New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 990894 = | 50 (1.010) | 4 (0.090) | 4/244 | NT | 8.5% | coding (775/1143 nt) | PP_0856 | lipoprotein |
? | NC_002947 | 990935 = | 38 (0.810) | coding (816/1143 nt) | PP_0856 | lipoprotein |
GGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGTTGACCGCCCCTGAAGTGTTCAGCA > NC_002947/990789‑991083 | tcgttgctccacagggcactggaagagcgctcatccacactttccacggtacccgaggcttcgctgacgtagacgttaccgaagccctgggcgacacccacatagCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCt > 8:172895‑M1/106‑148 (MQ=255) gCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTAt > 4:126401/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGgtg > 4:30459/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGgtg > 6:3458/1‑149 (MQ=255) cTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGCTCGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCg < 1:60398/149‑1 (MQ=255) gACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGcc < 2:201014/147‑1 (MQ=255) aCCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGTCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAg < 1:210815/149‑1 (MQ=255) gaagagcgctcatccacactttccacggtacccgaggcttcgctgacgtagacgttaccgaagccctgggcgacacccacatagCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTAt > 8:94136‑M1/85‑129 (MQ=255) gaagagcgctcatccacactttccacggtacccgaggcttcgctgacgtagacgttaccgaagccctgggcgacacccacatagCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTAt < 7:94136‑M1/45‑1 (MQ=255) gTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCg < 4:97288/148‑1 (MQ=255) atCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGt > 3:45052/1‑149 (MQ=255) gACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTa > 4:69073/1‑149 (MQ=255) aCGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTAc < 5:3458/149‑1 (MQ=255) ggcTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAg > 4:79602/1‑149 (MQ=255) ttgttgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCg > 8:27909/1‑148 (MQ=255) gttgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGaa < 3:69073/148‑1 (MQ=255) gttgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAg > 4:162175/1‑149 (MQ=255) ttgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAg < 1:125846/143‑1 (MQ=255) tgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGt > 2:167077/1‑133 (MQ=255) tgCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGt < 1:167077/133‑1 (MQ=255) cTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCt < 6:256550/148‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCggg > 8:165851/1‑149 (MQ=255) tCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGCTGACGTAGACGTTACCGAAGccctggg < 5:238467/149‑6 (MQ=38) gtACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTg > 8:263428/1‑149 (MQ=255) gTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAgtg > 7:120246/1‑149 (MQ=255) gTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGa < 4:45052/149‑1 (MQ=255) tCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGAt < 3:144646/149‑1 (MQ=255) tCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGAt > 6:9845/1‑149 (MQ=255) tCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGAt < 7:263428/149‑1 (MQ=255) gggCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCa > 7:131723/1‑149 (MQ=255) gtgtAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGcc < 3:162175/149‑1 (MQ=255) tAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCtg > 4:213123/1‑149 (MQ=255) tAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCt < 3:79602/148‑1 (MQ=255) ctggacctggaAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTc > 8:49087/1‑98 (MQ=255) ctggacctggaAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTc < 7:49087/98‑1 (MQ=255) ctggacctggaAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTTGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCaa > 4:191007/1‑149 (MQ=255) gacctggaAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAAc < 8:120246/147‑1 (MQ=255) atagctggaagcatcgcgctgccacagctcgcggccgctttccagCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTc > 8:94136‑M2/46‑129 (MQ=255) atagctggaagcatcgcgctgccacagctcgcggccgctttccagCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTc < 7:94136‑M2/84‑1 (MQ=255) agctggaagcatcgcgctgccacagctcgcggccgctttccagCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGa > 8:172895‑M2/44‑148 (MQ=255) GGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTgg < 2:174095‑M1/110‑1 (MQ=255) GGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTgg > 1:174095‑M1/1‑110 (MQ=255) GAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCa > 8:131723‑M1/1‑148 (MQ=255) AAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATgg > 5:9845‑M1/1‑149 (MQ=255) cgcgAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAgtgt < 6:18461/98‑1 (MQ=255) cgcgAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAgtgt > 5:18461/1‑98 (MQ=255) gCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGt > 8:92750/1‑149 (MQ=255) gtgGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAg > 4:129647/1‑120 (MQ=255) gcgcGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGTTGACCGccc < 7:92750/149‑1 (MQ=255) ggccgctttccagCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGTTGACCGCCCCt < 7:172895‑M2/136‑1 (MQ=255) gATGCTTACAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGATGACCGCCCCTg > 7:162398/1‑148 (MQ=255) aTGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGTTGACCGCCCCTGaa < 3:30459/149‑1 (MQ=255) tGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGTTGACCGCCCCTGAAg < 7:27909/149‑1 (MQ=255) cagCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGTTGACCGCCCCTGAAGTGTTCa < 3:213123‑M2/146‑1 (MQ=255) cTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGTTGACCGCCCCTGAAGTGTTcagca < 3:126401/149‑1 (MQ=255) | GGCCGTTCCGAGCTGGACCGTGTGGTTGATATCGACGGCGGCTTGTTGCTGTCTGGTGGTACCCTGTACGTCAGCACCTACCAGGGCCGTGTAGCGGGCCTGGACCTGGAAAGCGGC‑CGCGAGCTGTGGCAGCGCGATGCTTCCAGCTATGTGGGTGTCGCCCAGGGCTTCGGTAACGTCTACGTCAGCGAAGCCTCGGGTACCGTGGAAAGTGTGGATGAGCGCTCTTCCAGTGCCCTGTGGAGCAACGACAGCATGGCTCGCCGCCAGTTGACCGCCCCTGAAGTGTTCAGCA > NC_002947/990789‑991083 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |