New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4351863 = | 42 (0.990) | 3 (0.070) | 3/250 | NT | 7.6% | coding (342/381 nt) | PP_3824 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4351938 = | 32 (0.780) | coding (267/381 nt) | PP_3824 | hypothetical protein |
ATAAGCAGAGAAAGGAGGACCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTACGCAGTCGGCATAGGCGCGTGGGCTCTTGC > NC_002947/4351791‑4352086 | ataAGCAGAGAAAGGAGGACCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGatat > 3:63089/1‑149 (MQ=255) aaGCAGAGAAAGGAGGACCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGACGCTGCCGCGCTTGTCTATATc > 6:241085/1‑148 (MQ=255) aGCAGAGAAAGGAGGACCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATcca < 3:254729/149‑1 (MQ=255) tcgacggcctgcggctgatcgtaccgcagaaaatcacctcagttgccggcccagcggcgctggtggatATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATccac > 4:18322‑M1/69‑149 (MQ=255) agagAAAGGAGGACCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATccacca < 8:176576/149‑1 (MQ=255) gagaAAGGAGGACCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCGTGTCGAGTGCCACCAg > 8:111440/1‑149 (MQ=255) aggaggACCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGcgccg > 8:109654/1‑149 (MQ=255) aggaCCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTg < 7:237829/149‑1 (MQ=255) gCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTGTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCAc < 5:241085/148‑1 (MQ=255) cTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCt > 7:210351/1‑149 (MQ=255) tCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGa > 7:101015/1‑149 (MQ=255) aaCTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGACGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGAtt > 6:52810/1‑149 (MQ=255) cATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGa > 7:216348/1‑148 (MQ=255) ttGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGAt > 3:97728/1‑147 (MQ=255) ttGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGAt > 5:152151/1‑147 (MQ=255) cGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCg > 6:88671/1‑144 (MQ=255) cGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCg < 5:88671/144‑1 (MQ=255) gtggatatcgacaagcgcggcagcggcagcagcatcaaactgcacgagcggctgaataacttcccgctgcgccttggcgatATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCAACTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTcga > 4:18322‑M2/82‑148 (MQ=255) gcgcACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGc > 5:141381/1‑149 (MQ=255) acaTCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACg < 8:101015/149‑1 (MQ=255) cgacaagcgcggcagcggcagcagcatcaaactgcacgagcggctgaataacttcccgctgcgccttggcgatATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACgctgc > 8:178118‑M2/74‑149 (MQ=255) caagcgcggcagcggcagcagcatcaaactgcacgagcggctgaataacttcccgctgcgccttggcgatATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGctct > 3:99275‑M2/71‑149 (MQ=255) ggCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCg < 6:152151/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCgg > 3:10180/1‑149 (MQ=255) gggAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCgg < 7:109654/149‑1 (MQ=255) aTTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCAcgc < 8:210351/148‑1 (MQ=255) cTCGTGCAGTTTGCTGCTGCGGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCCCCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCaa < 7:111440/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCaa < 6:141381/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCaa < 4:15342/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCaa < 4:10180/149‑1 (MQ=255) gTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATTGGCAAGc < 6:153537/148‑1 (MQ=255) gTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTcc > 7:163777/1‑149 (MQ=255) tttGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCt > 5:14424/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTa < 8:163777/148‑1 (MQ=255) ccgctgccgcGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGc < 8:34353/129‑1 (MQ=255) ccgctgccgcGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGc > 7:34353/1‑129 (MQ=255) ccgctgccgcGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGATGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTACGCAGTCgg < 1:48783/148‑1 (MQ=255) gctgccgcGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTACGCAGTCGGCAt < 1:130608/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTACGCAGTCGGCATAGgcgc > 7:26497/1‑149 (MQ=255) gatATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTACGCAGTCGGCATAGGCGCGTGGGctc < 4:97728‑M2/145‑1 (MQ=255) gatATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTACGCAGTCGGCATAGGCGCGTGGGctc < 2:52585‑M2/145‑1 (MQ=255) atCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTACGCAGTCGGCATAGGCGCGTGGGCTCTTGc < 4:63089/149‑1 (MQ=255) | ATAAGCAGAGAAAGGAGGACCCGTTGCTTCAGATCAACTTCCGGAGATGCATTGCGTTGCCGCAGTGCGCACATCGCCAAGGCGCAGCGGGAAGTTATTCAGCCGCTCGTGCAGTTTGATGCTGCTGCCGCTGCCGCGCTTGTCGATATCCACCAGCGCCGCTGGGCCGGCACCTGAGGTGATTTTCTGCGGTACGATCAGCCGCAGGCCGTCGCCACGCTGCTCTTCGGTCAGCGGGTCACGCGTATCGGCAAGCTTCTCCTTTACGCAGTCGGCATAGGCGCGTGGGCTCTTGC > NC_002947/4351791‑4352086 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |