New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1531447 | 51 (1.030) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.6% | coding (429/630 nt) | PP_1344 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 1531499 | 36 (0.750) | coding (377/630 nt) | PP_1344 | hypothetical protein |
GGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCGGTTGCAACTGGCTTTCCAGCAGGC > NC_002947/1531301‑1531595 | gggTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTg > 6:165171/1‑149 (MQ=255) tCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAg > 4:174085/1‑149 (MQ=255) ggTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTTCCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAgg < 1:80847/148‑1 (MQ=255) aTGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGgccgc > 7:123939/1‑149 (MQ=255) tGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTGGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGgccgc > 7:292017/1‑148 (MQ=255) gCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCC > 6:213946‑M1/1‑136 (MQ=255) gCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCC < 5:213946‑M1/136‑1 (MQ=255) ccTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCTCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCcaac < 3:219651/149‑1 (MQ=255) ggcggTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGGCCTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCcaacaa < 1:94394/148‑1 (MQ=255) aGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAgcgc > 3:168748/1‑138 (MQ=255) aGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAgcgc < 4:168748/138‑1 (MQ=255) ctctCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAgcg > 6:233306/1‑149 (MQ=255) tctcGGCCGCGCTGTTCGAAAGATCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAgcg > 7:197899/1‑148 (MQ=255) tcGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAg > 6:24109/1‑149 (MQ=255) ccGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCgg < 2:121823/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGGTGGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGc < 7:300053/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGc < 1:142514/149‑1 (MQ=255) tGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGcc > 6:263546/1‑149 (MQ=255) gAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATg > 5:233306‑M2/1‑148 (MQ=255) gAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGACGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCC < 2:83033‑M1/96‑1 (MQ=255) gAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGACGG‑CTGTACCGTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCC > 1:83033‑M1/1‑96 (MQ=255) aaaGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATgg < 5:33007‑M2/149‑3 (MQ=255) gCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCg > 8:292704/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGt < 5:263546/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCattgggcaacccgcctgcgctaccagcagaagcgcttgttggcggccctgcaggccatg > 6:320186‑M1/1‑90 (MQ=255) tCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTc > 6:47983/1‑149 (MQ=255) ggCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCattgggcaacccgcctgcgctaccagcagaagcgcttgttggcggccctgcaggccatg < 5:320186‑M1/147‑60 (MQ=255) ggCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCgg < 7:83785/149‑1 (MQ=255) ggCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCgg < 7:79361/149‑1 (MQ=255) ggCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCg < 8:123939/148‑1 (MQ=255) ggCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCg < 8:197899/148‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGgccgc < 3:204737/93‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGgccgc > 4:204737/1‑93 (MQ=255) aTGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAacca < 5:165171/149‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAacca > 5:93025/1‑149 (MQ=255) cccGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAaccac > 6:188168/1‑147 (MQ=255) cccGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAAccacca < 5:188168/149‑1 (MQ=255) ccGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAg < 5:158468/149‑1 (MQ=255) aCGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGcaaca < 6:93025/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGt < 3:54436/147‑1 (MQ=255) aGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCa < 7:292704/149‑1 (MQ=255) gcggcgG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAg < 4:296534/149‑1 (MQ=255) gcgg‑cTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGAc < 6:33007/149‑1 (MQ=255) tGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCattgggcaacccgcctgcgctaccagcagaagcgcttgttggcggccctgcaggccatgg < 1:87384‑M1/108‑61 (MQ=255) ttGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATgg > 6:70505/1‑147 (MQ=255) aGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCCCCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTc > 6:22279/1‑149 (MQ=255) aGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTc > 3:140306/1‑149 (MQ=255) tGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCgg < 3:174085/149‑1 (MQ=255) gcCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCa < 8:183609/136‑1 (MQ=255) gcCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCa > 7:183609/1‑136 (MQ=255) gcCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCggg > 2:37755/1‑147 (MQ=255) aGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCgg < 5:47983/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCGGtt > 8:90089/1‑149 (MQ=255) ccGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCGGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCGGTTGCa < 5:24109/148‑1 (MQ=255) gAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCGGTTGCAACt > 8:26948/1‑149 (MQ=255) aaTGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTcgc > 4:167021/1‑130 (MQ=255) aaTGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTcgc < 3:167021/130‑1 (MQ=255) tGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCGGTTGCAACTGGc < 5:70505/149‑1 (MQ=255) ttCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCGGTTGCAACTGGCttt > 5:155370/1‑149 (MQ=255) ccATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATggccatggaagcattcggcaacctcaggcgcatcctgtacaaggtaca < 1:87384‑M2/108‑49 (MQ=255) ccATGGCCTCCAGGGCCGCCACCACGCGCTTCGGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGGCGGTAACCACCAGCAACACAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCAGTTGCAACCGGCtgc < 8:292017/147‑3 (MQ=255) cATGGGCTGGAGGGCCGCCAAGAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGGCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACATAGTACGATCGCGCCAGGACGcc < 2:127732/106‑1 (MQ=255) cATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATggccatggaagcattcggcaacctcaggcgcatcctgtacaaggtacagccgccgctggtaccggccaagcgtggcgggcatgcggccga > 6:320186‑M2/1‑59 (MQ=255) cATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATggccatggaagcattcggcaacctcaggcgcatcctgtacaaggtacagccgccgctggtaccggccaagcgtggcgggcatgcggcc < 5:320186‑M2/147‑89 (MQ=255) aaTGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGcc > 1:127732/2‑106 (MQ=255) ccattgggcaacccgcctgcgctaccagcagaagcgcttgttggcggccctgcaggccatggaagcattcggcaacctcaggcgcatcctgtacaaggtacagccgccgctggtaccggccaagcgtggcgggcatgcggccgagcttt < 5:33007‑M1/149‑148 (MQ=255) cattgggcaacccgcctgcgctaccagcagaagcgcttgttggcggccctgcaggccatggaagcattcggcaacctcaggcgcatcctgtacaaggtacagccgccgctggtaccggccaagcgtggcgggcatgcggccgagctttc > 5:233306‑M1/1‑1 (MQ=255) | GGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAAAGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTTGGCCGGTACCAGCGGCGG‑CTGTACCTTGTACAGGATGCGCCTGAGGTTGCCGAATGCTTCCATGGCCTGCAGGGCCGCCAACAAGCGCTTCTGCTGGTAGCGCAGGCGGGTTGCCCAATGGCCGTCGGTAACCACCAGCAACAAAGTACCATCGCGCCAGGACGCCACATGGCAGTGCTCGCGGGCAGCCGGTTGCAACTGGCTTTCCAGCAGGC > NC_002947/1531301‑1531595 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |