New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 958380 = | 37 (0.750) | 4 (0.090) | 4/230 | NT | 11.4% | intergenic (+27/‑166) | ykgJ/PP_0820 | ferredoxin/acetyltransferase |
? | NC_002947 | 958419 = | 29 (0.650) | intergenic (+66/‑127) | ykgJ/PP_0820 | ferredoxin/acetyltransferase |
GGAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAA > NC_002947/958233‑958528 | ggAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAtg < 6:244490/149‑1 (MQ=255) aaactgcggggtggggtcacgccggatctcctgtccattgctggggagatgacagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcatcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctacctg < 4:157889‑M1/2‑1 (MQ=255) gAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAtgt < 5:121431/149‑1 (MQ=255) gAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAtgt < 3:70708/149‑1 (MQ=255) ctgcggggtggggtcacgccggatctcctgtccattgctggggagatgacagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTgg > 8:27874‑M1/145‑149 (MQ=255) ggtggggtgCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGTTGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGa < 7:119922/149‑1 (MQ=255) gtggggtgCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAtgt < 4:289574/145‑1 (MQ=255) gtggggtgCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAAtgt > 3:289574/1‑145 (MQ=255) ggggtggggtcacgccggatctcctgtccattgctggggagatgacagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTGGAAGc > 3:288196‑M1/141‑149 (MQ=255) tAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCtttt < 5:165261/149‑1 (MQ=255) aaCCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTg > 8:206865/1‑149 (MQ=255) ccGAGCTGTGATGATGCGCGGGGGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGa > 7:198878/1‑149 (MQ=255) ccggatctcctgtccattgctggggagatgacagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTgg > 5:111923‑M1/127‑131 (MQ=255) ccggatctcctgtccattgctggggagatgacagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTgg < 6:111923‑M1/5‑1 (MQ=255) cTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCgg > 6:165035/1‑149 (MQ=255) tgatgaTGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGTGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGc > 8:3701/1‑149 (MQ=255) tcctgtccattgctggggagatgacagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctacct < 1:174774‑M1/1‑1 (MQ=255) tcctgtccattgctggggagatgacagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctacct > 2:174774‑M1/120‑120 (MQ=255) atgatgCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGcc < 7:299291/148‑1 (MQ=255) tgtccattgctggggagatgatagtttaacgtcaagtgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctacctgtg < 4:137037‑M1/4‑1 (MQ=255) atgCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCt < 2:271192/148‑1 (MQ=255) gcgggcggCGTATGGTTTGCCGGCGCTGAACCCGCCAGAGGCCTACGATCCGCTTTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCcac < 8:887/149‑1 (MQ=255) gcgggcggCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCca > 5:33388/1‑148 (MQ=255) ggggggCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAg < 8:198878/149‑1 (MQ=255) ggTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTgg > 2:3929/1‑103 (MQ=255) gTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCaa < 1:171594/148‑1 (MQ=255) gTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCaa < 2:182535/148‑1 (MQ=255) tttGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAgg < 5:165035/149‑1 (MQ=255) gccgcTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTg < 5:258413/149‑1 (MQ=255) ccccGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtgg > 8:98272/1‑149 (MQ=255) cccGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtggt > 3:202882/1‑149 (MQ=255) tgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGGGGGGCCGCTTCca < 5:253204‑M1/37‑1 (MQ=255) tgcagggttcaggcatctcgggcagctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCca > 6:253204‑M1/81‑117 (MQ=255) gCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCg > 6:132393/1‑149 (MQ=255) cGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCg > 1:132625/1‑112 (MQ=255) cGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCg < 2:132625/112‑1 (MQ=255) gCCGGATTGGCCGGATGAAGGGGCTGAGGTGGCCAGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGCTCAAAGTGGAAGCGGCCTTTTGCGAcgccg > 2:32191/1‑87 (MQ=255) cGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCt < 6:33388/149‑1 (MQ=255) gCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTg > 3:120928/1‑149 (MQ=255) cATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtggt < 2:188508/127‑1 (MQ=255) cATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTgtggt > 1:188508/1‑127 (MQ=255) ctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTc < 6:232229‑M1/35‑1 (MQ=255) ctttgcagcccgtcgccggcaggttcaccacaggccaggagccttgcacgctaccTGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTc > 5:232229‑M1/56‑90 (MQ=255) atgatgGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGccc < 4:202882/149‑1 (MQ=255) atgGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCga < 4:120928/148‑1 (MQ=255) tggCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGAt < 7:3701/147‑1 (MQ=255) aGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGaa < 7:206865/149‑1 (MQ=255) tGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCAc > 3:157889/1‑149 (MQ=255) aaGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTg > 2:296341/1‑144 (MQ=255) aaGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTg < 1:296341/144‑1 (MQ=255) aaGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACtt < 5:132393/149‑1 (MQ=255) aGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGCCGACGGGATGCAAAGCTGCCCGAGATGCATGAACCCTGAACTTGACGTTAAACt > 4:233337/1‑149 (MQ=255) gTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGAc > 4:54573/1‑140 (MQ=255) gTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGAc < 3:54573/140‑1 (MQ=255) gTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCAtctc < 7:98272/149‑1 (MQ=255) gTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGTGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTccc > 7:62480/1‑148 (MQ=255) aaTGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAg > 6:287851/1‑148 (MQ=255) TGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCaa > 5:287851‑M1/1‑149 (MQ=255) TGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCaa < 5:186611‑M1/149‑1 (MQ=255) | GGAGGGTGGGGTGCATAACCCGAGCTGTGATGATGCGCGGGCGGCGTATGGTTTGCCGCCGCTGACCCCGCCAGAGGCCAACGAGCCGCATTGGCCGGATGATGGGGCTGAGGTGGCCTGAAGTATCGATCAGTCTGACGTGGTCAATGTGGAAGCGGCCTTTTGCGACGCGGGGCCGCTTCCACAGGTAGCGTGCAAGGCTCCTGGCCTGTGGTGAACCTGCCGGCGACGGGCTGCAAAGCTGCCCGAGATGCCTGAACCCTGCACTTGACGTTAAACTGTCATCTCCCCAGCAA > NC_002947/958233‑958528 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |