/149‑1 (MQ=255) gTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGt > 6:95558/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTCGTTAACGCTGTTACGCAGCAGGGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGATCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGttt < 7:112602/148‑1 (MQ=255) tCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCgtggt > 8:49675/1‑149 (MQ=255) cGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCgtggt < 3:227918/148‑1 (MQ=255) ggTAAGGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCCCCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCgtggtg < 8:239163/148‑1 (MQ=255) tGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCt < 6:191659/128‑1 (MQ=255) tGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCt > 5:191659/1‑128 (MQ=255) gcagcaGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCttg < 5:95558/149‑1 (MQ=255) gcagcaGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCttg > 7:254150/1‑149 (MQ=255) gcagTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCttgttg > 6:267051/1‑149 (MQ=255) agTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTGGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTtgtg < 8:161332/149‑1 (MQ=255) gTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggctgctcacgccactgctgcgtaacagcgttaccgaacccgccaccgcatcgagcttgcctacatcgccaagcatgtcgcgcagcaatgcg < 5:266358‑M2/149‑94 (MQ=255) ggCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGc < 8:254150/148‑1 (MQ=255) gCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCg < 3:24727/148‑1 (MQ=255) gTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggctgctcacgccactgctgcgtaacagcgttaccgaacccgccaccgcatcgagcttgcctacatcgccaagcatgtcgcgcagcaatgcgtaatc < 5:72585‑M2/149‑99 (MQ=255) tGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggctgctcacgccactgctgcgtaacagcgttaccgaacccgccaccgcatcgagcttgcctacatcgccaagcatgtcgcgcagcaatgcgtaatcg < 5:277343‑M2/149‑100 (MQ=255) aGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTGCGCTgg < 5:37893/149‑1 (MQ=255) cgtcgGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGtggctgctcacgccactgctgcgtaacagcgttaccgaacccgccaccgcatcgagcttgcctacatcgccaagcatgtcgcgcagcaatgcgtaatcgctgtcgctgttg > 6:72585‑M2/1‑37 (MQ=255) ctTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTGCGCTGGGCAGGCAATCGCCGCTTgg > 8:190146/1‑149 (MQ=255) ctTCGTGGGCGCGCTGCCAGGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCGGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTGCGCTGGGCAGGCAAGCGCCGCTTg < 6:269779/148‑1 (MQ=255) gggCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTgcgc > 5:68954/1‑121 (MQ=255) gggCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTgcgc < 6:68954/121‑1 (MQ=255) tggtggCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTGCGCTGGGCAGGCAAGCGCCGCTTGGGTGAGGCGGGGTGatgatg < 5:267051/149‑1 (MQ=255) | CGACAGCGATTACGCATTGCTGCGCGACATGCTTGGCGATGTAGGCAAGCTCGATGCGGTGGCGGGTTCGGTAACGCTGTTACGCAGCAGTGGCGTGAGCAGCCAGTTCGTCGGCGAGCACTACTTCGTGGGCGCGCTGCCATGGTGGCTGCTGCTGTGGTTCCACTTGTCCGAGCACCCTGTGTTGCTGGCGGTGATCGCGGCTGTTTGCGTGGTGCTGTTCGCCTTCTTGTTGTGGCGGGCACTGCGCTGGGCAGGCAAGCGCCGCTTGGGTGAGGCGGGGTGATGATG > NC_002947/3018075‑3018365 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |