New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3751094 | 44 (1.040) | 3 (0.070) | 3/248 | NT | 7.2% | coding (2789/2823 nt) | PP_3316 | chaperone‑associated ATPase |
? | NC_002947 | = 3751175 | 35 (0.860) | coding (2708/2823 nt) | PP_3316 | chaperone‑associated ATPase |
ACGAGAAACCGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAGTGTCTCGTCGAACGTCAGCGTCACGCCCTGGCTC > NC_002947/3751031‑3751321 | aCGAGAAACCGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCcgcc < 3:66123‑M2/149‑5 (MQ=255) gagaAACCGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGa < 4:66123/149‑1 (MQ=255) gagaAACCGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGa < 4:98118/149‑1 (MQ=255) gaAACCGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAg > 4:262247/1‑148 (MQ=255) aCCGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTAGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCAtt > 5:38294/1‑149 (MQ=255) ccGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGTGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCc > 6:124409‑M2/1‑137 (MQ=255) ccGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGTGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCc < 5:124409‑M2/138‑2 (MQ=255) ccTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTg < 7:97717/149‑1 (MQ=255) cTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGcc > 3:211251/1‑149 (MQ=255) cgcTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGtc < 5:18230/149‑1 (MQ=255) ttCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTcc < 3:41989/149‑1 (MQ=255) aTTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCAc > 4:716/1‑125 (MQ=255) aTTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCAc < 3:716/125‑1 (MQ=255) gCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGc < 6:38294/149‑1 (MQ=255) ctTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCcgccggccaaagagctcgacagtgaaaatgcgtgaagcgcaggccgaaggctgcg < 5:262983‑M2/148‑56 (MQ=255) ctTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCcgccggccaaagagctcgacagtgaaaatgcgtgaagcgcaggccgaaggctgcg > 6:262983‑M2/1‑93 (MQ=255) tttGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTg > 8:92684/1‑148 (MQ=255) gCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTc < 6:84053/139‑1 (MQ=255) gCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTc > 5:84053/1‑139 (MQ=255) ccGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCcgccggccaaagagctcgacagtgaaaatgcgtgaagcgcaggccgaaggctgcggtttctc < 6:58972‑M2/149‑63 (MQ=255) ccGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAg > 4:219536/1‑136 (MQ=255) ccGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAg < 3:219536/136‑1 (MQ=255) ccGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTcg > 8:102638/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTcgc < 7:92684/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCAc > 7:77526/1‑149 (MQ=255) gCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCAcc < 7:102638/149‑1 (MQ=255) ttGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCg > 5:91182/1‑148 (MQ=255) ggcggTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCg > 3:108148/1‑149 (MQ=255) ggcggTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCg < 6:230423/149‑1 (MQ=255) ggTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGc < 8:77526/149‑1 (MQ=255) gAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCg < 1:129389/142‑1 (MQ=255) gAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCg > 2:129389/1‑142 (MQ=255) cccgacccgCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGc > 3:67556/1‑149 (MQ=255) gacccgCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGa < 3:262247/149‑1 (MQ=255) tcgtcCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATc < 6:91182/149‑1 (MQ=255) gtcCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTgc > 2:135265/1‑136 (MQ=255) gtcCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTgc < 1:135265/136‑1 (MQ=255) tcCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGAc > 1:173656/1‑149 (MQ=255) tcCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGAc > 3:10062/1‑149 (MQ=255) aGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAgt < 1:266101/149‑1 (MQ=255) gCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAGTGTCTCGTCGaa > 5:78110/1‑149 (MQ=255) cGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAGTGTCTCGTCGAAc < 6:78110/149‑1 (MQ=255) aTCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAGTGTCTCGTCGAACGt > 3:104492/1‑147 (MQ=255) ccTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGCAGCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAGTGTCTCGTCGAACGTCAGCGt > 1:67001/1‑149 (MQ=255) ccgccgccgAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAGTGTCTCGTCGAACGTCAGCGTCACGCCCTGGc < 2:10646/148‑1 (MQ=255) cgccgccgAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAGTGTCTCGTCGAACGTCAGCGTCACGCCCTGGCTc < 4:67556/149‑1 (MQ=255) | ACGAGAAACCGCAGCCTTCGGCCTGCGCTTCACGCATTTTCACTGTCGAGCTCTTTGGCCGGCGCGGCTTGCCGGCGGTCGAACCCGACCCGCTCCGCCTTGTCGTCCCAGCGCACATGGGCGTGATCACCCTTGCCAATGCCGCCGCCGAGCATTTCACGTGCCAGTGCCGTCTCCAGC‑TCGCTGCGGATCAGTCGCTTGAGCTCGCGGGCACCGAATTCGGGCTTGTAGCCGACTTGCGCCAAGTGATCGACCAGTGTCTCGTCGAACGTCAGCGTCACGCCCTGGCTC > NC_002947/3751031‑3751321 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |