New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 990894 = | 50 (1.010) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 8.5% | coding (775/1143 nt) | PP_0856 | lipoprotein |
? | NC_002947 | 990935 = | 38 (0.810) | coding (816/1143 nt) | PP_0856 | lipoprotein |
ACGGTGTGCCGGTGTGGGAGAGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAAC > NC_002947/990748‑991037 | tgaacacttcaggggcggtcaactggcggcgagccatgctgtcgttgctccacagggcactggaagagcgctcatccacactttccacggtacccgaggcttcgctgacgtagacgttaccgaagccctgggcgacacccacatagCTg < 3:213123‑M1/3‑1 (MQ=255) gtgtGCCGGTGTGGGAGAGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGaa < 7:16700/149‑1 (MQ=255) tgtgCCGGTGTGGGAGAGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGaaa < 8:223341/149‑1 (MQ=255) tgtgCCGGTGTGGGAGAGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGaaa < 3:233679/149‑1 (MQ=255) aggggcggtcaactggcggcgagccatgctgtcgttgctccacagggcactggaagagcgctcatccacactttccacggtacccgaggcttcgctgacgtagacgttaccgaagccctgggcgacacccacatagCTGGAAAGCGGc‑c < 7:172895‑M1/13‑1 (MQ=255) tgtgGGAGAGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑cgc > 1:201014/1‑149 (MQ=255) tgGGACAGCCGCGCGGCCATCCCGACCGGCCGTTCCGACCGGCCCCGTGTGGGTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGCACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGa < 6:199530/149‑1 (MQ=255) ggAGAGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGc > 6:238467/1‑149 (MQ=255) gagaGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAg > 4:286790/1‑137 (MQ=255) gagaGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAg < 3:286790/137‑1 (MQ=255) gagaGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCt > 3:97288/1‑149 (MQ=255) cATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATg < 1:162193/149‑1 (MQ=255) aTCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCtgt < 7:119180/136‑1 (MQ=255) aTCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCtgt > 8:119180/1‑136 (MQ=255) cGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGcctggacct > 4:308310/1‑112 (MQ=255) cGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGcctggacct < 3:308310/112‑1 (MQ=255) cGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGAt > 2:312422/1‑143 (MQ=255) cGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGAt < 1:312422/143‑1 (MQ=255) cGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTcc < 3:283637/149‑1 (MQ=255) tcgttgctccacagggcactggaagagcgctcatccacactttccacggtacccgaggcttcgctgacgtagacgttaccgaagccctgggcgacacccacatagCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCt > 8:172895‑M1/106‑148 (MQ=255) gCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTAt > 4:126401/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGgtg > 6:3458/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGgtg > 4:30459/1‑149 (MQ=255) cTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGCTCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCg < 1:60398/149‑1 (MQ=255) gACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGcc < 2:201014/147‑1 (MQ=255) aCCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGTCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAg < 1:210815/149‑1 (MQ=255) gaagagcgctcatccacactttccacggtacccgaggcttcgctgacgtagacgttaccgaagccctgggcgacacccacatagCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTAt < 7:94136‑M1/45‑1 (MQ=255) gaagagcgctcatccacactttccacggtacccgaggcttcgctgacgtagacgttaccgaagccctgggcgacacccacatagCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTAt > 8:94136‑M1/85‑129 (MQ=255) gTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCg < 4:97288/148‑1 (MQ=255) atCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGt > 3:45052/1‑149 (MQ=255) gACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTa > 4:69073/1‑149 (MQ=255) aCGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTAc < 5:3458/149‑1 (MQ=255) ggcTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAg > 4:79602/1‑149 (MQ=255) ttgttgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCg > 8:27909/1‑148 (MQ=255) gttgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGaa < 3:69073/148‑1 (MQ=255) gttgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAg > 4:162175/1‑149 (MQ=255) ttgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAg < 1:125846/143‑1 (MQ=255) tgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGt < 1:167077/133‑1 (MQ=255) tgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGt > 2:167077/1‑133 (MQ=255) cTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCt < 6:256550/148‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTcc < 8:39066/93‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTcc > 7:39066/1‑93 (MQ=255) tCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCggg > 8:165851/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGCTGACGTAGACGTTACCGAAGccctggg < 5:238467/149‑6 (MQ=38) gtACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTg > 8:263428/1‑149 (MQ=255) gTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAgtg > 7:120246/1‑149 (MQ=255) gTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGa < 4:45052/149‑1 (MQ=255) tCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGAt < 7:263428/149‑1 (MQ=255) tCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGAt < 3:144646/149‑1 (MQ=255) tCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGAt > 6:9845/1‑149 (MQ=255) gggCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCa > 7:131723/1‑149 (MQ=255) gtgtAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGcc < 3:162175/149‑1 (MQ=255) tAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCtg > 4:213123/1‑149 (MQ=255) tAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCt < 3:79602/148‑1 (MQ=255) ctggacctggaAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTc < 7:49087/98‑1 (MQ=255) ctggacctggaAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTc > 8:49087/1‑98 (MQ=255) ctggacctggaAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTTGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCaa > 4:191007/1‑149 (MQ=255) gacctggaAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAAc < 8:120246/147‑1 (MQ=255) | ACGGTGTGCCGGTGTGGGAGAGCCGCGTGGCCATCCCGAAGGGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAAC > NC_002947/990748‑991037 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |