New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6112131 | 44 (1.040) | 3 (0.080) | 3/238 | NT | 6.8% | intergenic (+127/+86) | PP_5362/PP_5363 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 6112186 | 42 (1.080) | intergenic (+182/+31) | PP_5362/PP_5363 | hypothetical protein/hypothetical protein |
CCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTGGGTGGTGAAT > NC_002947/6112040‑6112334 | ccTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCAc > 4:195105‑M2/1‑147 (MQ=255) tAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCAcgacgcggtt > 3:78584‑M2/1‑138 (MQ=255) aaGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTACATGCCCACGACGCGGTTGc > 8:8463/1‑149 (MQ=255) aGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAACAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGCATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTCCATGCCCACGACGCGGTTGcacct > 7:118785/1‑144 (MQ=255) aGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCAcgac < 8:153343‑M2/136‑5 (MQ=255) aGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCAcgac > 7:153343‑M2/1‑132 (MQ=255) aGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCcact > 2:74915/1‑148 (MQ=255) aCGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATggg > 5:238791/1‑148 (MQ=255) acCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTgcgc > 1:245909/1‑149 (MQ=255) aGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGt > 4:86182/1‑149 (MQ=255) cTTGACCAACACTTTGTCATACAGAAAATCTATGCCGTAACCGCGTCTATGCAATGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCTAGCCTACATCCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTg < 1:203345/149‑1 (MQ=255) gACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCAGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGAc < 2:83207/148‑1 (MQ=255) cAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGTTCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGt < 7:154134/140‑1 (MQ=255) cAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGTTCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGt > 8:154134/1‑140 (MQ=255) aCCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGcccc < 1:74915/149‑1 (MQ=255) cTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCg > 4:244927/1‑147 (MQ=255) tttGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAg > 5:33579/1‑149 (MQ=255) aGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTg < 3:244927/149‑1 (MQ=255) aGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTACATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCAtt < 7:8463/148‑1 (MQ=255) gACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGc < 2:245909/149‑1 (MQ=255) cGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCt > 3:220132/1‑148 (MQ=255) cGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCt > 5:111293/1‑148 (MQ=255) aaaaGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAAc < 6:80448/149‑1 (MQ=255) aaaGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCt < 2:249078/114‑1 (MQ=255) aaaGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCt > 1:249078/1‑114 (MQ=255) tGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACAcc < 3:86182/147‑1 (MQ=255) cgcgTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCAcgacgcggttacggcatagcttttcggtctgacaaagggttggtcaaggctggtgttttcagcgcgtgctcgaagctgacttacaa < 5:34404‑M2/148‑87 (MQ=255) gTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCAcgacgcggttacggcatagcttttcggtctgacaaagggttggtcaaggctggtgttttcagcgcgtgctcgaagctgacttacaaaata > 6:34404‑M2/1‑59 (MQ=255) gCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCAcgacgcggttacggcatagcttttcggtctgacaaagggttggtcaaggctggtgttttcagcgcgtgctcgaagctgacttacaaaataggcag < 8:121060‑M2/148‑96 (MQ=255) gCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGcc > 5:120062/1‑149 (MQ=255) aaGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCtt > 6:159551/1‑149 (MQ=255) aaGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCtt < 6:238791/149‑1 (MQ=255) aaatgaaatgTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTtgctgctgc > 6:224464/1‑149 (MQ=255) aaatgaaatgTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTtgctgctg > 1:71690/1‑148 (MQ=255) aaatgaaatgTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCACGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTtgctgctg > 7:112151/1‑148 (MQ=255) aatgaaatgTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTtgctgctg > 5:56948/1‑147 (MQ=255) aatgaaatgTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTtgctgctg < 6:56948/147‑1 (MQ=255) aatgTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACAccc > 6:124426/1‑149 (MQ=255) aatgTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTACCTAACCACACCGCACGCGTGTTCCTGCTGCCTTGCTGCTGCACAccg > 8:247773/1‑148 (MQ=255) aatgTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCACACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACAccc > 2:109009/1‑149 (MQ=255) ttCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAg > 4:19177/1‑149 (MQ=255) ccACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGc > 3:38123/1‑148 (MQ=255) ccACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGc < 4:38123/148‑1 (MQ=255) ccACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCg > 7:44602/1‑149 (MQ=255) cACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGt < 5:159551/149‑1 (MQ=255) aCGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGtt > 1:141968/1‑149 (MQ=255) cGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGtt > 6:198615/1‑148 (MQ=255) gAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAAc < 6:120062/148‑1 (MQ=255) ccTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCt < 5:124426/149‑1 (MQ=255) cATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGGTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTgg < 8:118785/147‑1 (MQ=255) aTGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTGggtg < 5:198615/149‑1 (MQ=255) gaccACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCAGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGGTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTGggttgt < 6:154798/147‑1 (MQ=255) cccACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTGggtggt < 3:19177/148‑1 (MQ=255) ccACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTGGgtggtg > 3:254352/1‑148 (MQ=255) ccACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTGGgtggtg > 1:167777/1‑148 (MQ=255) acgacgCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTGGGTGGTGAAt < 7:241078/149‑1 (MQ=255) | CCTATTTTGTAAGTCAGCTTCGAGCACGCGCTGAAAACACCAGCCTTGACCAACCCTTTGTCAGACCGAAAAGCTATGCCGTAACCGCGTCGAGGCAAGGATCGAAATGAAATGTTCCACGTGGAACTATCCGAGCCTGCATGCCCACGACGCGGTTGCCACTCACTAATGGGAATTTCAGCTGCGCGGTTTGACCGCCCCGCAGTCATTGCCTAACCACACCGCACGCGTGTTCATGCTGCCTTGCTGCTGCACACCCGAAGCGTTGAACGTGCCACTGACCTGGGTGGTGAAT > NC_002947/6112040‑6112334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |