New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 853445 | 47 (0.950) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.5% | coding (950/1083 nt) | prfA | peptide chain release factor 1 |
? | NC_002947 | = 853474 | 42 (0.890) | coding (979/1083 nt) | prfA | peptide chain release factor 1 |
ACCGTGCTCGCGCCATGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACTGATGACTGTCATCGC > NC_002947/853298‑853591 | aCCGTGCTCGCGCCATGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAgggg < 3:235088/149‑1 (MQ=255) ccGTGCTCGCGCCATGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGc < 6:242219/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGCCATGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCgg < 2:171776/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGCGCCATGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCgg < 8:8155/149‑1 (MQ=255) tCGCGCCATGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGa > 5:140773/1‑149 (MQ=255) aTGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCa > 2:241574/1‑149 (MQ=255) aTGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCa < 5:140201/149‑1 (MQ=255) tCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCAcc < 8:55708/148‑1 (MQ=255) cTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGc < 6:140773/148‑1 (MQ=255) cTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCa > 5:253183/1‑149 (MQ=255) tCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGTGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATGACCGCATCAAc < 2:95101/147‑1 (MQ=255) tCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAGCCGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAAc < 1:241574/148‑1 (MQ=255) gCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGa > 4:235949/1‑148 (MQ=255) gCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGa < 3:235949/148‑1 (MQ=255) ccAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGAcc > 8:167007‑M2/1‑147 (MQ=255) cAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGAccc < 6:26438‑M2/149‑4 (MQ=255) aaCGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGtcaggttgatgcggtgatcggtcacccgcccctgtgga < 4:37029‑M1/148‑39 (MQ=255) aaCGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTAt < 6:253183/147‑1 (MQ=255) gCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTGAATGGTGGGTTCCGGTGACCGATCCGAG‑CGCATCCGAACCTCCAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACGGCTTCAACCTGACCATGTATTCGTTGgac > 1:70834/1‑149 (MQ=255) cAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGgacg < 5:43899/148‑1 (MQ=255) tGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCa > 2:49958/1‑149 (MQ=255) gCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGtt < 8:106095/134‑1 (MQ=255) gCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGtt > 7:106095/1‑134 (MQ=255) cgcAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGt > 8:212498/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGa > 3:78460/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGCGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAc‑g > 7:154480/1‑149 (MQ=255) cTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGtcaggttgatgcggtgatcggtcacccgcccctgt < 6:309926‑M1/112‑36 (MQ=255) cTTGCAAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGtcaggttgatgcggtgatcggtcacccgcccctgt > 5:309926‑M1/1‑77 (MQ=255) gCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGt > 6:169716/1‑149 (MQ=255) cAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGtt < 7:297657/114‑1 (MQ=255) cAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGtt > 8:297657/1‑114 (MQ=255) cAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGa < 2:70834/149‑1 (MQ=255) cAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCCGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGa < 5:182811/149‑1 (MQ=255) cAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCg > 1:45011/1‑103 (MQ=255) cAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCg < 2:45011/103‑1 (MQ=255) tg‑ctgGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGctgctg < 8:281852/149‑1 (MQ=255) gggTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATTAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGaa > 8:194847/1‑148 (MQ=255) ttCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATAcc < 7:212498/149‑1 (MQ=255) ttCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATAc > 2:31106/1‑148 (MQ=255) cGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAg < 4:78460/148‑1 (MQ=255) ggTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGc < 6:174395/149‑1 (MQ=255) gTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGACTGCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGc < 1:47242/149‑1 (MQ=255) cGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTg < 8:154480/148‑1 (MQ=255) gAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGgc > 4:303322/1‑149 (MQ=255) cGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTggg < 1:49958/149‑1 (MQ=255) aCCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGa > 1:273344/1‑149 (MQ=255) tACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACt > 6:4381/1‑148 (MQ=255) aCAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGa > 6:260267/1‑124 (MQ=255) aCAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGa < 5:260267/124‑1 (MQ=255) cAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATTAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACtg < 7:194847/147‑1 (MQ=255) cAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACtga < 3:303322/148‑1 (MQ=255) cAATNATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACtgat > 5:87372/1‑149 (MQ=255) ttATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACTGATGAc > 8:270699/1‑149 (MQ=255) tCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGAccctgtggataattgtaggtgcggatgcgctcggagcggtcaccggaacccaccagcagcttgcgctcactggcaagggcgttctgcgcggcactggtctgcatgtcgtt < 4:37029‑M2/148‑111 (MQ=255) tCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACTGATGACTg < 2:273344/148‑1 (MQ=255) cacaGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGAt > 7:99270/1‑116 (MQ=255) cacaGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGAt < 8:99270/116‑1 (MQ=255) acaGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGAccctgtggataattgtaggtgcggatgcgctcggagcggtcaccggaacccaccagcagcttgcgctcacttgcaag > 5:309926‑M2/1‑35 (MQ=255) acaGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGAccctgtggataattgtaggtgcggatgcgctcggagcggtcaccggaacccaccagcagcttgcgctcactggcaag < 6:309926‑M2/112‑78 (MQ=255) caGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACTGATGACTGTCATc > 8:175372/1‑149 (MQ=255) gggtcaggttgatgcggtgatcggtcacccgcccctgtggataattgtaggtgcggatgcgctcggagcggtcaccggaacccaccagcagcttgcgctcactggcaagggcgttctgcgcggcactggtctgcatgtcgttcagcttg < 6:26438‑M1/149‑147 (MQ=255) ggtcaggttgatgcggtgatcggtcacccgcccctgtggataattgtaggtgcggatgcgctcggagcggtcaccggaacccaccagcagcttgcgctcactggcaagggcgttctgcgcggcactggtctgcatgtcgttcagcttgg > 8:167007‑M1/1‑2 (MQ=255) | ACCGTGCTCGCGCCATGTCCTGGCTGTCGGCCAAGCTGAACGACATGCAGACCAGTGCCGCGCAGAACGCCCTTGCCAGTGAGCGCAAGCTG‑CTGGTGGGTTCCGGTGACCGCTCCGAG‑CGCATCCGCACCTACAATTATCCACAGGGGCGGGTGACCGATCACCGCATCAACCTGACCCTGTATTCGTTGGACGACATCCTCAGCGGTGGCGTAGAC‑GCGGTGATCGAACCGCTGCTGGCCGAATACCAGGCCGATCAACTGGCCGCCTTGGGGGACTGATGACTGTCATCGC > NC_002947/853298‑853591 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |